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Schistosoma mansoni
cluster # 2148 cluster # 2148       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2148#0 length = 932 sequences # 2  

consensusID : consensus_2148#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 932
fasta sequence
                              [GGATGATACCATTCATCACAACCATCACAAGCAATATATACTCTTGTTGGTTCATACGGTGTACGACAAACACAATAAAGCATTTCATTAGCTTTTAATTCAGCTTGTTTACAATCAGGACAATGCCAAGAATCACCTAATTTATCAGAATCTTTAGGATCCAAACCAACACATTCAAAATGAAACCAATCTCGACAAAGATCACAACCAATGTATTCCCTTAATGGATTGTATGGAGTTTTACAAACACAATACACTGGAGAATTAGAAGATACATTTTGTAAGACACTAGTAATTGATTCGGTTGGTGCTTCATTTTTGTCAGATTTTTCAGATAACTTAACACGGCCTCCCCCTTTGTTACTATTATTATTACGTCCAGTGCCACTGGCATTACTACTTCCTCGTTTAGACCCACCCCCACTTACAGATGATCTTGGTGATTTTATTGATTCTGTAACACTATAATTGTGTTCACTAGCATCTGAATTTGTAGATTCATGTTTTAATCTTTTTGTTTTTGTAGTTACCGAACGATTGGTCTTAGTTGGAGCCGTTGATTTTTGTTGATATATATTATTTTCATAATCATCACCTAAACCAGGTGATGTGCTTGCAGTAGAACAAGAACTATGAGTAGTAATAGTAGTAGTATTATCATCATTATCTTTTTTTGATTGTTTAATAGATAATTTCATTGTTAAACGATTATTATTTTGTGTTTTTTTAGATAATTTAATAAATTCATGATTTAATGCACTTTTTCGTGGAATACGATTATTTGCTAATAATTCTGATTGGTTAGATTGTTTATTATTAATTAAATTAGGATTTTTATTTTCATCATCCCCAGAAGAAGATGATGCTGCTGATGATAATGGTGANAATGTTGGAGTAATTTTTCGTTTTGTACGTTTATGATAAACATCATT]

[-] EMBL CD064120             [GGATGATACCATTCATCACAACCATCACAAGCAATATATACTCTTGTTGGTTCATACGGTGTACGACAAACACAATAAAGCATTTCATTAGCTTTTAATTCAGCTTGTTTACAATCAGGACAATGCCAAGAATCACCTAATTTATCAGAATCTTTAGGATCCAAACCAACACATTCAAAATGAAACCAATCTCGACAAAGATCACAACCAATGTATTCCCTTAATGGATTGTATGGAGTTTTACAAACACAATACACTGGAGAATTAGAAGATACATTTTGTAAGACACTAGTAATTGATTCGGTTGGTGCTTCATTTTTGTCAGATTTTTCAGATAACTTAACACGGCCTCCCCCTTTGTTACTATTATTATTACGTCCAGTGCCACTGGCATTACTACTTCCTCGTTTAGACCCACCCCCACTTACAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD153287             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTGTCAGATTTTTCAGATAACTTAACACGGCCTCCCCCTTTGTTACTATTATTATTACGTCCAGTGCCACTGGCATTACTACTTCCTCGTTTAGACCCACCCCCACTTACAGATGATCTTGGTGATTTTATTGATTCTGTAACACTATAATTGTGTTCACTAGCATCTGAATTTGTAGATTCATGTTTTAATCTTTTTGTTTTTGTAGTTACCGAACGATTGGTCTTAGTTGGAGCCGTTGATTTTTGTTGATATATATTATTTTCATAATCATCACCTAAACCAGGTGATGTGCTTGCAGTAGAACAAGAACTATGAGTAGTAATAGTAGTAGTATTATCATCATTATCTTTTTTTGATTGTTTAATAGATAATTTCATTGTTAAACGATTATTATTTTGTGTTTTTTTAGATAATTTAATAAATTCATGATTTAATGCACTTTTTCGTGGAATACGATTATTTGCTAATAATTCTGATTGGTTAGATTGTTTATTATTAATTAAATTAGGATTTTTATTTTCATCATCCCCAGAAGAAGATGATGCTGCTGATGATAATGGTGANAATGTTGGAGTAATTTTTCGTTTTGTACGTTTATGATAAACATCATT]


>consensus_2148#0 GGATGATACCATTCATCACAACCATCACAAGCAATATATACTCTTGTTGGTTCATACGGT GTACGACAAACACAATAAAGCATTTCATTAGCTTTTAATTCAGCTTGTTTACAATCAGGA CAATGCCAAGAATCACCTAATTTATCAGAATCTTTAGGATCCAAACCAACACATTCAAAA TGAAACCAATCTCGACAAAGATCACAACCAATGTATTCCCTTAATGGATTGTATGGAGTT TTACAAACACAATACACTGGAGAATTAGAAGATACATTTTGTAAGACACTAGTAATTGAT TCGGTTGGTGCTTCATTTTTGTCAGATTTTTCAGATAACTTAACACGGCCTCCCCCTTTG TTACTATTATTATTACGTCCAGTGCCACTGGCATTACTACTTCCTCGTTTAGACCCACCC CCACTTACAGATGATCTTGGTGATTTTATTGATTCTGTAACACTATAATTGTGTTCACTA GCATCTGAATTTGTAGATTCATGTTTTAATCTTTTTGTTTTTGTAGTTACCGAACGATTG GTCTTAGTTGGAGCCGTTGATTTTTGTTGATATATATTATTTTCATAATCATCACCTAAA CCAGGTGATGTGCTTGCAGTAGAACAAGAACTATGAGTAGTAATAGTAGTAGTATTATCA TCATTATCTTTTTTTGATTGTTTAATAGATAATTTCATTGTTAAACGATTATTATTTTGT GTTTTTTTAGATAATTTAATAAATTCATGATTTAATGCACTTTTTCGTGGAATACGATTA TTTGCTAATAATTCTGATTGGTTAGATTGTTTATTATTAATTAAATTAGGATTTTTATTT TCATCATCCCCAGAAGAAGATGATGCTGCTGATGATAATGGTGANAATGTTGGAGTAATT TTTCGTTTTGTACGTTTATGATAAACATCATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)