cluster # 2141

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Schistosoma mansoni
cluster # 2141 cluster # 2141 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2141#0 length = 576 sequences # 2

consensusID : consensus_2141#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 576
fasta sequence

                              [GAGGTTTTTCTCCGATTAGTTTGGCTAGTTTTTGTGAAAATACGTTTCTTGATGTATGCGTAACTGAACCGGGGCTCTTGAGAAATCACTCGTTTATGGAAATTCAGCAGCTATCGTAAACGTTGTTTTTGGTAACATCAATATCAAAAGTATTGATCCATTCACTATCACATCAATTAATTTAAGTTGAAAAATTGCTTGATCATAATTCATGCAAACGCTTCTTATTCTTAACTACCTGATTAATCAATACCAGTTTATACGCCATGGCTAAATTTGAGTCACGGCTTATTACAATGACCCAGGACAATTTGGAGTCTGTCTTAATAATAAGCTTAATTTTCTGGACTTTCAAGTCGATTTGATATTACTACATAGCTACTTCCACCACACATAATTTGGAGAAATATGAACCCAAATATTGCCAATATTTGAATGTTCATGGACAAAGTTACTTAATTTTAATTCCGATTCCTCAATCCTTTTTGACCTCTGTACCTGAACTTTNTGTGAATGAACTTATAAGCCTCTAGTTCTTGTATATTGTATTTTTGAGAGATATTATTTCCTCTGGAA]

[+] EMBL CD083022             [GAGGTTTTTCTCCGATTAGTTTGGCTAGTTTTTGTGAAAATACGTTTCTTGATGTATGCGTAACTGAACCGGGGCTCTTGAGAAATCACTCGTTTATGGAAATTCAGCAGCTATCGTAAACGTTGTTTTTGGTAACATCAATATCAAAAGTATTGATCCATTCACTATCACATCAATTAATTTAAGTTGAAAAATTGCTTGATCATAATTCATGCAAACGCTTCTTATTCTTAACTACCTGATTAATCAATACCAGTTTATACGCCATGGCTAAATTTGAGTCACGGCTTATTACAATGACCCAGGACAATTTGGAGTCTGTCTTAATAATAAGCTTAATTTTCTGGACTTTCAAGTCGATTTGATATTACTACATAGCTACTTCCACCACACATAATTTGGAGAAATATGAACCCAAATATTGCCAATATTTGAATGTTCATGGACAAAGTTACTTAATTTTAATTCCGATTCCTCAATCCTTTTTGACCTCTGTACCTGAACTTTNTGTGAATGAACTTATAAGCCTCTAGTTCTTGTATATTGTATTTTTGAGAGATATTATTTCCTCTGGAA]
[+] EMBL BG930906             [                                                                          tTCTTGAGAAATCACTCGTTTATGGAAATTCAGCAGCTATCGTAAACGTTGTTTTTGGTAACATCAATATCAAAAGTATTGATCCATTCACTATCACATCAATTAATTTAAGTTGAAAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]




>consensus_2141#0
GAGGTTTTTCTCCGATTAGTTTGGCTAGTTTTTGTGAAAATACGTTTCTTGATGTATGCG
TAACTGAACCGGGGCTCTTGAGAAATCACTCGTTTATGGAAATTCAGCAGCTATCGTAAA
CGTTGTTTTTGGTAACATCAATATCAAAAGTATTGATCCATTCACTATCACATCAATTAA
TTTAAGTTGAAAAATTGCTTGATCATAATTCATGCAAACGCTTCTTATTCTTAACTACCT
GATTAATCAATACCAGTTTATACGCCATGGCTAAATTTGAGTCACGGCTTATTACAATGA
CCCAGGACAATTTGGAGTCTGTCTTAATAATAAGCTTAATTTTCTGGACTTTCAAGTCGA
TTTGATATTACTACATAGCTACTTCCACCACACATAATTTGGAGAAATATGAACCCAAAT
ATTGCCAATATTTGAATGTTCATGGACAAAGTTACTTAATTTTAATTCCGATTCCTCAAT
CCTTTTTGACCTCTGTACCTGAACTTTNTGTGAATGAACTTATAAGCCTCTAGTTCTTGT
ATATTGTATTTTTGAGAGATATTATTTCCTCTGGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case