cluster # 170

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Schistosoma mansoni
cluster # 170 cluster # 170 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_170#0 length = 737 sequences # 2

consensusID : consensus_170#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 737
fasta sequence

                              [ACATCTAGCCGGTCTGGGCTGGTGTTTTCGAATAAGTTTGACGTTAACGTTCAGTACAATCGTTTAATACTACAATGCCTGACGTCCGCTCAGATGGAAGATGCATATACGGATCCCTTACGTACTGAACTGGTTGTCTTAGCGCTATGTAAATGTCCAGATTTATTCCCACATTACCTCGATCACTTGGCTCCTAGTTTATATCCACGTGATTCACCTAGTTGGTTCTGTTTAATCGAATTTGTTTTTCACATCTACAGATCGATTAGCAAATATATCGTTCAGTTCACCATAACTGCACTGACTCATTCACTGACGATTGAAGTATTAGCTATTTCCATAGCAAATTTTTGTGTCTGGTCACCGAAAATGATTGATCCTATCAGAATAGCCCTACAGTATGATAAATCATCCGATGTTAAAAATAAGGCTACTGAACTTATGAGATACTTGCAACAACTGTTGAAAATCCCGTTAACTTGGCTCTCACTGAACCAGCTACCAAGTGCAATGAACTTTACATCGGACCAGTTAAAAATGAAGATTGAATTGCTTATTCGTGAACGTATACCTGATTCCAAATGGTTAATTCACTTTCAAAAGCTATTTAAAAAGAATTTAAACGACCCTAACTTGTTGATAGATCAAGTTGTATCTTTTACCAGTCAAAGTGAACCAGAGGTTTTTGAAGAGTCAATCAAAATAGAAGATATGGTGAACTCGATTGAACAATCTCT]

[+] EMBL CD118618             [ACATCTAGCCGGTCTGGGCTGGTGTTTTCGAATAAGTTTGACGTTAACGTTCAGTACAATCGTTTAATACTACAATGCCTGACGTCCGCTCAGATGGAAGATGCATATACGGATCCCTTACGTACTGAACTGGTTGTCTTAGCGCTATGTAAATGTCCAGATTTATTCCCACATTACCTCGATCACTTGGCTCCTAGTTTATATCCACGTGATTCACCTAGTTGGTTCTGTTTAATCGAATTTGTTTTTCACATCTACAGATCGATTAGCAAATATATCGTTCAGTTCACCATAACTGCACTGACTCATTCACTGACGATTGAAGTATTAGCTATTTCCATAGCAAATTTTTGTGTCTGGTCACCGAAAATGATTGATCCTATCAGAATAGCCCTACAGTATGATAAATCATCCGATGTTAAAAATAAGGCTACTGAACTTATGAGATACTTGCAACAACTGTTGAAAATCCCGTTAACTTGGCTCTCACTGAACCAGCTACCAAGTGCAATGAACTTTACATCGGACCAGTTAAAAATGAAGATTGAATTGCT                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD200960             [                                                                                                                                                                                                            CCACGTGATTCACNTAGTTGGGTCTGTTTAATCGAATTTGTTTTTCACATCTACAGATCGATTAGCAAATATATCGTTCAGTTCACCATAACTGCACTGACTCATTCACTGACGATTGAAGTATTAGCTATTTCCATAGCAAATTTTTGTGTCTTGTCACCGAAAATGATAGATCCTATCAGAATAGCCCTACAGTATGATAAATCATCCGATGTTAAAAATAAGGCTACTGAACTTATGAGATACTTGAAACAACTGTTGAAAATCCCGTTAACTTGGCTTTCACTGAACCAGCTACCAAGTGCAATGAACTTTACATCGGACCAGTTAAAAATGAAGATTGAATTGTTTATTCGTGAACGTATACCTGATTCCAAATGGTTAATTCACTTTCAAAAGCTATTTAAAAAGAATTTAAACGACCCTAACTTGTTGATAGATCAAGTTGTATCTTTTACCAGTCAAAGTGAACCAGAGGTTTTTGAAGAGTCAATCAAAATAGAAGATATGGTGAACTCGATTGAACAATCTCT]




>consensus_170#0
ACATCTAGCCGGTCTGGGCTGGTGTTTTCGAATAAGTTTGACGTTAACGTTCAGTACAAT
CGTTTAATACTACAATGCCTGACGTCCGCTCAGATGGAAGATGCATATACGGATCCCTTA
CGTACTGAACTGGTTGTCTTAGCGCTATGTAAATGTCCAGATTTATTCCCACATTACCTC
GATCACTTGGCTCCTAGTTTATATCCACGTGATTCACCTAGTTGGTTCTGTTTAATCGAA
TTTGTTTTTCACATCTACAGATCGATTAGCAAATATATCGTTCAGTTCACCATAACTGCA
CTGACTCATTCACTGACGATTGAAGTATTAGCTATTTCCATAGCAAATTTTTGTGTCTGG
TCACCGAAAATGATTGATCCTATCAGAATAGCCCTACAGTATGATAAATCATCCGATGTT
AAAAATAAGGCTACTGAACTTATGAGATACTTGCAACAACTGTTGAAAATCCCGTTAACT
TGGCTCTCACTGAACCAGCTACCAAGTGCAATGAACTTTACATCGGACCAGTTAAAAATG
AAGATTGAATTGCTTATTCGTGAACGTATACCTGATTCCAAATGGTTAATTCACTTTCAA
AAGCTATTTAAAAAGAATTTAAACGACCCTAACTTGTTGATAGATCAAGTTGTATCTTTT
ACCAGTCAAAGTGAACCAGAGGTTTTTGAAGAGTCAATCAAAATAGAAGATATGGTGAAC
TCGATTGAACAATCTCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case