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Schistosoma mansoni
cluster # 1864 cluster # 1864       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1864#0 length = 1043 sequences # 2  

consensusID : consensus_1864#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1043
fasta sequence
                              [AAATCATTTAATTTAATTTATAATTGGCAATTAAATGTACATATTCAACACGATTTTCCTCAGTAACTGGTATATGTTTTCCACCTGGTTTTAGTTCGACTGTTTCAGACTGACCAAAAATTGATTGAACCATAGTAAAATCTAATGATAAATCTCTGACATCCCCTTTGTAATTTTTAAGAAATAATAATTGTTTATACAATTGTGGATCAAGTGAATGTAGATAATCAAAGCCAACTCCGCCACCGCCACTTCGACTAACAATTTTAGCCAAGAAGAAATAAGCAAACTGAAGATCGACAAGCACACCTTCGAAAATTGCCTTTGCTAAAATTCTTCCCAAGAAATAATAATGTTTTAAATAATTTGTAGTAATTGCAGATGCTTGTGGATTTGGATATAATGTTTTATCTGATGCATAAAT-AAAAAATCCTCTAGTTGGATCAAAACCAGCACGAATAATTTCAGTAAGAAATTCTCTTGATAAACCACCACCATCAATACCAACTTCAGCTAAGCCAGTTGGATTCAAGAAGGTAACTTTTAAACGTTGATGTAAATTGGGTACATTTTCTTTAGATAATTTCTCAAATCCATCTTCATATAAATGGGTTCGACGAACAATAAGAGGAACACTTGGTTGATTGGATATATTATATATACGTCGAAATGGATTACGATTATATGTACTATCATCATTGATAAGAATCTTANATAATNTAACTCGTTTTTCAAATGGTATAACANATGGAACTTTTTTCAATAATAAGATTTGACGTATTTGACGATTAGANTAAGAAAATGATTCTAGTACCGCTTGATTTCGATCTGGATTCAAAATACTGGTATAACCAAACGTGCATCAGCTAATGCTAATGTATCTTGGATACCTCGATTTTCAAACATGACGATNGTGGATCTGTAGTATTTAATAAAATCAACAAGTNATTCTTTTAACCAAAATGTTTGACTAACACTTGGNNTGTGCCGATGGNTANAAACGTGTGAATTTGNTACACCGTGCCATATCAGTATTGAGGATG]

[-] EMBL CD132111             [AAATCATTTAATTTAATTTATAATTGGCAATTAAATGTACATATTCAACACGATTTTCCTCAGTAACTGGTATATGTTTTCCACCTGGTTTTAGTTCGACTGTTTCAGACTGACCAAAAATTGATTGAACCATAGTAAAATCTAATGATAAATCTCTGACATCCCCTTTGTAATTTTTAAGAAATAATAATTGTTTATACAATTGTGGATCAAGTGAATGTAGATAATCAAAGCCAACTCCGCCACCGCCACTTCGACTAACAATTTTAGCCAAGAAGAAATAAGCAAACTGAAGATCGACAAGCACACCTTCGAAAATTGCCTTTGCTAAAATTCTTCCCAAGAAATAATAATGTTTTAAATAATTTGTAGTAATTGCAGATGCTTGTGGATTTGGATATAATGTTTTATCTGATGCATAAAT AAAAAATCCTCTAGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD202137             [                                                                                                                                                                                                                                                    ACCGCCACTTCGACTAACAATTTTAGCCAAGAAGAAATAAGCAAACTGAAGATCGACAAGCACACCTTCGAAAATTGCCTTTGCTAAAATTCTTCCCAAGAAATAATAATGTTTTAAATAATTTGTAGTAATTGCAGATGCTTGTGGATTTGGATATAATGTTTTATCTGATGCATAAATAAAAAAATCCTCTAGTTGGATCAAAACCAGCACGAATAATTTCAGTAAGAAATTCTCTTGATAAACCACCACCATCAATACCAACTTCAGCTAAGCCAGTTGGATTCAAGAAGGTAACTTTTAAACGTTGATGTAAATTGGGTACATTTTCTTTAGATAATTTCTCAAATCCATCTTCATATAAATGGGTTCGACGAACAATAAGAGGAACACTTGGTTGATTGGATATATTATATATACGTCGAAATGGATTACGATTATATGTACTATCATCATTGATAAGAATCTTANATAATNTAACTCGTTTTTCAAATGGTATAACANATGGAACTTTTTTCAATAATAAGATTTGACGTATTTGACGATTAGANTAAGAAAATGATTCTAGTACCGCTTGATTTCGATCTGGATTCAAAATACTGGTATAACCAAACGTGCATCAGCTAATGCTAATGTATCTTGGATACCTCGATTTTCAAACATGACGATNGTGGATCTGTAGTATTTAATAAAATCAACAAGTNATTCTTTTAACCAAAATGTTTGACTAACACTTGGNNTGTGCCGATGGNTANAAACGTGTGAATTTGNTACACCGTGCCATATCAGTATTGAGGATG]


>consensus_1864#0 AAATCATTTAATTTAATTTATAATTGGCAATTAAATGTACATATTCAACACGATTTTCCT CAGTAACTGGTATATGTTTTCCACCTGGTTTTAGTTCGACTGTTTCAGACTGACCAAAAA TTGATTGAACCATAGTAAAATCTAATGATAAATCTCTGACATCCCCTTTGTAATTTTTAA GAAATAATAATTGTTTATACAATTGTGGATCAAGTGAATGTAGATAATCAAAGCCAACTC CGCCACCGCCACTTCGACTAACAATTTTAGCCAAGAAGAAATAAGCAAACTGAAGATCGA CAAGCACACCTTCGAAAATTGCCTTTGCTAAAATTCTTCCCAAGAAATAATAATGTTTTA AATAATTTGTAGTAATTGCAGATGCTTGTGGATTTGGATATAATGTTTTATCTGATGCAT AAATAAAAAATCCTCTAGTTGGATCAAAACCAGCACGAATAATTTCAGTAAGAAATTCTC TTGATAAACCACCACCATCAATACCAACTTCAGCTAAGCCAGTTGGATTCAAGAAGGTAA CTTTTAAACGTTGATGTAAATTGGGTACATTTTCTTTAGATAATTTCTCAAATCCATCTT CATATAAATGGGTTCGACGAACAATAAGAGGAACACTTGGTTGATTGGATATATTATATA TACGTCGAAATGGATTACGATTATATGTACTATCATCATTGATAAGAATCTTANATAATN TAACTCGTTTTTCAAATGGTATAACANATGGAACTTTTTTCAATAATAAGATTTGACGTA TTTGACGATTAGANTAAGAAAATGATTCTAGTACCGCTTGATTTCGATCTGGATTCAAAA TACTGGTATAACCAAACGTGCATCAGCTAATGCTAATGTATCTTGGATACCTCGATTTTC AAACATGACGATNGTGGATCTGTAGTATTTAATAAAATCAACAAGTNATTCTTTTAACCA AAATGTTTGACTAACACTTGGNNTGTGCCGATGGNTANAAACGTGTGAATTTGNTACACC GTGCCATATCAGTATTGAGGATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)