cluster # 169

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Schistosoma mansoni
cluster # 169 cluster # 169 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_169#0 length = 709 sequences # 2

consensusID : consensus_169#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 709
fasta sequence

                              [CGGCCGCTCCAACACANAATGGTAACAAGTTGTCGCCCTTTATGGAAGCTGAATTACAACAAAAAATTGGTGATTAAAAAATCAATGAGATTGAAATATAAGACTACTCACAACAAGACGTAATGAGGTAAATGTATAACCGGTCGTTTAAAAACGTCAACCTCAACGTGTTACATTGCAATTCTTGATAGTGTTCTCCATATAACAAATTTTTTCAAGCTTTTACTAAAATCAACCAGAAATCTTTCCGAAATATTAGAGGTATTAGTTAAGGAGTATTAAAAAAAATCATATGTTCTATACGTATGTTCTCCATGTTGTACCATGACAGCTCTGAAAAACAGAAAGAGAAAAGAAGGAGAAACAGAATAGATAATGTTCATAACTTATGAAGTTAAGTCTTTTGTGATTACTTTGGTGTTATTTAGTTATCTCAGCTGTGTAGTTTAGTTTTGGTTTTAAACTTGATGGCTCTGTTTGCCATTATTGTTATAAGCTATACNTTGTGGGTTTCATTATCTTCAGGTTTCCTTTTATCCGAAT-AACCACTTTATCCCACTGACCTTTGACTGACTTCTCAGTTGGCCAAACTACCACTGCTTAAACATATAGTTCACTGTTTTTAAGTGCTTTACTCANACTTCGATAGTTNTCTGATCGTTNTATTTCACANATGAAGCAAAGAGGCCTTTNTGTGGCACTTTTCTGT]

[+] EMBL CD074337             [CGGCCGCTCCAACACANAATGGTAACAAGTTGTCGCCCTTTATGGAAGCTGAATTACAACAAAAAATTGGTGATTAAAAAATCAATGAGATTGAAATATAAGACTACTCACAACAAGACGTAATGAGGTAAATGTATAACCGGTCGTTTAAAAACGTCAACCTCAACGTGTTACATTGCAATTCTTGATAGTGTTCTCCATATAACAAATTTTTTCAAGCTTTTACTAAAATCAACCAGAAATCTTTCCGAAATATTAGAGGTATTAGTTAAGGAGTATTAAAAAAAATCATATGTTCTATACGTATGTTCTCCATGTTGTACCATGACAGCTCTGAAAAACAGAAAGAGAAAAGAAGGAGAAACAGAATAGATAATGTTCATAACTTATGAAGTTAAGTCTTTTGTGATTACTTTGGTGTTATTTAGTTATCTCAGCTGTGTAGTTTAGTTTTGGTTTTAAACTTGATGGCTCTGTTTGCCATTATTGTTATAAGCTATACNTTGTGGGTTTCATTATCTTCAGGTTTCCTTTTATCCGAAT AACCACTTTATCCCACTGACCTTTGACTGACTTCTCAGTTGGCCAAACTACCACTGCTTAAACATATAGTTCACTGTTTTTAAGTGCTTTACTCANACTTCGATAGTTNTCTGATCGTTNTATT                                          ]
[+] EMBL CD074515             [         ccACACAGAATGGTAACAAGTTGTCGCCCTTTATGGAAGCTGAATTACAACAAAAAATTGGTGATTAAAAAATCAATGAGATTGAAATATAAGACTACTCACAACAAGACGTAATGAGGTAAATGTATAACCGGTCGTTTAAAAACGTCAACCTCAACGTGTTACATTGCAATTCTTGATAGTGTTCTCCATATAACAAATTTTTTCAAGCTTTTACTAAAATCAACCAGAAATCTTTCCGAAATATTAGAGGTATTAGTTAAGGAGTATTAAAAAAAATCATATGTTCTATACGTATGTTCTCCATGTTGTACCATGACAGCTCTGAAAAACAGAAAGAGAAAAGAAGGAGAAACAGAATAGATAATGTTCATAACTTATGAAGTTAAGTCTTTTGTGATTACTTTGGTGTTATTTAGTTATCTCAGCTGTGTAGTTTAGTTTTGGTTTTAAACTTGATGGCTCTGTTTGCCATTATTGTTATAAGCTATAC TTGTGGGTTTCATTATCTTCAGGTTTCCTTTTATCCGAATAAACCACTTTATCCCACTGACCTTTGACTGACTTCTCAGTTGGCCAAACTACCACTGCTTAAACATATAGTTCACTGTTTTTAAGTGCTTTACTCAAACTTCGATAGTTTTCTGATCGTTTTATTTCACANATGAAGCAAAGAGGCCTTTNTGTGGCACTTTTCTGT]




>consensus_169#0
CGGCCGCTCCAACACANAATGGTAACAAGTTGTCGCCCTTTATGGAAGCTGAATTACAAC
AAAAAATTGGTGATTAAAAAATCAATGAGATTGAAATATAAGACTACTCACAACAAGACG
TAATGAGGTAAATGTATAACCGGTCGTTTAAAAACGTCAACCTCAACGTGTTACATTGCA
ATTCTTGATAGTGTTCTCCATATAACAAATTTTTTCAAGCTTTTACTAAAATCAACCAGA
AATCTTTCCGAAATATTAGAGGTATTAGTTAAGGAGTATTAAAAAAAATCATATGTTCTA
TACGTATGTTCTCCATGTTGTACCATGACAGCTCTGAAAAACAGAAAGAGAAAAGAAGGA
GAAACAGAATAGATAATGTTCATAACTTATGAAGTTAAGTCTTTTGTGATTACTTTGGTG
TTATTTAGTTATCTCAGCTGTGTAGTTTAGTTTTGGTTTTAAACTTGATGGCTCTGTTTG
CCATTATTGTTATAAGCTATACNTTGTGGGTTTCATTATCTTCAGGTTTCCTTTTATCCG
AATAACCACTTTATCCCACTGACCTTTGACTGACTTCTCAGTTGGCCAAACTACCACTGC
TTAAACATATAGTTCACTGTTTTTAAGTGCTTTACTCANACTTCGATAGTTNTCTGATCG
TTNTATTTCACANATGAAGCAAAGAGGCCTTTNTGTGGCACTTTTCTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case