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Schistosoma mansoni
cluster # 1910 cluster # 1910       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1910#0 length = 751 sequences # 2  

consensusID : consensus_1910#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 751
fasta sequence
                              [GAGCCAGATTCGGCCGAGGATTATCCACGTTTATACATTCGGCTGTATCGTTTATTGGACGAAACTTTGTTTGAATGTCCAGACGTTAAACCTTTTCTGATGGATTTAGATATTTATTTAAGCTCCATACATTTAGCTACATCAGTTGTTGCATCATTCATAAAACGACTATCTCAATTATCTTTATTCAGTCCAATTTCACTTATACCTGCAATACTTTTAATTATTTTCAATGGTTTGAAAAATCATCCTCATTGTCGTGTTTTAATTAACTGTAAACAGAAAAAGTCACAAAAATTAAATAACATTCAATCAGATGATGCATTACATGCACAATCAATTGGTGATCCTTATAATTGGGAAGCAGATACTTTTGATTTATCTAGAGCATTAGAAAGTAGTCTATGGGAAGTTTATGCACTAATTGGTCATTATTCACCAGATATCTCATCATTAGCATATAAAATTTGTAATCCTGATCCAACGGATACGTTTAATTCTTCTGTAGCTGATATACTTGATAAACAAAAAAAGAGTATTAAAGAAGCAACCCGTTCTGTGAAGGAAGCATTGTACCTGTTATCTCAAACTAATATTACGATGCCAGAATTACCTCCACTTGATGGTTGGGCGTAATTAATTTTCCTTTTCTTACTTAATTCCTTTTTGGTGCAGAAACGTTTAAATTTTTATACAGCTTACTATGTGTGCAGAAACATTTTTAGTATAATATCTGGTTCTTTGTATATAC]

[+] EMBL CD080046             [GAGCCAGATTCGGCCGAGGATTATCCACGTTTATACATTCGGCTGTATCGTTTATTGGACGAAACTTTGTTTGAATGTCCAGACGTTAAACCTTTTCTGATGGATTTAGATATTTATTTAAGCTCCATACATTTAGCTACATCAGTTGTTGCATCATTCATAAAACGACTATCTCAATTATCTTTATTCAGTCCAATTTCACTTATACCTGCAATACTTTTAATTATTTTCAATGGTTTGAAAAATCATCCTCATTGTCGTGTTTTAATTAACTGTAAACAGAAAAAGTCACAAAAATTAAATAACATTCAATCAGATGATGCATTACATGCACAATCAATTGGTGATCCTTATAATTGGGAAGCAGATACTTTTGATTTATCTAGAGCATTAGAAAGTAGTCTATGGGAAGTTTATGCACTAATTGGTCATTATTCACCAGATATCTCATCATTAGCATATAAAATTTGTAATCCTGATCCAACGGATACGTTTAATTCTTCTGTAGCTGATATACTTGATAAACAAAAAAAGAGTATTAAAGAAGCAACCCGTTCTGTGAAGGAAGCATTGTACCTGTTATCTCAAACTAATATTACGATGCCAGAATTACCTCCACTTGATGGTTGGGCGTAATTAATTTTCCTTTTCTTACTTAATTCCTTTTTGGTGCAGAAACGTTTAAATTTTTATACAGCTTACTATGTGTGCAGAAACATTTTTAGTATAATATCTGGTTCTTTGTATATAC]
[+] EMBL CD137295             [                                                                                                                                                                           TCTCAATTATCTTTATTCAGTCCAATTTCACTTATACCTGCAATACTTTTAATTATTTTCAATGGTTTGAAAAATCATCCTCATTGTCGTGTTTTAATTAACTGTAAACAGAAAAAGTCACAAAAATTAAATAACATTCAATCAGATGATGCATTACATGCACAATCAATTGGTGATCCTTATAATTGGGAAGCAGATACTTTTGATTTATCTAGAGCATTAGAAAGTAGTCTATGGGAAGTTTATGCACTAATTGGTCATTATTCACCAGATATCTCATCATTAGCATATAAAATTTGTAATCCTGATCCAACGGATACGTTTAATTCTTCTGTAGCTGATATACTTGATAAACAAAAAAAGAGTATTAAAGAAG                                                                                                                                                                                                            ]


>consensus_1910#0 GAGCCAGATTCGGCCGAGGATTATCCACGTTTATACATTCGGCTGTATCGTTTATTGGAC GAAACTTTGTTTGAATGTCCAGACGTTAAACCTTTTCTGATGGATTTAGATATTTATTTA AGCTCCATACATTTAGCTACATCAGTTGTTGCATCATTCATAAAACGACTATCTCAATTA TCTTTATTCAGTCCAATTTCACTTATACCTGCAATACTTTTAATTATTTTCAATGGTTTG AAAAATCATCCTCATTGTCGTGTTTTAATTAACTGTAAACAGAAAAAGTCACAAAAATTA AATAACATTCAATCAGATGATGCATTACATGCACAATCAATTGGTGATCCTTATAATTGG GAAGCAGATACTTTTGATTTATCTAGAGCATTAGAAAGTAGTCTATGGGAAGTTTATGCA CTAATTGGTCATTATTCACCAGATATCTCATCATTAGCATATAAAATTTGTAATCCTGAT CCAACGGATACGTTTAATTCTTCTGTAGCTGATATACTTGATAAACAAAAAAAGAGTATT AAAGAAGCAACCCGTTCTGTGAAGGAAGCATTGTACCTGTTATCTCAAACTAATATTACG ATGCCAGAATTACCTCCACTTGATGGTTGGGCGTAATTAATTTTCCTTTTCTTACTTAAT TCCTTTTTGGTGCAGAAACGTTTAAATTTTTATACAGCTTACTATGTGTGCAGAAACATT TTTAGTATAATATCTGGTTCTTTGTATATAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)