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Schistosoma mansoni
cluster # 1513 cluster # 1513       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1513#0 length = 560 sequences # 2  

consensusID : consensus_1513#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 560
fasta sequence
                              [AGCATTTATTCAACACAAATACTTAAACCGATAAACGATTTATAAATTGAAGTTACATTATTGAAAATATTAAATTAAGTAGTCTGATGATGAAACATTAGTTAATCAAACATTTTCACATATATAATCATTTAAAATGAATAAAAATTTTATTTACATTGAGCATTGAACCAAAAGTCTACTAACCAAACTATACAAATTATATAAAACAGAAATGAAATTGAGCGACAATTAATTTGTTTTATGTATCAGTTTTCTTGTCACATATCATAAATTGAGCTTTTAAACGAGCATTTAATTGTTCCCAATTCTGTGTTAATAACCACTGAGTATGATTTATAGAGGATGCCAAAGTTTGATTTAATAAACCATTGGAACTACTAGACAGATACAATTTTCGTGATTGACTATTAAACCCAGTAGGATCGATATCGTAACTAGTACCAGTAATACTATTACTTTTATTAAAAGGATTTGAACGTTTAGAAAATAATGAGGATTTAACAGTTGAAATAGTTGAATTATTATTATTTCCAATTAATGTAGATGATGATAATTTC]

[+] EMBL CD077252             [AGCATTTATTCAACACAAATACTTAAACCGATAAACGATTTATAAATTGAAGTTACATTATTGAAAATATTAAATTAAGTAGTCTGATGATGAAACATTAGTTAATCAAACATTTTCACATATATAATCATTTAAAATGAATAAAAATTTTATTTACATTGAGCATTGAACCAAAAGTCTACTAACCAAACTATACAAATTATATAAAACAGAAATGAAATTGAGCGACAATTAATTTGTTTTATGTATCAGTTTTCTTGTCACATATCATAAATTGAGCTTTTAAACGAGCATTTAATTGTTCCCAATTCTGTGTTAATAACCACTGAGTATGATTTATAGAGGATGCCAAAGTTTGATTTAATAAACCATTGGAACTACTAGACAGATACAATTTTCGTGATTGACTATTAAACCCAGTAGGATCGATATCGTAACTAGTACCAGTAATACTATTACTTTTATTAAAAGGATTTGAACGTTTAGAAAATAATGAGGATTTAACAGTTGAAATAGTTGAATTATTATTATTTCCAATTAATGTAGATGATGATAATTTC]
[+] EMBL AI976418             [AGCATTTATTCAACACAAATACTTAAACCGATAAACGATTTATAAATTGAAGTTACATTATTGAAAATATTAAATTAAGTAGTCTGATGATGAAACATTAGTTAATCAAACATTTTCACATATATAATCATTTAAAATGAATAAAAATTTTATTTACATTGAGCATTGAACCAAAAGTCTACTAACCAAACTATACAAATTATATAAAACAGAAATGAAATTGAGCGACAATTAATTTGTTTTATGTATCAGTTTTCTTGTGACATATCATAAATTGAGCTTTTAAACGAGCATTTAATTGTTCCCAATTCTGTGTTAATAACCACTGAGTATGATTTATAGAGGATGCCAAAGTTTGATTTAATAAACCATTGGAACTACTAGACAGATACAATTTTCGTGATTGACTATTAAACCCAGTAGGATCGATATCGTAACTAGTACCAGTAATACTATTACTTTTATTAAAAGGATT                                                                                     ]


>consensus_1513#0 AGCATTTATTCAACACAAATACTTAAACCGATAAACGATTTATAAATTGAAGTTACATTA TTGAAAATATTAAATTAAGTAGTCTGATGATGAAACATTAGTTAATCAAACATTTTCACA TATATAATCATTTAAAATGAATAAAAATTTTATTTACATTGAGCATTGAACCAAAAGTCT ACTAACCAAACTATACAAATTATATAAAACAGAAATGAAATTGAGCGACAATTAATTTGT TTTATGTATCAGTTTTCTTGTCACATATCATAAATTGAGCTTTTAAACGAGCATTTAATT GTTCCCAATTCTGTGTTAATAACCACTGAGTATGATTTATAGAGGATGCCAAAGTTTGAT TTAATAAACCATTGGAACTACTAGACAGATACAATTTTCGTGATTGACTATTAAACCCAG TAGGATCGATATCGTAACTAGTACCAGTAATACTATTACTTTTATTAAAAGGATTTGAAC GTTTAGAAAATAATGAGGATTTAACAGTTGAAATAGTTGAATTATTATTATTTCCAATTA ATGTAGATGATGATAATTTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)