These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_1869#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 776 fasta sequence [ATATCAAATACATCGTTAAGCAACGACGAATAAATAACGTTGTCGAATCAAATTATTTAACCGAATAATAAACGATTCACTGTCTAACTGAATCAATCTGTTGAATTTCGTCTAAATAGTTGTCCATGGAATAGATTATATGGAAAGTTATGGAATATATTAAATCTCTCTATCTCTTATGCTATTACAAATAAAGAAAGGTATCATTCTAGTAGTGGTAGAACAAGGGGAATTATCATTCTGAAATTCATTTAAAGAAATAAATAAGAATTATTATCCATTTTGTTTATACACATGTCGACTGGTGGTTATCATCATGCAGCAATTTTATCACCGGCTTTCTATGCAAGACAATGTTATTCAGATAATATTAGTAATGATTCATCATATTGGAAACATGAAGATGCTGCTAGACATTTATCAAATCATGTTATGAATAAATATCCTAATTTAAATGTTTTATGTTTAAATAATTCAAC-TTATATGAAAAATGATCTTTGGTCAGATTCAACAAGAATTAATGCATGTNNTA-TTTCTCAAGCTAGTCGTATTGTTTTATTTATACCGGATGATGCAGCTGAACATATTACTTATTTTAGTCGACATTGTTTACATTCATTATTGTGTAGATCACGTGATCAAGGTGGACGANCAGNATGGCATTCACGTNNTATTGCTNGTGCTATTGGTANTGTACAAGTGCCGAATCAATTAAATCCAGATGTACCATTTATAAATGTAATACGTTTTCGTGAAATAGGATGGTTTCGAGATAT] [+] EMBL CD186060 [ATATCAAATACATCGTTAAGCAACGACGAATAAATAACGTTGTCGAATCAAATTATTTAACCGAATAATAAACGATTCACTGTCTAACTGAATCAATCTGTTGAATTTCGTCTAAATAGTTGTCCATGGAATAGATTATATGGAAAGTTATGGAATATATTAAATCTCTCTATCTCTTATGCTATTACAAATAAAGAAAGGTATCATTCTAGTAGTGGTAGAACAAGGGGAATTATCATTCTGAAATTCATTTAAAGAAATAAATAAGAATTATTATCCATTTTGTTTATACACATGTCGACTGGTGGTTATCATCATGCAGCAATTTTATCACCGGCTTTCTATGCAAGACAATGTTATTCAGATAATATTAGTAATGATTCATCATATTGGAAACATGAAGATGCTGCTAGACATTTATCAAATCATGTTATGAATAAATATCCTAATTTAAATGTTTTATGTTTAAATAATTCAAC TTATATGAAAAATGATCTTTGGTCAGATTCAACAAGAATTAATGCATGTNNTA TTTCTCAAGCTAGTCGTATTGTTTTATTTATACCGGATGATGCAGCTGAACATATTACTTATTTTAGTCGACATTGTTTACATTCATTATTGTGTAGATCACGTGATCAAGGTGGACGANCAGNATGGCATTCACGTNNTATTGCTNGTGCTATTGGTANTGTACAAGTGCCG ] [-] EMBL CD119287 [ TAGTAATGATTCATCATATTGGAAACATGAAGATGCTGCTAGACATTTATCAAATCATGTTATGAATAAATATCCTAATTTAAATGTTTTATGTTTAAATAATTCAACTTTATATGAAAAATGATCTTTGGTCAGATTCAACAAGAATTAATGCATGT TTATTTTCTCAAGCTAGTCGTATTGTTTTATTTATACCGGATGATGCAGCTGAACATATTACTTATTTTAGTCGACATTGTTTACATCCATTATTGTGTAGATCACGTGATCAAGGTGGACGACCAGAATGGCATTCACGTTTTATTGCTGTTGCTATTGGTAGTGTACAAGTGCCGAATCAATTAAATCCAGATGTACCATTTATAAATGTAATACGTTTTCGTGAAATAGGATGGTTTCGAGATAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||