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Schistosoma mansoni
cluster # 2082 cluster # 2082       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2082#0 length = 693 sequences # 2  

consensusID : consensus_2082#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 693
fasta sequence
                              [GCTCGAGGAACAAAAACAAAAAGTTGTCAAACTCAAACAAGTTCTAACATACATTGAATGAGAAAAAAATTTTACAAGCAATCAATTTTCCTTTTCTTGTTAGTATGGATTTTAGTTTTAAAGATAATTCAAATCTGTATATGGTACTTGAGTTTGTCAGTGGAGGTGAAATGTTTTCCTATTTAAGAAGAGTTGGAAAATTCAGTGAAGAAGATTCACGTTTCTATGCAAGTCAAGTTGTACTGGCATTTGAATATCTACATTCTTTTGATTTAATCTACAGGGATTTGAAACCTGAGAATTTATTGATTGCTAGTGATGGTTATTTAAAAGTCACGGACTTCGGATTCGCCAAAAAGATCAAAGGGCGAACATGGACATTATGTGGAACACCAGAATATCTTGCCCCTGAAATTATTCTAAGCAAAGGCTACAATAAAGCTGTGGATTGGTGGGCACTGGGTATTTTGATCTATGAAATGGCTTGTGGATATCCACCATTTTTTGCAGATCAACCTATAGAAATTTATGAAAAAATTGTTGCTGGTAAAGTAAGATTTCCCGGACATGTTAGTAGTGATTTGAAAAATCTTCTCAAACAATTGTTACAAACGGATTTAACANAACGTTACGGTAATTTAAAAAACGGTGTCGATGATATCAAATGTCATAAATGGTTCCGGCCACTAATTG]

[+] EMBL CD082068             [GCTCGAGGAACAAAAACAAAAAGTTGTCAAACTCAAACAAGTTCTAACATACATTGAATGAGAAAAAAATTTTACAAGCAATCAATTTTCCTTTTCTTGTTAGTATGGATTTTAGTTTTAAAGATAATTCAAATCTGTATATGGTACTTGAGTTTGTCAGTGGAGGTGAAATGTTTTCCTATTTAAGAAGAGTTGGAAAATTCAGTGAAGAAGATTCACGTTTCTATGCAAGTCAAGTTGTACTGGCATTTGAATATCTACATTCTTTTGATTTAATCTACAGGGATTTGAAACCTGAGAATTTATTGATTGCTAGTGATGGTTATTTAAAAGTCACGGACTTCGGATTCGCCAAAAAGATCAAAGGGCGAACATGGACATTATGTGGAACACCAGAATATCTTGCCCCTGAAATTATTCTAAGCAAAGGCTACAATAAAGCTGTGGATTGGTGGGCACTGGGTATTTTGATCTATGAAATGGCTTGTGGATATCCACCATTTTTTGCAGATCAACCTATAGAAATTTATGAAAAAATTGTTGCTGGTAAAGTAAGATTTCCCGGACATGTTAGTAGTGATTTGAAAAATCTTCTCAAACAATTGTTACAAACGGATTTAACANAACGTTACGGTAATTTAAAAAACGGTGTCGATGATATCAAATGTCATAAATGGTTCCGGCCACTAATTG]
[+] EMBL CD187810             [                                                                                                                                                                         AATGTTTTCCTATTTAAGAAGAGTTGGAAAATTCAGTGAAGAAGATTCACGTTTCTATGCAAGTCAAGTTGTACTGGCATTTGAATATCTACATTCTTTTGATTTAATCTACAGGGATTTGAAACCTGAGAATTTATTGATTGCTAGTGATGGTTATTTAAAAGTCACGGACTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_2082#0 GCTCGAGGAACAAAAACAAAAAGTTGTCAAACTCAAACAAGTTCTAACATACATTGAATG AGAAAAAAATTTTACAAGCAATCAATTTTCCTTTTCTTGTTAGTATGGATTTTAGTTTTA AAGATAATTCAAATCTGTATATGGTACTTGAGTTTGTCAGTGGAGGTGAAATGTTTTCCT ATTTAAGAAGAGTTGGAAAATTCAGTGAAGAAGATTCACGTTTCTATGCAAGTCAAGTTG TACTGGCATTTGAATATCTACATTCTTTTGATTTAATCTACAGGGATTTGAAACCTGAGA ATTTATTGATTGCTAGTGATGGTTATTTAAAAGTCACGGACTTCGGATTCGCCAAAAAGA TCAAAGGGCGAACATGGACATTATGTGGAACACCAGAATATCTTGCCCCTGAAATTATTC TAAGCAAAGGCTACAATAAAGCTGTGGATTGGTGGGCACTGGGTATTTTGATCTATGAAA TGGCTTGTGGATATCCACCATTTTTTGCAGATCAACCTATAGAAATTTATGAAAAAATTG TTGCTGGTAAAGTAAGATTTCCCGGACATGTTAGTAGTGATTTGAAAAATCTTCTCAAAC AATTGTTACAAACGGATTTAACANAACGTTACGGTAATTTAAAAAACGGTGTCGATGATA TCAAATGTCATAAATGGTTCCGGCCACTAATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)