These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_1885#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 977 fasta sequence [CGTTATTATATCCACTATCCCGGTTTCAAGTTGTTGCATCCCTTCGACATTTGACACGTTTTACAATTCTATCTTATATTCGACGTGATCATATTGATCAATTACCATTGCCGAAGATCACAATTAATTATCTAATGGAAAAACAATGTTATGTTGAATCTTTAGAAGATTTTGAAGAAGCTGTTCGAGAGCGACCACCACTGGAATTTCGTTCACGTTCAGCTATGGTTGATTTTAATTCACATTTGACTTTACAAGATTCGAATAATAATAATGATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCTCTCCCGATTTAGTAATAATAGCAGTTCAATCAGTGAAACAAGCAATGATATTCGTCTGGCGACTGTTAGACATATGAATTAATTCATGTCAGTGATGAGATAATGTATTGTGTCATTCAATTTTTGTCACTGATTACCAGAAAATTGCACAGCGAAGTGACATACTGCTATAACATGAATGCTATTATCACTACTGTCATCATATTTACTATTAAATTTGTGTTGCCTTTTTTCCCAACTTTCTAGGAAAATAATNNATGAT-ATGANAACGTTTCTTGCTACGGTGAATTTAATAAGATGAAAATTGGACTAGTTCATTTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTCTGTCTGTCTCTTTTTCAAACACACACACTTCTACAGCAACTAATTTTTTTTTCTAGTGCATTTTACTTTCGACTACACTACCACTACCAGTGACAACATAGCACTAATGGCACTAATGTTCTCATATTTTTCTAATTCTTATCGGGAAAACAATTAAGCTTCTATATATATATATATATTCTTGTTATCCGATTGTGAATATTTTACTTCTCGTTGACAGGCTNTTGTGTGTGGGTATGTTTGTTTGTGTTTATCGNTGTTTCTCTTATCTACCTTTTCTTATTTATGGAACAGTAACATCTTTATTGT] [+] EMBL CD194758 [CGTTATTATATCCACTATCCCGGTTTCAAGTTGTTGCATCCCTTCGACATTTGACACGTTTTACAATTCTATCTTATATTCGACGTGATCATATTGATCAATTACCATTGCCGAAGATCACAATTAATTATCTAATGGAAAAACAATGTTATGTTGAATCTTTAGAAGATTTTGAAGAAGCTGTTCGAGAGCGACCACCACTGGAATTTCGTTCACGTTCAGCTATGGTTGATTTTAATTCACATTTGACTTTACAAGATTCGAATAATAATAATGATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCTCTCCCGATTTAGTAATAATAGCAGTTCAATCAGTGAAACAAGCAATGATATTCGTCTGGCGACTGTTAGACATATGAATTAATTCATGTCAGTGATGAGATAATGTATTGTGTCATTCAATTTTTGTCACTGATTACCAGAAAATTGCACAGCGAAGTGACATACTGCTATAACATGAATGCTATTATCACTACTGTCATCATATTTACTATTAAATTTGTGTTGCCTTTTTTCCCAACTTTCTAGGAAAATAATNNATGAT ATGANAAC ] [+] EMBL AI975910 [ TACCAGAAAATTGCACAGCGAAGTGACATACTGCTATAACATGAATGCTATTATCACTACTGTCATCATATTTACTATTAAATTTGTGTTGCCTTTTTTCCCAACTTTCTAGGAAAATAAT AATGATAATGAAAACGTTTCTTGCTACGGTGAATTTAATAAGATGAAAATTGGACTAGTTCATTTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTCTGTCTGTCTCTTTTTCAAACACACACACTTCTACAGCAACTAATTTTTTTTTCTAGTGCATTTTACTTTCGACTACACTACCACTACCAGTGACAACATAGCACTAATGGCACTAATGTTCTCATATTTTTCTAATTCTTATCGGGAAAACAATTAAGCTTCTATATATATATATATATTCTTGTTATCCGATTGTGAATATTTTACTTCTCGTTGACAGGCTNTTGTGTGTGGGTATGTTTGTTTGTGTTTATCGNTGTTTCTCTTATCTACCTTTTCTTATTTATGGAACAGTAACATCTTTATTGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||