cluster # 1960

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 1960 cluster # 1960 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_1960#0 length = 628 sequences # 2

consensusID : consensus_1960#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 628
fasta sequence

                              [AATTAGCTCAATATTTAACTAATTGTGATTATCCTGCATTTGCATCGAAAATGATGAAAAAATTAAATAATATGGGTGTGTTCAAGAATGATGATATTTGGTTCTCTTCTTTTTATTTCTACAATACAACATGGAATTTTTCTGATATTTGGCCGGAATTCGCCACTGCTTTAGCAATTGCCGGTCTACCAAATCTACTTAATTTAAATATTGGACATCAACCATATTTAGAGAATTTAAGTAGTAAAAATGTATATTATTTAATTAAAGCTAGTTTATCTATCATACATAATATAGCTCGTGTTCCAGGTAATACACATTATTTTGCATCTGAATCAGTTCGGCAAGCATTACTAAATTTAGCTCAACGTGAAGAAGAATTTCTACGCTGTGTTTCCACCCTTTGTTTAGCTCATATTGTAACTGAATCAGAAATTCATTTAATTACTGACGTATCAAATGGTGGTATTGATTTGTTAAGAATTCTATTTGGCTATGTCACATCAGCTCGTGTTTCTGAGAAACGAAGGTGTCATGGATTCCAAGTGCTTGAATTATTATCTGCTGTTGCTGCTTTATCTGTTCTTGATCCTGTTAAGGCGAATTTACTATCATCACCTGTTAATGT]

[+] EMBL CD118046             [AATTAGCTCAATATTTAACTAATTGTGATTATCCTGCATTTGCATCGAAAATGATGAAAAAATTAAATAATATGGGTGTGTTCAAGAATGATGATATTTGGTTCTCTTCTTTTTATTTCTACAATACAACATGGAATTTTTCTGATATTTGGCCGGAATTCGCCACTGCTTTAGCAATTGCCGGTCTACCAAATCTACTTAATTTAAATATTGGACATCAACCATATTTAGAGAATTTAAGTAGTAAAAATGTATATTATTTAATTAAAGCTAGTTTATCTATCATACATAATATAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD146842             [                                                                                                                                                                                                                                        GAATTTAAGTAGTAAAAATGTATATTATTTAATTAAAGCTAGTTTATCTATCATACATAATATAGCTCGTGTTCCAGGTAATACACATTATTTTGCATCTGAATCAGTTCGGCAAGCATTACTAAATTTAGCTCAACGTGAAGAAGAATTTCTACGCTGTGTTTCCACCCTTTGTTTAGCTCATATTGTAACTGAATCAGAAATTCATTTAATTACTGACGTATCAAATGGTGGTATTGATTTGTTAAGAATTCTATTTGGCTATGTCACATCAGCTCGTGTTTCTGAGAAACGAAGGTGTCATGGATTCCAAGTGCTTGAATTATTATCTGCTGTTGCTGCTTTATCTGTTCTTGATCCTGTTAAGGCGAATTTACTATCATCACCTGTTAATGT]




>consensus_1960#0
AATTAGCTCAATATTTAACTAATTGTGATTATCCTGCATTTGCATCGAAAATGATGAAAA
AATTAAATAATATGGGTGTGTTCAAGAATGATGATATTTGGTTCTCTTCTTTTTATTTCT
ACAATACAACATGGAATTTTTCTGATATTTGGCCGGAATTCGCCACTGCTTTAGCAATTG
CCGGTCTACCAAATCTACTTAATTTAAATATTGGACATCAACCATATTTAGAGAATTTAA
GTAGTAAAAATGTATATTATTTAATTAAAGCTAGTTTATCTATCATACATAATATAGCTC
GTGTTCCAGGTAATACACATTATTTTGCATCTGAATCAGTTCGGCAAGCATTACTAAATT
TAGCTCAACGTGAAGAAGAATTTCTACGCTGTGTTTCCACCCTTTGTTTAGCTCATATTG
TAACTGAATCAGAAATTCATTTAATTACTGACGTATCAAATGGTGGTATTGATTTGTTAA
GAATTCTATTTGGCTATGTCACATCAGCTCGTGTTTCTGAGAAACGAAGGTGTCATGGAT
TCCAAGTGCTTGAATTATTATCTGCTGTTGCTGCTTTATCTGTTCTTGATCCTGTTAAGG
CGAATTTACTATCATCACCTGTTAATGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case