Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1849 cluster # 1849       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1849#0 length = 637 sequences # 2  

consensusID : consensus_1849#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 637
fasta sequence
                              [CTCATTGGCTCTGCTTGAAATTTTGCACTGTCATGTCCAAGGGTTTCATCGACAAACTTCGTATTTTTGTCAGAGCTGGTAGTGGAGCTGCAGGTAGTCCACCAATTAAAGGCCGAGGAGGAAATGGTGGGAGTGTATTTCTGGAAGCCGGTGAAAATGAAACACTCCAAAAACTGTTTATGGCTAACCCGACGAAACGTTTCGCGGCTGGACATGGAACAGAGGCAAGTAAACGTCGTGGTTTAGTTGTTGGTCTAGATGGTCAAGACTTGACTATTCGTGTTCCTGCTGGAATAACTGTATTGTTTGGAGGTCAAGGGACATCATCAGCTAATGGGTCAGAACAACGAATACTTGGAAATTTGGATAAAGTCGGTCAGAAGTTACTTGTAGCACAAGGTGGTGTGGGTGGTTTTCACCAAAATGGGTATATTGGCTCACCGGGTCAGGCTCACAGTATCGTCTTAGATTTAAAGCTTATGGCTGATTACAGTTTGATTGGATTTCCTAACGCTGGTAAATCTAGTCTATTANAAGCTNTATCTGGTGCACCAGCGAANATTGCCAATTATCCTTTTACTACAATTAAACCACAAGTTGCCAAGTGTATATATTCAGATCATCGTGAGATAAGTAT]

[+] EMBL CD079258             [CTCATTGGCTCTGCTTGAAATTTTGCACTGTCATGTCCAAGGGTTTCATCGACAAACTTCGTATTTTTGTCAGAGCTGGTAGTGGAGCTGCAGGTAGTCCACCAATTAAAGGCCGAGGAGGAAATGGTGGGAGTGTATTTCTGGAAGCCGGTGAAAATGAAACACTCCAAAAACTGTTTATGGCTAACCCGACGAAACGTTTCGCGGCTGGACATGGAACAGAGGCAAGTAAACGTCGTGGTTTAGTTGTTGGTCTAGATGGTCAAGACTTGACTATTCGTGTTCCTGCTGGAATAACTGTATTGTTTGGAGGTCAAGGGACATCATCAGCTAATGGGTCAGAACAACGAATACTTGGAAATTTGGATAAAGTCGGTCAGAAGTTACTTGTAGCACAAGGTGGTGTGGGTGGTTTTCACCAAAATGGGTATATTGGCTCACCGGGTCAGGCTCACAGTATCGTCTTAGATTTAAAGCTTATGGCTGATTACAGTTTGATTGGATTTCCTAACGCTGGTAAATCTAGTCTATTANAAGCTNTATCTGGTGCACCAGCGAANATTGCCAATTATCCTTTTACTACAATTAAACCACAAGTTG                                     ]
[+] EMBL CD188745             [                                                                                                                                                     GGGGAAAATGAAACACTCCAAAAACTGTTTATGGCTAACCCGACGAAACGTTTCGCGGCTGGACATGGAACAGAGGCAAGTAAACGTCGTGGTTTAGTTGTTGGTCTAGATGGTCAAGACTTGACTATTCGTGTTCCTGCTGGAATAACTGTATTGGTTGGAGGTCAAGGGACATCATCAGCTAATGGGTCAGAACAACGAATACTTGTAAATTTGGATAAAGTCGGTCAGAAGTTACTTGTAACACAAGGTGGCGTGGGTGGATTTCACCAAAATGGGTATATTGTCTCACCGGGTCAGGCTCACAGTATCGACTTAGATTTAAAGCTTATGGCTGATTACAGCGTGATTGGATTTCCTAACGCTGGTAAATCTAGTCTATTAAAAGCTTTATCTGCTGCACCAGCAAAAATTGCCAATTATCCTTTTACTACAATTAAACCACAAGTTGCCAAGTGTATATATTCAGATCATCGTGAGATAAGTAT]


>consensus_1849#0 CTCATTGGCTCTGCTTGAAATTTTGCACTGTCATGTCCAAGGGTTTCATCGACAAACTTC GTATTTTTGTCAGAGCTGGTAGTGGAGCTGCAGGTAGTCCACCAATTAAAGGCCGAGGAG GAAATGGTGGGAGTGTATTTCTGGAAGCCGGTGAAAATGAAACACTCCAAAAACTGTTTA TGGCTAACCCGACGAAACGTTTCGCGGCTGGACATGGAACAGAGGCAAGTAAACGTCGTG GTTTAGTTGTTGGTCTAGATGGTCAAGACTTGACTATTCGTGTTCCTGCTGGAATAACTG TATTGTTTGGAGGTCAAGGGACATCATCAGCTAATGGGTCAGAACAACGAATACTTGGAA ATTTGGATAAAGTCGGTCAGAAGTTACTTGTAGCACAAGGTGGTGTGGGTGGTTTTCACC AAAATGGGTATATTGGCTCACCGGGTCAGGCTCACAGTATCGTCTTAGATTTAAAGCTTA TGGCTGATTACAGTTTGATTGGATTTCCTAACGCTGGTAAATCTAGTCTATTANAAGCTN TATCTGGTGCACCAGCGAANATTGCCAATTATCCTTTTACTACAATTAAACCACAAGTTG CCAAGTGTATATATTCAGATCATCGTGAGATAAGTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)