Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1351 cluster # 1351       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1351#0 length = 627 sequences # 2  

consensusID : consensus_1351#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 627
fasta sequence
                              [AACATAGGGATTCCAATGGCTTGGAATAGGGTTTTCGTACTCGCAGTGTTGCTTTTTAAATCAACCCTTCAGTATCAACAAGAATTACAGAATAATCAGCGAAATACTATAAAAGACTCAAACTCTTTGAATTCAATTAATGTAACTGAATGTATTGAATTGAAAGATGCTAATTCAAAATTCATTAATCAACAAAATGGAATAAGGAATTCAAGTTCAAGAAATTCAAATTTACCACCATTAAATAGAATTACTGTTATCTCTCAAGATGATTTTCATCAATTATGTGCTCTTCTGGAGTTTCGTGGTTATTTTCTTATTACATATACAAATAATAGTTCAAAAGAGACAATTTGTTATCGGATTCCAATCGATTTAACTGAAAAATATTCTACAAAAGAAAATGAAATTTCTTCCATTTTAGAAAAATCTTCTTTTTTCATGAATTTTAACAACAATACACATAGCAACAATTTATTGGATAGTAACAAATCTAAAATATCATATATTGAACCAGATAATTTAATTATAATCACAACCTAATTCAACATGTTGTAATAATTTTTTAAAGATGTTTTACACTTCCATTTATTTTTAGTGGAAATGAAAATAGTTTAATAAAAAATT]

[+] EMBL BF936462             [AACATAGGGATTCCAATGGCTTGGAATAGGGTTTTCGTACTCGCAGTGTTGCTTTTTAAATCAACCCTTCAGTATCAACAAGAATTACAGAATAATCAGCGAAATACTATAAAAGACTCAAACTCTTTGAATTCAATTAATGTAACTGAATGTATTGAATTGAAAGATGCTAATTCAAAATTCATTAATCAACAAAATGGAATAAGGAATTCAAGTTCAAGAAATTCAAATTTACCACCATTAAATAGAATTACTGTTATCTCTCAAGATGATTTTCATCAATTATGTGCTCTTCTGGAGTTTCGTGGTTATTTTCTTATTACATATACAAATAATAGTTCAAAAGAGACAATTTGTTATCGGATTCCAATCGATTTAACTGAAAAATATTCTACAAAAGAAAATGAAATTTCTTCCATTTTAGAAAAATCTTCTTTTTTCATGAATTTTAACAACAATACACATAGCAACAATTTATTGGATAGTAACAAATCTAAAATATCATATATTGAACCAGATAATTTAATTATAATCACAACCTAATTCAACATGTTGTAATAATTTTTTAAAGATGTTTTACACTTCCATTTATTTTTAGTGGAAATGAAAATAGTTTAATAAAAAATT]
[+] EMBL BF936233             [AACATAGGGATTCCAATGGCTTGGAATAGGGTTTTCGTACTCGCAGTGTTGCTTTTTAAATCAACCCTTCAGTATCAACAAGAATTACAGAATAATCAGCGAAATACTATAAAAGACTCAAACTCTTTGAATTCAATTAATGTAACTGAATGTATTGAATTGAAAGATGCTAATTCAAAATTCATTAATCAACAAAATGGAATAAGGAATTCAAGTTCAAGAAATTCAAATTTACCACCATTAAATAGAATTACTGTTATCTCTCAAGATGATTTTCATCAATTATGTGCTCTTCTGGAGTTTCGTGGTTATTTTCTTATTACATATACAAATAATAGTTCAAAAGAGACAATTTGTTATCGGATTCCAATCGATTTAACTGAAAAATATTCTACAAAAGAAAATGAAATTTCTTCCATTTTAGAAAAATCTTCTTTTTTCATGAATTTTAACAACAATACACATAGCAACAATTTATTGGATAGTAACAAATCTAAAATATCATATATTGAACCAGATAATTTAATTATAATCACAA CTAATTCAACAT                                                                            ]


>consensus_1351#0 AACATAGGGATTCCAATGGCTTGGAATAGGGTTTTCGTACTCGCAGTGTTGCTTTTTAAA TCAACCCTTCAGTATCAACAAGAATTACAGAATAATCAGCGAAATACTATAAAAGACTCA AACTCTTTGAATTCAATTAATGTAACTGAATGTATTGAATTGAAAGATGCTAATTCAAAA TTCATTAATCAACAAAATGGAATAAGGAATTCAAGTTCAAGAAATTCAAATTTACCACCA TTAAATAGAATTACTGTTATCTCTCAAGATGATTTTCATCAATTATGTGCTCTTCTGGAG TTTCGTGGTTATTTTCTTATTACATATACAAATAATAGTTCAAAAGAGACAATTTGTTAT CGGATTCCAATCGATTTAACTGAAAAATATTCTACAAAAGAAAATGAAATTTCTTCCATT TTAGAAAAATCTTCTTTTTTCATGAATTTTAACAACAATACACATAGCAACAATTTATTG GATAGTAACAAATCTAAAATATCATATATTGAACCAGATAATTTAATTATAATCACAACC TAATTCAACATGTTGTAATAATTTTTTAAAGATGTTTTACACTTCCATTTATTTTTAGTG GAAATGAAAATAGTTTAATAAAAAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)