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Schistosoma mansoni
cluster # 1911 cluster # 1911       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1911#0 length = 897 sequences # 2  

consensusID : consensus_1911#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 897
fasta sequence
                              [CTCGAGGGCCAAAATTCGGCACGAGGTCTAGTTGGATATCAGAGTAATAAAGTCCCAATTCTTATTCTTATCTTGTATACAAGTGGCTTCACTGATCCTACTGCAGTCACAAACTCAACATTACTGACGGTTTGTCAGATAAAAGTACCATGCAAACCGGCTGTTTTTAATGTTTTCAGTGCCTATTTCAACTAATATAGATTTTTTTTACGAAAACTATCTCCGAATTAATCATATCCTTTGGAAAAGAAAGATTAAGTATTGTTATTTTTCTTCCAGTTATTATTTCGTTTACCATCAACATGGGACATTCTAGAAATCAAACCATTCCTACATAATGCACTTAGATCTACTCTTCATGAATGGTCAGAACTTCAGTTAGAATATGGTTTAACTAAATATAATGCGAAATTATCTGTTGTCGATCTCCCTAAAAAATCAAATTGTTTATTAATTGAAGATGATACTTTGTGCTCTATATGCCATCAATCAATTTATGTATATGGTCCATCCGATAGCTTTGCTTGGCTTATTCCTAAAAATCAAGTTGTTCACACTCATTGTCTATCATCTAATCAGTGATAACAATCTTTGCTTATGCAATTCCTTTTTCCTCTTATTTTGNTACTTCCGTTGTTTGCCTAGTGCTTTCTTAATTTATTGATTNTGTTTTTTCTTCTATACTGTT-ATGATCAAAGTGATTCANNACCGAC-AACTGTTCTGCACTGTATTTAGTTAACTNTCTTTTTCTTTGNTTGATGTACATACTTACCTGTTTTCTATGAGC-AATACATTTTATTG-ATTGATATATCCATAATATTAACAACTTTATATTTTAAAAGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTATATGGT]

[+] EMBL CD080050             [CTCGAGGGCCAAAATTCGGCACGAGGTCTAGTTGGATATCAGAGTAATAAAGTCCCAATTCTTATTCTTATCTTGTATACAAGTGGCTTCACTGATCCTACTGCAGTCACAAACTCAACATTACTGACGGTTTGTCAGATAAAAGTACCATGCAAACCGGCTGTTTTTAATGTTTTCAGTGCCTATTTCAACTAATATAGATTTTTTTTACGAAAACTATCTCCGAATTAATCATATCCTTTGGAAAAGAAAGATTAAGTATTGTTATTTTTCTTCCAGTTATTATTTCGTTTACCATCAACATGGGACATTCTAGAAATCAAACCATTCCTACATAATGCACTTAGATCTACTCTTCATGAATGGTCAGAACTTCAGTTAGAATATGGTTTAACTAAATATAATGCGAAATTATCTGTTGTCGATCTCCCTAAAAAATCAAATTGTTTATTAATTGAAGATGATACTTTGTGCTCTATATGCCATCAATCAATTTATGTATATGGTCCATCCGATAGCTTTGCTTGGCTTATTCCTAAAAATCAAGTTGTTCACACTCATTGTCTATCATCTAATCAGTGATAACAATCTTTGCTTATGCAATTCCTTTTTCCTCTTATTTTGNTACTTCCGTTGTTTGCCTAGTGCTTTCTTAATTTATTGATTNTGTTTTTTCTTCTATACTGTT ATGATCAAAGTGATTCANNACCGAC AACTGTTCTGCACTGTATTTAGTTAACTNTCTTTTTCTTTGNTTGATGTACATACTTACCTGTTTTCTATGAGC AATACATTTTATTG ATTGATATATCC                                                                                    ]
[-] EMBL AI976119             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGTCAGAACTTCAGTTAGAATATGGTTTAACTAAATATAATGCGAAATTATCTGTTGTCGATCTCCCTAAAAAATCAAATTGTTTATTAATTGAAGATGATACTTTGTGCTCTATATGCCATCAATCAATTTATGTATATGGTCCATCCGATAGCTTTGCTTGGCTTATTCCTAAAAATCAAGTTGTTCACACTCATTGTCTATCATCTAATCAGTGATAACAATCTTTGCTTATGCAATTCCTTTTTCCTCTTATTTTG TACTTCCGTTGTTTGCCTAGTGCTTTCTT ATTTATTGATTTTGTTTTTTCTTCTATACTGTTGATGATCAAAGTGATTCA AACCGACAAACTGTTCTGCACTGTATTTAGTTAACTTTCTTTTTCTTTGTTTGATGTACATACTTACCTGTTTTCTATGAGCGATTACATTTTATTGTATTGATATATACATAATATTAACAACTTTATATTTTAAAAGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTATATGGT]


>consensus_1911#0 CTCGAGGGCCAAAATTCGGCACGAGGTCTAGTTGGATATCAGAGTAATAAAGTCCCAATT CTTATTCTTATCTTGTATACAAGTGGCTTCACTGATCCTACTGCAGTCACAAACTCAACA TTACTGACGGTTTGTCAGATAAAAGTACCATGCAAACCGGCTGTTTTTAATGTTTTCAGT GCCTATTTCAACTAATATAGATTTTTTTTACGAAAACTATCTCCGAATTAATCATATCCT TTGGAAAAGAAAGATTAAGTATTGTTATTTTTCTTCCAGTTATTATTTCGTTTACCATCA ACATGGGACATTCTAGAAATCAAACCATTCCTACATAATGCACTTAGATCTACTCTTCAT GAATGGTCAGAACTTCAGTTAGAATATGGTTTAACTAAATATAATGCGAAATTATCTGTT GTCGATCTCCCTAAAAAATCAAATTGTTTATTAATTGAAGATGATACTTTGTGCTCTATA TGCCATCAATCAATTTATGTATATGGTCCATCCGATAGCTTTGCTTGGCTTATTCCTAAA AATCAAGTTGTTCACACTCATTGTCTATCATCTAATCAGTGATAACAATCTTTGCTTATG CAATTCCTTTTTCCTCTTATTTTGNTACTTCCGTTGTTTGCCTAGTGCTTTCTTAATTTA TTGATTNTGTTTTTTCTTCTATACTGTTATGATCAAAGTGATTCANNACCGACAACTGTT CTGCACTGTATTTAGTTAACTNTCTTTTTCTTTGNTTGATGTACATACTTACCTGTTTTC TATGAGCAATACATTTTATTGATTGATATATCCATAATATTAACAACTTTATATTTTAAA AGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTATATGGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)