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Schistosoma mansoni
cluster # 2044 cluster # 2044       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2044#0 length = 950 sequences # 2  

consensusID : consensus_2044#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 950
fasta sequence
                              [CNAGGCCAATAATTCGGCACGACGGTAATTTACAGTTCGATAGTTTTTCTTTTATATTATTTGTATGCATGGCAACAATGTTTAGATTTTCTCTTGACAAAACGGCTTCATAATAATAATTATTATTATATTATTCACCTAACTTATTTGTTTGTAGTGTATTCTTACCGTTATAGATCAGAAGATTTGGGGTGGGGGGCTTTCTTGAAAATGTATGGAATGTTGAAGCTTCTAAATTGTCTTTTTTTTTCTCTATTTCCTTCCTTCTATATGACATATATATAGTTTGAAAGGGATTCAACAGAAAAATTTGGAGGACTTTCTCGAGAATGTTGAAGCTTCCAAATTGTCTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTCCTCTTCTATATTACGTATATCGTTTGAAAGGGATTCATCAGAAGATTTGAGGGGGACTTTCTTGAAAATGTTGGAGCTTCCAAATTGTCTTCCCCCCCCCTCTCTATCTCTATTTCCTCTCTTCTATATTACACATATACAGTTTGAAAAGGATTCAATCCTTATAATTGATCATACATCATTAAACTATTCATTGCCTTTTCTTAAATTTTACTTATTTCAGATATTCTAGAGTTATGTTGTATGTTTAGTTTCTAACGAACATACTCATCATCATTATTACCTTTATTATTTGTAAACATAACCACTGTTTCTAGGTATTTTGATGAATATTATTCATTTCAATTATAGTTTCACTAAGACATGTACTCTCACCTTACTCTTTCACACATACAGATCAATTCTGGTTTTTCTTTCTTCTCTCATTNGCATGTAAAATTTGTTTTTTCATTAGATTAATGCAGCGATTATATACATACATTTACATTATTAAATATTTGNGAATGCATGCATGGAACATGTGAAGTATGTGTGTATCGGGTTCGATATGTATTCACTATTAATTTATCTTTTG]

[+] EMBL CD081680             [CNAGGCCAATAATTCGGCACGACGGTAATTTACAGTTCGATAGTTTTTCTTTTATATTATTTGTATGCATGGCAACAATGTTTAGATTTTCTCTTGACAAAACGGCTTCATAATAATAATTATTATTATATTATTCACCTAACTTATTTGTTTGTAGTGTATTCTTACCGTTATAGATCAGAAGATTTGGGGTGGGGGGCTTTCTTGAAAATGTATGGAATGTTGAAGCTTCTAAATTGTCTTTTTTTTTCTCTATTTCCTTCCTTCTATATGACATATATATAGTTTGAAAGGGATTCAACAGAAAAATTTGGAGGACTTTCTCGAGAATGTTGAAGCTTCCAAATTGTCTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTCCTCTTCTATATTACGTATATCGTTTGAAAGGGATTCATCAGAAGATTTGAGGGGGACTTTCTTGAAAATGTTGGAGCTTCCAAATTGTCTTCCCCCCCCCTCTCTATCTCTATTTCCTCTCTTCTATATTACACATATACAGTTTGAAAAGGATTCAATCCTTATAATTGATCATACATCATTAAACTATTCATTGCCTTTTCTTAAATTTTACTTATTTCAGATATTCTAGAGTTATGTTGTATGTTTAGTTTCTAACGAACATACTCATCATCATTATTACCTTTATTATTTGTAAACATAACCACTGTTTCTAGGTATTTTGATGAATATTATTCATTTCAATTATAGTTTCACTAAGACATGTACTCTCACCTTACTCTTTCACACATACAGATCAATTCTGGTTTTTCTTTCTTCTCTCATTNGCATGTAAAATTTGTTTTTTCATTAGATTAATGCAGCGATTATATACATACATTTACATTATTAAATATTTGNGAATGCATGCATGGAACATGTGAAGTATGTGTGTATCGGGTTCGATATGTATTCACTATTAATTTATCTTTTG]
[+] EMBL CD141371             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTCCTCTCTTCTATATTACACATATACAGTTTGAAAAGGATTCAATCCTTATAATTGATCATACATCATTAAACTATTCATTGCCTTTTCTTAAATTTTACTTATTTCAGATATTCTAGAGTTATGTTGTATGTTTAGTTTCTAACGAACGTACTCATCATCATTATTACCTTTATTATTTGTAAACATAACCACTGTTTCTAGGTATTTTGATGAATATTATTCATTTCAATTATAGTTTCACTAAGACATGTACTCTCACCTTACTCTTTCACACATACAGATCAATTCTGt                                                                                                                                                                       ]


>consensus_2044#0 CNAGGCCAATAATTCGGCACGACGGTAATTTACAGTTCGATAGTTTTTCTTTTATATTAT TTGTATGCATGGCAACAATGTTTAGATTTTCTCTTGACAAAACGGCTTCATAATAATAAT TATTATTATATTATTCACCTAACTTATTTGTTTGTAGTGTATTCTTACCGTTATAGATCA GAAGATTTGGGGTGGGGGGCTTTCTTGAAAATGTATGGAATGTTGAAGCTTCTAAATTGT CTTTTTTTTTCTCTATTTCCTTCCTTCTATATGACATATATATAGTTTGAAAGGGATTCA ACAGAAAAATTTGGAGGACTTTCTCGAGAATGTTGAAGCTTCCAAATTGTCTTTTCTCTC TCTCTCTCTCTATTTCCTCTTCTATATTACGTATATCGTTTGAAAGGGATTCATCAGAAG ATTTGAGGGGGACTTTCTTGAAAATGTTGGAGCTTCCAAATTGTCTTCCCCCCCCCTCTC TATCTCTATTTCCTCTCTTCTATATTACACATATACAGTTTGAAAAGGATTCAATCCTTA TAATTGATCATACATCATTAAACTATTCATTGCCTTTTCTTAAATTTTACTTATTTCAGA TATTCTAGAGTTATGTTGTATGTTTAGTTTCTAACGAACATACTCATCATCATTATTACC TTTATTATTTGTAAACATAACCACTGTTTCTAGGTATTTTGATGAATATTATTCATTTCA ATTATAGTTTCACTAAGACATGTACTCTCACCTTACTCTTTCACACATACAGATCAATTC TGGTTTTTCTTTCTTCTCTCATTNGCATGTAAAATTTGTTTTTTCATTAGATTAATGCAG CGATTATATACATACATTTACATTATTAAATATTTGNGAATGCATGCATGGAACATGTGA AGTATGTGTGTATCGGGTTCGATATGTATTCACTATTAATTTATCTTTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)