cluster # 1527

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Schistosoma mansoni
cluster # 1527 cluster # 1527 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1527#0 length = 888 sequences # 2

consensusID : consensus_1527#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 888
fasta sequence

                              [GCTGACGAACATTGTTCAGGTTGTGGAAAAAAATCTGATGAATTATGTAGGCCATCTAGTTCCGATTCATAAGGACATAAAATCACTGGATACCCTTGAGCTGATAACCAACGTTTAGCTAATCGACATGCTATAGGAAACACATGTGCATAAGTACGTGAAACACCACTTAGTGTACCAGCTAATGTTGGTAAACTTTGATTCAGACGAATCCAACAAGCAGCTTCAGGATTCATTTCAGTAGATAATGAACTACCATCATCAGTCTCCGAAATTGTTTTATTTTTATTATCTGCTTTGATATCAGAATTACTTAATTTCTGAATTAAATTAAGTTCTTTTGACTGTGAAATTACAATTCGGAATACTAATCCTTGTAAAAATATATCCAACATATTATCGACGGTAACATGAGATGGAATTCCTTTAGGTGATAGCAATTCATGCATACGAATCACTAATAATCGTTTCATATGTCTGAATGCATCTAAGTCGTTTGGCCATCTTCCAGATTGTTCCAAGTGAATTATAACATACNNATGG-AACACAGGGAAACATGCATTTTTAAATAACCACTTAACCGTATGAAAATATGGCTTTTTTATTCCGTGATGTGACTGGTTAGCCATGGGAAAAGACAATATAGGAGGGAAAACTGAAGTGTCACGAAAAGCTGATGATAAAGGTAAAATCCCCGTAATATTAAGGGGAAGTTTATTATTTAATCCACGTAGTAACGCTCGGAGTTTATCCATTGCTCTAATCAGACGAAGAGGTGAGGCGGCAACTAAACTGACTTTTCGGTTGCGTCTATGCAAGCTTATAAATGGATCAAGACGATTAGGCAGAAGGTGATACCACGGCTTTGATACGTTAACATTTGATGAA]

[+] EMBL CD162827             [GCTGACGAACATTGTTCAGGTTGTGGAAAAAAATCTGATGAATTATGTAGGCCATCTAGTTCCGATTCATAAGGACATAAAATCACTGGATACCCTTGAGCTGATAACCAACGTTTAGCTAATCGACATGCTATAGGAAACACATGTGCATAAGTACGTGAAACACCACTTAGTGTACCAGCTAATGTTGGTAAACTTTGATTCAGACGAATCCAACAAGCAGCTTCAGGATTCATTTCAGTAGATAATGAACTACCATCATCAGTCTCCGAAATTGTTTTATTTTTATTATCTGCTTTGATATCAGAATTACTTAATTTCTGAATTAAATTAAGTTCTTTTGACTGTGAAATTACAATTCGGAATACTAATCCTTGTAAAAATATATCCAACATATTATCGACGGTAACATGAGATGGAATTCCTTTAGGTGATAGCAATTCATGCATACGAATCACTAATAATCGTTTCATATGTCTGAATGCATCTAAGTCGTTTGGCCATCTTCCAGATTGTTCCAAGTGAATTATAACATACNNATGG AACACAGGGAAACATGCATTTTTAAATAACCACTTAACCGTATGAAAATATGGCTTTTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL AI975006             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTTCCAAGTGAATTATAACAT CCAATGGAAACACAGGGAAACATGCATTTTTAAATAACCACTTAACCGTATGAAAATATGGCTTTTTTATTCCGTGATGTGACTGGTTAGCCATGGGAAAAGACAATATAGGAGGGAAAACTGAAGTGTCACGAAAAGCTGATGATAAAGGTAAAATCCCCGTAATATTAAGGGGAAGTTTATTATTTAATCCACGTAGTAACGCTCGGAGTTTATCCATTGCTCTAATCAGACGAAGAGGTGAGGCGGCAACTAAACTGACTTTTCGGTTGCGTCTATGCAAGCTTATAAATGGATCAAGACGATTAGGCAGAAGGTGATACCACGGCTTTGATACGTTAACATTTGATGAA]




>consensus_1527#0
GCTGACGAACATTGTTCAGGTTGTGGAAAAAAATCTGATGAATTATGTAGGCCATCTAGT
TCCGATTCATAAGGACATAAAATCACTGGATACCCTTGAGCTGATAACCAACGTTTAGCT
AATCGACATGCTATAGGAAACACATGTGCATAAGTACGTGAAACACCACTTAGTGTACCA
GCTAATGTTGGTAAACTTTGATTCAGACGAATCCAACAAGCAGCTTCAGGATTCATTTCA
GTAGATAATGAACTACCATCATCAGTCTCCGAAATTGTTTTATTTTTATTATCTGCTTTG
ATATCAGAATTACTTAATTTCTGAATTAAATTAAGTTCTTTTGACTGTGAAATTACAATT
CGGAATACTAATCCTTGTAAAAATATATCCAACATATTATCGACGGTAACATGAGATGGA
ATTCCTTTAGGTGATAGCAATTCATGCATACGAATCACTAATAATCGTTTCATATGTCTG
AATGCATCTAAGTCGTTTGGCCATCTTCCAGATTGTTCCAAGTGAATTATAACATACNNA
TGGAACACAGGGAAACATGCATTTTTAAATAACCACTTAACCGTATGAAAATATGGCTTT
TTTATTCCGTGATGTGACTGGTTAGCCATGGGAAAAGACAATATAGGAGGGAAAACTGAA
GTGTCACGAAAAGCTGATGATAAAGGTAAAATCCCCGTAATATTAAGGGGAAGTTTATTA
TTTAATCCACGTAGTAACGCTCGGAGTTTATCCATTGCTCTAATCAGACGAAGAGGTGAG
GCGGCAACTAAACTGACTTTTCGGTTGCGTCTATGCAAGCTTATAAATGGATCAAGACGA
TTAGGCAGAAGGTGATACCACGGCTTTGATACGTTAACATTTGATGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case