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Schistosoma mansoni
cluster # 1350 cluster # 1350       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1350#0 length = 586 sequences # 2  

consensusID : consensus_1350#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 586
fasta sequence
                              [TGACCCTGAGTCACGTGATGACGTTATTGTTTTTAATTCATCTCCTCCCAGCTTTTATGTTACAAATTCAGTAATCGCATATTTCATTCCAGTGGGCATGTCTTGCTGTCTACATACCTGCGAACTACCTTCACTTTTATTTTTTATCACACTAAGACGAATGAGCTGTTGTGAGAAATAGATGTATCAGCGATTGGTGTTAGTATTTTCTTTCCTGTGGATTATTGACAAAAACTCTTGTGCTTCCGGCGACGGATGTTTTGGACTCTTTGAAAAGCTTAAGTGGAACAGAACATTCAGTTTTAACAACAAAGTTTTAACACTCAGACTTGAAGTCACCAATAATCCAGAACATTGGATTGTAAATTATCTGTTTGAGATCTTGGCTCGGGAGAGATTAGGATACACTAAAATAGAGTTTGTTCTAATCGTAGATAGTAACATCAGCAGTTCTCTAAAAAGACTTCAGTGTCCTAATACTCAATGTCTTAAGTTACCTGAAATTCACCTTAACTTACTGCTGTGGTTACCACTTGATGGGAATGTTAAATTCTGGGCAAAACCTTCTTCTGCTACCGACCATGGG]

[+] EMBL CD161914             [TGACCCTGAGTCACGTGATGACGTTATTGTTTTTAATTCATCTCCTCCCAGCTTTTATGTTACAAATTCAGTAATCGCATATTTCATTCCAGTGGGCATGTCTTGCTGTCTACATACCTGCGAACTACCTTCACTTTTATTTTTTATCACACTAAGACGAATGAGCTGTTGTGAGAAATAGATGTATCAGCGATTGGTGTTAGTATTTTCTTTCCTGTGGATTATTGACAAAAACTCTTGTGCTTCCGGCGACGGATGTTTTGGACTCTTTGAAAAGCTTAAGTGGAACAGAACATTCAGTTTTAACAACAAAGTTTTAACACTCAGACTTGAAGTCACCAATAATCCAGAACATTGGATTGTAAATTATCTGTTTGAGATCTTGGCTCGGGAGAGATTAGGATACACTAAAATAGAGTTTGTTCTAATCGTAGATAGTAACATCAGCAGTTCTCTAAAAAGACTTCAGTGTCCTAATACTCAATGTCTTAAGTTACCTGAAATTCACCTTAACTTACTGCTGTGGTTACCACTTGATGGGAATGTTAAATTCTGGGCAAAACCTTCTTCTGCTACCGACCATGGG]
[+] EMBL CD161779             [TGACCCTGAGTCACGTGATGACGTTATTGTTTTTAATTCATCTCCTCCCAGCTTTTATGTTACAAATTCAGTAATCGCGTATTTCATTCCAGTGGGCATGTCTTGCTGTCTACATACCTGCGAACTACCTTCACTTTTATTTTTTATCACACTAAGACGAATGAGCTGTTGTGAGAAATAGATGTATCAGCGATTGGTGTTAGTATTTTCTTTCCTGTGGATTATTGACAAAAACTCTTGTGCTTCCGGCGACGGATGTTTTGGACTCTTTGAAAAGCTTAAGTGGAACAGAACATTCAGTTTTAACAACAAAGTTTTAACACTC                                                                                                                                                                                                                                                                     ]


>consensus_1350#0 TGACCCTGAGTCACGTGATGACGTTATTGTTTTTAATTCATCTCCTCCCAGCTTTTATGT TACAAATTCAGTAATCGCATATTTCATTCCAGTGGGCATGTCTTGCTGTCTACATACCTG CGAACTACCTTCACTTTTATTTTTTATCACACTAAGACGAATGAGCTGTTGTGAGAAATA GATGTATCAGCGATTGGTGTTAGTATTTTCTTTCCTGTGGATTATTGACAAAAACTCTTG TGCTTCCGGCGACGGATGTTTTGGACTCTTTGAAAAGCTTAAGTGGAACAGAACATTCAG TTTTAACAACAAAGTTTTAACACTCAGACTTGAAGTCACCAATAATCCAGAACATTGGAT TGTAAATTATCTGTTTGAGATCTTGGCTCGGGAGAGATTAGGATACACTAAAATAGAGTT TGTTCTAATCGTAGATAGTAACATCAGCAGTTCTCTAAAAAGACTTCAGTGTCCTAATAC TCAATGTCTTAAGTTACCTGAAATTCACCTTAACTTACTGCTGTGGTTACCACTTGATGG GAATGTTAAATTCTGGGCAAAACCTTCTTCTGCTACCGACCATGGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)