cluster # 1322

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Schistosoma mansoni
cluster # 1322 cluster # 1322 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1322#0 length = 980 sequences # 2

consensusID : consensus_1322#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 980
fasta sequence

                              [GTTTTTGTTAAATTTCAAATGAAACTAATCTAGTCGTTGCTTCTTTCTACCTCGTCGTGTGACATCGTTTCGTTCCGCTCCGCTTTTTCTTTTTGAAGGACTTTTATTATTGTCATTTTATATTCAACAGCTATATATAAGAAGACATGTATTTATCTATCTACTTCATTCTGATTCTCCTTAGATCTTTGCTTATTTTTTATTATTTCAATACTCTACAGCTTCAAGACAATGCATTTGTCAATTTATCAATGTAAATTATAAACAGGTTTATATGTGTAAAAAACATACAAGAAAATGACTTCTTTCCCGCCAAACCAATCTTTTAACGAACACGGCGGATAAATTGGAATAGAATGGACCTATGAAACTCCTCATTCTCTTTCTGTCTCTCGTTCCCTCTCACTTTCATACAAGAAAATGACTTCGTTCCCGCTAAACCAATCTTTAAACTAATATGGCGGATAAATTGAAATAGAATGGAAGGATGAAACTCCTCAGTCCCTCTCTCTCCCCCCTCACTTTCAGCATGTTGGTTATTTATTTATTAATTNTTTTGGTGTTTTCTGTATACACATTTTAATGTTCATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATTCGTGTTTTATACATGTCTCCTTTCTATTCATGTATTTCCCTCATTAATAATTACATCATTAAAGGTTTCTCTATTTTTCCCTCTTCTTTTTTTTCTATTATGTATATTAAAAATTCCCCCCTTTTCTTCTCTATTGCTGTTTGTTGTTGTTGTTCTTCTTTTTGGTGTTTTTCTCTTTTTTTTATAGAACAACCAATTAGTATTATGTAAATAATGTGCATAGAAAAGAAGAAAGAATCCTTTGTGTATATTTCTCTTCTTTATGTGGATTTGTTTATATCTATATCTATTCCCTACTTTTATTCTGTTCATCTTTTATTTTCTTTCTTTTCTTTTTTTTATATCAATGATTGATAATAATGTAATA]

[+] EMBL CD082913             [GTTTTTGTTAAATTTCAAATGAAACTAATCTAGTCGTTGCTTCTTTCTACCTCGTCGTGTGACATCGTTTCGTTCCGCTCCGCTTTTTCTTTTTGAAGGACTTTTATTATTGTCATTTTATATTCAACAGCTATATATAAGAAGACATGTATTTATCTATCTACTTCATTCTGATTCTCCTTAGATCTTTGCTTATTTTTTATTATTTCAATACTCTACAGCTTCAAGACAATGCATTTGTCAATTTATCAATGTAAATTATAAACAGGTTTATATGTGTAAAAAACATACAAGAAAATGACTTCTTTCCCGCCAAACCAATCTTTTAACGAACACGGCGGATAAATTGGAATAGAATGGACCTATGAAACTCCTCATTCTCTTTCTGTCTCTCGTTCCCTCTCACTTTCATACAAGAAAATGACTTCGTTCCCGCTAAACCAATCTTTAAACTAATATGGCGGATAAATTGAAATAGAATGGAAGGATGAAACTCCTCAGTCCCTCTCTCTCCCCCCTCACTTTCAGCATGTTGGTTATTTATTTATTAATTNTTTTGGTGTTTTCTGTATACACATTTTAATGTTCATGTGTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD076496             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAACTAATATGGCGGATAAATTGAAATAGAATGGAAGGATGAAACTCCTCAGTCCCTCTCTTTCCCCCCTCACTTTCAGCATGTTGTTTATTTATTTATTAATTTTTTTGGTGTTTTCTGTATACACATTTTAATGTTCATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATTCGTGTTTTATACATGTCTCCTTTCTATTCATGTATTTCCCTCATTAATAATTACATCATTAAAGGTTTCTCTATTTTTCCCTCTTCTTTTTTTTCTATTATGTATATTAAAAATTCCCCCCTTTTCTTCTCTATTGCTGTTTGTTGTTGTTGTTCTTCTTTTTGGTGTTTTTCTCTTTTTTTTATAGAACAACCAATTAGTATTATGTAAATAATGTGCATAGAAAAGAAGAAAGAATCCTTTGTGTATATTTCTCTTCTTTATGTGGATTTGTTTATATCTATATCTATTCCCTACTTTTATTCTGTTCATCTTTTATTTTCTTTCTTTTCTTTTTTTTATATCAATGATTGATAATAATGTAATA]




>consensus_1322#0
GTTTTTGTTAAATTTCAAATGAAACTAATCTAGTCGTTGCTTCTTTCTACCTCGTCGTGT
GACATCGTTTCGTTCCGCTCCGCTTTTTCTTTTTGAAGGACTTTTATTATTGTCATTTTA
TATTCAACAGCTATATATAAGAAGACATGTATTTATCTATCTACTTCATTCTGATTCTCC
TTAGATCTTTGCTTATTTTTTATTATTTCAATACTCTACAGCTTCAAGACAATGCATTTG
TCAATTTATCAATGTAAATTATAAACAGGTTTATATGTGTAAAAAACATACAAGAAAATG
ACTTCTTTCCCGCCAAACCAATCTTTTAACGAACACGGCGGATAAATTGGAATAGAATGG
ACCTATGAAACTCCTCATTCTCTTTCTGTCTCTCGTTCCCTCTCACTTTCATACAAGAAA
ATGACTTCGTTCCCGCTAAACCAATCTTTAAACTAATATGGCGGATAAATTGAAATAGAA
TGGAAGGATGAAACTCCTCAGTCCCTCTCTCTCCCCCCTCACTTTCAGCATGTTGGTTAT
TTATTTATTAATTNTTTTGGTGTTTTCTGTATACACATTTTAATGTTCATGTGTGTGTGT
ATGTGTGTGTATTCGTGTTTTATACATGTCTCCTTTCTATTCATGTATTTCCCTCATTAA
TAATTACATCATTAAAGGTTTCTCTATTTTTCCCTCTTCTTTTTTTTCTATTATGTATAT
TAAAAATTCCCCCCTTTTCTTCTCTATTGCTGTTTGTTGTTGTTGTTCTTCTTTTTGGTG
TTTTTCTCTTTTTTTTATAGAACAACCAATTAGTATTATGTAAATAATGTGCATAGAAAA
GAAGAAAGAATCCTTTGTGTATATTTCTCTTCTTTATGTGGATTTGTTTATATCTATATC
TATTCCCTACTTTTATTCTGTTCATCTTTTATTTTCTTTCTTTTCTTTTTTTTATATCAA
TGATTGATAATAATGTAATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case