cluster # 162

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Schistosoma mansoni
cluster # 162 cluster # 162 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_162#0 length = 458 sequences # 2

consensusID : consensus_162#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 458
fasta sequence

                              [ACACACATAGATAGAAATAGTTTTACATTTACCGCATCATTCTTATCAAAATAAAATAGTTAATCAAATCTGACTCAGTTATTTTAGTGTCTATTTCAATCTGCCAACTAACTTTACTCAGAAGATAATTGATTTAGTGAGCTAATTA--ATCATAAATTAAAAGTATCTCGTATTCGTCAATCCTTCTTTATCAATGTATATGTATTGATTTTCCCCTCTTTCAATTATTCAAATAACGCTTATTTTGTGACAGTCAAGATTTTAGTGTTTACTACTATGATTATAATTGTAATTTAAATCAATATTGCAAAGAAATA-TATCAAACAATTGTGATAGTGTAATGACGTATAATCTTTTAAGTTTCTAATGGGTAATGTTAAATGGTCTATTTTGGCGCCTGCTTGCTTGTTTGTATGTGCGTGTATTAATCTTTACTCCCTTGTATTAACTATTGTAAA]

[+] EMBL AI559042             [ACACACATAGATAGAAATAGTTTTACATTTACCGCATCATTCTTATCAAAATAAAATAGTTAATCAAATCTGACTCAGTTATTTTAGTGTCTATTTCAATCTGCCAACTAACTTTACTCAGAAGATAATTGATTTAGTGAGCTAATTA  ATCATAAATTAAAAGTATCTCGTATTCGTCAATCCTTCTTTATCAATGTATATGTATTGATTTTCCCCTCTTTCAATTATTCAAATAACGCTTATTTTGTGACAGTCAAGATTTTAGTGTTTACTACTATGATTATAATTGTAATTTAAATCAATATTGCAAAGAAATA TATCAAACAATTGTGATAGTGTAATGACGTATAATCTTTTAAGTTTCTAATGGGTAATGTTAAATGGTCTATTTTGGCGCCTGCTTGCTTGTTTGTATGTGCGTGTATTAATCTTTACTCCCTTGTATTAACTATTGTAAA]
[+] EMBL AI618835             [ACACACATAGATAGAAATAGTTTTACATTTTCCGCATCATTCTTATCAAAATAAAATAGTTAATCAAATCTGACTCAGTTATTTTTGTGTCTATTTCAATCTGCCAACTAACTTTACTCAGAAGATAATTGATTTAGTGAGCTAATTAATATCATAAATT AAAGTATCTCGTATTCGTCAATCCTTCTTTATCAATGTATATGTTTTGTTTTTCCCCTCTTTCAATTATTCAAATAACGCTTATTTTGTGACAGTCAAGATTTTTGTGTTTACTACTATGATTATTATTGTTATTTTAATCAATATTGC AAGAAATATTTTCAAACAATTGTGATAGTGTAATGACGTATAACCTTTTTAGTTTCCAATGGGTAATTGTAAATGGGCTA                                                                      ]




>consensus_162#0
ACACACATAGATAGAAATAGTTTTACATTTACCGCATCATTCTTATCAAAATAAAATAGT
TAATCAAATCTGACTCAGTTATTTTAGTGTCTATTTCAATCTGCCAACTAACTTTACTCA
GAAGATAATTGATTTAGTGAGCTAATTAATCATAAATTAAAAGTATCTCGTATTCGTCAA
TCCTTCTTTATCAATGTATATGTATTGATTTTCCCCTCTTTCAATTATTCAAATAACGCT
TATTTTGTGACAGTCAAGATTTTAGTGTTTACTACTATGATTATAATTGTAATTTAAATC
AATATTGCAAAGAAATATATCAAACAATTGTGATAGTGTAATGACGTATAATCTTTTAAG
TTTCTAATGGGTAATGTTAAATGGTCTATTTTGGCGCCTGCTTGCTTGTTTGTATGTGCG
TGTATTAATCTTTACTCCCTTGTATTAACTATTGTAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case