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Schistosoma mansoni
cluster # 1885 cluster # 1885       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1885#0 length = 977 sequences # 2  

consensusID : consensus_1885#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 977
fasta sequence
                              [CGTTATTATATCCACTATCCCGGTTTCAAGTTGTTGCATCCCTTCGACATTTGACACGTTTTACAATTCTATCTTATATTCGACGTGATCATATTGATCAATTACCATTGCCGAAGATCACAATTAATTATCTAATGGAAAAACAATGTTATGTTGAATCTTTAGAAGATTTTGAAGAAGCTGTTCGAGAGCGACCACCACTGGAATTTCGTTCACGTTCAGCTATGGTTGATTTTAATTCACATTTGACTTTACAAGATTCGAATAATAATAATGATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCTCTCCCGATTTAGTAATAATAGCAGTTCAATCAGTGAAACAAGCAATGATATTCGTCTGGCGACTGTTAGACATATGAATTAATTCATGTCAGTGATGAGATAATGTATTGTGTCATTCAATTTTTGTCACTGATTACCAGAAAATTGCACAGCGAAGTGACATACTGCTATAACATGAATGCTATTATCACTACTGTCATCATATTTACTATTAAATTTGTGTTGCCTTTTTTCCCAACTTTCTAGGAAAATAATNNATGAT-ATGANAACGTTTCTTGCTACGGTGAATTTAATAAGATGAAAATTGGACTAGTTCATTTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTCTGTCTGTCTCTTTTTCAAACACACACACTTCTACAGCAACTAATTTTTTTTTCTAGTGCATTTTACTTTCGACTACACTACCACTACCAGTGACAACATAGCACTAATGGCACTAATGTTCTCATATTTTTCTAATTCTTATCGGGAAAACAATTAAGCTTCTATATATATATATATATTCTTGTTATCCGATTGTGAATATTTTACTTCTCGTTGACAGGCTNTTGTGTGTGGGTATGTTTGTTTGTGTTTATCGNTGTTTCTCTTATCTACCTTTTCTTATTTATGGAACAGTAACATCTTTATTGT]

[+] EMBL CD194758             [CGTTATTATATCCACTATCCCGGTTTCAAGTTGTTGCATCCCTTCGACATTTGACACGTTTTACAATTCTATCTTATATTCGACGTGATCATATTGATCAATTACCATTGCCGAAGATCACAATTAATTATCTAATGGAAAAACAATGTTATGTTGAATCTTTAGAAGATTTTGAAGAAGCTGTTCGAGAGCGACCACCACTGGAATTTCGTTCACGTTCAGCTATGGTTGATTTTAATTCACATTTGACTTTACAAGATTCGAATAATAATAATGATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATCTCTCCCGATTTAGTAATAATAGCAGTTCAATCAGTGAAACAAGCAATGATATTCGTCTGGCGACTGTTAGACATATGAATTAATTCATGTCAGTGATGAGATAATGTATTGTGTCATTCAATTTTTGTCACTGATTACCAGAAAATTGCACAGCGAAGTGACATACTGCTATAACATGAATGCTATTATCACTACTGTCATCATATTTACTATTAAATTTGTGTTGCCTTTTTTCCCAACTTTCTAGGAAAATAATNNATGAT ATGANAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI975910             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACCAGAAAATTGCACAGCGAAGTGACATACTGCTATAACATGAATGCTATTATCACTACTGTCATCATATTTACTATTAAATTTGTGTTGCCTTTTTTCCCAACTTTCTAGGAAAATAAT AATGATAATGAAAACGTTTCTTGCTACGGTGAATTTAATAAGATGAAAATTGGACTAGTTCATTTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTCTGTCTGTCTCTTTTTCAAACACACACACTTCTACAGCAACTAATTTTTTTTTCTAGTGCATTTTACTTTCGACTACACTACCACTACCAGTGACAACATAGCACTAATGGCACTAATGTTCTCATATTTTTCTAATTCTTATCGGGAAAACAATTAAGCTTCTATATATATATATATATTCTTGTTATCCGATTGTGAATATTTTACTTCTCGTTGACAGGCTNTTGTGTGTGGGTATGTTTGTTTGTGTTTATCGNTGTTTCTCTTATCTACCTTTTCTTATTTATGGAACAGTAACATCTTTATTGT]


>consensus_1885#0 CGTTATTATATCCACTATCCCGGTTTCAAGTTGTTGCATCCCTTCGACATTTGACACGTT TTACAATTCTATCTTATATTCGACGTGATCATATTGATCAATTACCATTGCCGAAGATCA CAATTAATTATCTAATGGAAAAACAATGTTATGTTGAATCTTTAGAAGATTTTGAAGAAG CTGTTCGAGAGCGACCACCACTGGAATTTCGTTCACGTTCAGCTATGGTTGATTTTAATT CACATTTGACTTTACAAGATTCGAATAATAATAATGATAATAACAATAATAATAATAATA ATAATAATAATAATAATCTCTCCCGATTTAGTAATAATAGCAGTTCAATCAGTGAAACAA GCAATGATATTCGTCTGGCGACTGTTAGACATATGAATTAATTCATGTCAGTGATGAGAT AATGTATTGTGTCATTCAATTTTTGTCACTGATTACCAGAAAATTGCACAGCGAAGTGAC ATACTGCTATAACATGAATGCTATTATCACTACTGTCATCATATTTACTATTAAATTTGT GTTGCCTTTTTTCCCAACTTTCTAGGAAAATAATNNATGATATGANAACGTTTCTTGCTA CGGTGAATTTAATAAGATGAAAATTGGACTAGTTCATTTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTC TTTTTCTCTGTCTGTCTCTTTTTCAAACACACACACTTCTACAGCAACTAATTTTTTTTT CTAGTGCATTTTACTTTCGACTACACTACCACTACCAGTGACAACATAGCACTAATGGCA CTAATGTTCTCATATTTTTCTAATTCTTATCGGGAAAACAATTAAGCTTCTATATATATA TATATATTCTTGTTATCCGATTGTGAATATTTTACTTCTCGTTGACAGGCTNTTGTGTGT GGGTATGTTTGTTTGTGTTTATCGNTGTTTCTCTTATCTACCTTTTCTTATTTATGGAAC AGTAACATCTTTATTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)