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Schistosoma mansoni
cluster # 1869 cluster # 1869       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1869#0 length = 776 sequences # 2  

consensusID : consensus_1869#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 776
fasta sequence
                              [ATATCAAATACATCGTTAAGCAACGACGAATAAATAACGTTGTCGAATCAAATTATTTAACCGAATAATAAACGATTCACTGTCTAACTGAATCAATCTGTTGAATTTCGTCTAAATAGTTGTCCATGGAATAGATTATATGGAAAGTTATGGAATATATTAAATCTCTCTATCTCTTATGCTATTACAAATAAAGAAAGGTATCATTCTAGTAGTGGTAGAACAAGGGGAATTATCATTCTGAAATTCATTTAAAGAAATAAATAAGAATTATTATCCATTTTGTTTATACACATGTCGACTGGTGGTTATCATCATGCAGCAATTTTATCACCGGCTTTCTATGCAAGACAATGTTATTCAGATAATATTAGTAATGATTCATCATATTGGAAACATGAAGATGCTGCTAGACATTTATCAAATCATGTTATGAATAAATATCCTAATTTAAATGTTTTATGTTTAAATAATTCAAC-TTATATGAAAAATGATCTTTGGTCAGATTCAACAAGAATTAATGCATGTNNTA-TTTCTCAAGCTAGTCGTATTGTTTTATTTATACCGGATGATGCAGCTGAACATATTACTTATTTTAGTCGACATTGTTTACATTCATTATTGTGTAGATCACGTGATCAAGGTGGACGANCAGNATGGCATTCACGTNNTATTGCTNGTGCTATTGGTANTGTACAAGTGCCGAATCAATTAAATCCAGATGTACCATTTATAAATGTAATACGTTTTCGTGAAATAGGATGGTTTCGAGATAT]

[+] EMBL CD186060             [ATATCAAATACATCGTTAAGCAACGACGAATAAATAACGTTGTCGAATCAAATTATTTAACCGAATAATAAACGATTCACTGTCTAACTGAATCAATCTGTTGAATTTCGTCTAAATAGTTGTCCATGGAATAGATTATATGGAAAGTTATGGAATATATTAAATCTCTCTATCTCTTATGCTATTACAAATAAAGAAAGGTATCATTCTAGTAGTGGTAGAACAAGGGGAATTATCATTCTGAAATTCATTTAAAGAAATAAATAAGAATTATTATCCATTTTGTTTATACACATGTCGACTGGTGGTTATCATCATGCAGCAATTTTATCACCGGCTTTCTATGCAAGACAATGTTATTCAGATAATATTAGTAATGATTCATCATATTGGAAACATGAAGATGCTGCTAGACATTTATCAAATCATGTTATGAATAAATATCCTAATTTAAATGTTTTATGTTTAAATAATTCAAC TTATATGAAAAATGATCTTTGGTCAGATTCAACAAGAATTAATGCATGTNNTA TTTCTCAAGCTAGTCGTATTGTTTTATTTATACCGGATGATGCAGCTGAACATATTACTTATTTTAGTCGACATTGTTTACATTCATTATTGTGTAGATCACGTGATCAAGGTGGACGANCAGNATGGCATTCACGTNNTATTGCTNGTGCTATTGGTANTGTACAAGTGCCG                                                                       ]
[-] EMBL CD119287             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAGTAATGATTCATCATATTGGAAACATGAAGATGCTGCTAGACATTTATCAAATCATGTTATGAATAAATATCCTAATTTAAATGTTTTATGTTTAAATAATTCAACTTTATATGAAAAATGATCTTTGGTCAGATTCAACAAGAATTAATGCATGT TTATTTTCTCAAGCTAGTCGTATTGTTTTATTTATACCGGATGATGCAGCTGAACATATTACTTATTTTAGTCGACATTGTTTACATCCATTATTGTGTAGATCACGTGATCAAGGTGGACGACCAGAATGGCATTCACGTTTTATTGCTGTTGCTATTGGTAGTGTACAAGTGCCGAATCAATTAAATCCAGATGTACCATTTATAAATGTAATACGTTTTCGTGAAATAGGATGGTTTCGAGATAT]


>consensus_1869#0 ATATCAAATACATCGTTAAGCAACGACGAATAAATAACGTTGTCGAATCAAATTATTTAA CCGAATAATAAACGATTCACTGTCTAACTGAATCAATCTGTTGAATTTCGTCTAAATAGT TGTCCATGGAATAGATTATATGGAAAGTTATGGAATATATTAAATCTCTCTATCTCTTAT GCTATTACAAATAAAGAAAGGTATCATTCTAGTAGTGGTAGAACAAGGGGAATTATCATT CTGAAATTCATTTAAAGAAATAAATAAGAATTATTATCCATTTTGTTTATACACATGTCG ACTGGTGGTTATCATCATGCAGCAATTTTATCACCGGCTTTCTATGCAAGACAATGTTAT TCAGATAATATTAGTAATGATTCATCATATTGGAAACATGAAGATGCTGCTAGACATTTA TCAAATCATGTTATGAATAAATATCCTAATTTAAATGTTTTATGTTTAAATAATTCAACT TATATGAAAAATGATCTTTGGTCAGATTCAACAAGAATTAATGCATGTNNTATTTCTCAA GCTAGTCGTATTGTTTTATTTATACCGGATGATGCAGCTGAACATATTACTTATTTTAGT CGACATTGTTTACATTCATTATTGTGTAGATCACGTGATCAAGGTGGACGANCAGNATGG CATTCACGTNNTATTGCTNGTGCTATTGGTANTGTACAAGTGCCGAATCAATTAAATCCA GATGTACCATTTATAAATGTAATACGTTTTCGTGAAATAGGATGGTTTCGAGATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)