Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1793 cluster # 1793       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1793#0 length = 546 sequences # 2  

consensusID : consensus_1793#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 546
fasta sequence
                              [GTTACATTAATATGGTTTCCTTTTTTTATAGTTAAGCATATGTTTGCAGGTATGTATATGCAACCGATCATCCGTATGTGTGTGTGTGTATACGTATGTATGTATGTATGCATGTGTCTTTAAACGAACGCACATACATATACAAATAAATAAATAAATAAATAAATATATCTCCTAATCACTTGAAAAAGAAAAAAATATGCTTTCCTGAATAGAAATGTACTTTAGGCATTTTACTAAAGATTTTATGTGTAAAACAAGTTCGTTTATCTCCATGTCATCATATATAATATCACGTTGTCCAGATGAATTGAAGAGTATTTGTGAAATTTTTTTTGTAAATAATATTTTAAAATATAGATGTTTTGAAAAAAAAATTGAGCAAAATTCTTTGTTGTTTTAGGTGTTATTATTTGGAAGGGGTGGGGGATTTCGTTACAGGCAATCAACACTAACACATGCATACAAGCACAGATACACAAAATTTCAAAAAAAAAAGGTTTGAATAATTGTAATTAATAATGTTTGTTTTTAAGAAAACAAAAC]

[+] EMBL CD145220             [GTTACATTAATATGGTTTCCTTTTTTTATAGTTAAGCATATGTTTGCAGGTATGTATATGCAACCGATCATCCGTATGTGTGTGTGTGTATACGTATGTATGTATGTATGCATGTGTCTTTAAACGAACGCACATACATATACAAATAAATAAATAAATAAATAAATATATCTCCTAATCACTTGAAAAAGAAAAAAATATGCTTTCCTGAATAGAAATGTACTTTAGGCATTTTACTAAAGATTTTATGTGTAAAACAAGTTCGTTTATCTCCATGTCATCATATATAATATCACGTTGTCCAGATGAATTGAAGAGTATTTGTGAAATTTTTTTTGTAAATAATATTTTAAAATATAGATGTTTTGAAAAAAAAATTGAGCAAAATTCTTTGTTGTTTTAGGTGTTATTATTTGGAAGGGGTGGGGGATTTCGTTACAGGCAATCAACACTAACACATGCATACAAGCACAGATACACAAAATTTCAAAAAAAAAAGGTTTGAATAATTGTAATTAATAATGTTTGTTTTTAAGAAAACAAAAC]
[-] EMBL CD185105             [                                     ATATGTTTGCAGGTATGTATATGCAACCGATCATCCGTATGTGTGTGTGTGTATACGTATGTATGTATGTATGCATGTGTCTTTAAACGAACGCACATACATATACAAATAAATAAATAAATAAATAAATATATCTCCTAATCACTTGAAAAAGAAAAAAATATGTTTTCCTGAATAGAAATGTACTTTAGGCATTTTACTAAAGATTTTATGTGTAAAACAAGTTCGTTTATCTCCATGTCATCATGTATAATATCACGTTGTCCAGATGAATTGAAGAGTATTTGTGAAATTTTTTTTGTAAGTAATATTTTAAAATATAGATGTTTTGAAAAAAAAATTGAGCAAAATTCTTTGTTGTTTTAGGTGTTACTATTTGGAAGGGGTGGGGGATTTCGTTACAGGCAATCAACACTAACACATGCATACAAGCACAGATACA                                                                   ]


>consensus_1793#0 GTTACATTAATATGGTTTCCTTTTTTTATAGTTAAGCATATGTTTGCAGGTATGTATATG CAACCGATCATCCGTATGTGTGTGTGTGTATACGTATGTATGTATGTATGCATGTGTCTT TAAACGAACGCACATACATATACAAATAAATAAATAAATAAATAAATATATCTCCTAATC ACTTGAAAAAGAAAAAAATATGCTTTCCTGAATAGAAATGTACTTTAGGCATTTTACTAA AGATTTTATGTGTAAAACAAGTTCGTTTATCTCCATGTCATCATATATAATATCACGTTG TCCAGATGAATTGAAGAGTATTTGTGAAATTTTTTTTGTAAATAATATTTTAAAATATAG ATGTTTTGAAAAAAAAATTGAGCAAAATTCTTTGTTGTTTTAGGTGTTATTATTTGGAAG GGGTGGGGGATTTCGTTACAGGCAATCAACACTAACACATGCATACAAGCACAGATACAC AAAATTTCAAAAAAAAAAGGTTTGAATAATTGTAATTAATAATGTTTGTTTTTAAGAAAA CAAAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)