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Schistosoma mansoni
cluster # 2344 cluster # 2344       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2344#0 length = 608 sequences # 2  

consensusID : consensus_2344#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 608
fasta sequence
                              [TTTCACTGCCCCTTCAGTCTTATCACTGGCTCCTTTCTTACAGCTACTCAGGATTCCGATTTTACCACATTGACATCATAACTAATCGATCGACTATCTTATAAGATGGTAGCTTCCAGTTCCAGCAACCGCATACTTACTTATGCTTTGGACCTATTGGCAACCGAATAACGGTTAAATTCACAAACATCCAATATTCATTATATTTGTGACCAGTTTATACTTGCCGAATGATTTATTTTCGCTCGTTTCTTGCTGTTTCAGAAGGGTTTCAGGTTTCCGATAATGTTCATGGGGTAATAGTCACTAACTAACATCAGTTCCGTGGTTGTGTGAGGATTTGCGTATCATATTATCTGAGTGGACGCGTTTGTCTTCGGGCTAATGGGTACGATAGGCTATCACATTACCAGGTGGTTTGGTTACAATGTGAAAATGATGAGGTGATATGTCGAGAGCTAATAGAAGACGAATGTTTCCAAAAGTATGTAAATTATCCAACTAATTAATAATTTAGATAAAGTGTGAAACCAAAATGTAATGTTAAAAGGGGAAAGAGATATGACGGTGAGAGAGAAAAGAAGTAGTTACTGATGTAGTGAACGAAA]

[+] EMBL CD085600             [TTTCACTGCCCCTTCAGTCTTATCACTGGCTCCTTTCTTACAGCTACTCAGGATTCCGATTTTACCACATTGACATCATAACTAATCGATCGACTATCTTATAAGATGGTAGCTTCCAGTTCCAGCAACCGCATACTTACTTATGCTTTGGACCTATTGGCAACCGAATAACGGTTAAATTCACAAACATCCAATATTCATTATATTTGTGACCAGTTTATACTTGCCGAATGATTTATTTTCGCTCGTTTCTTGCTGTTTCAGAAGGGTTTCAGGTTTCCGATAATGTTCATGGGGTAATAGTCACTAACTAACATCAGTTCCGTGGTTGTGTGAGGATTTGCGTATCATATTATCTGAGTGGACGCGTTTGTCTTCGGGCTAATGGGTACGATAGGCTATCACATTACCAGGTGGTTTGGTTACAATGTGAAAATGATGAGGTGATATGTCGAGAGCTAATAGAAGACGAATGTTTCCAAAAGTATGTAAATTATCCAACTAATTAATAATTTAGATAAAGTGTGAAACCAAAATGTAATGTTAAAAGGGGAAAGAGATATGACGGTGAGAGAGAAAAGAAGTAGTTACTGATGTAGTGAACGAAA]
[+] EMBL CD085488             [tcTCACTGCCCCTTCAGTCTTATCACTGGCTCCTTTCTTACAGCTACTCAGGATTCCGATTTTACCACATTGACATCATAACTAATCGATCGACTATCTTATAAGATGGTAGCTTCCAGTTCCAGCAACCGCATACTTACTTATGCTTTGGACCTATTGGCAACCGAATAACGGTTAAATTCACAAACATCCAATATTCATTATATTTGTGACCAGTTTATACTTGCCGAATGATTTATTTTCGCTCGTTTCTTACTGTTTCAGAAGGGTTTCAGGTTTCCGATAATGTTCATGGGGTAATAGTCACTAACTAACATCAGTTCCGTGGTTGTGTGAGGATTTGCGTATCATATTATCTGAGTGGACGCGTTTGTCTTCGGGCTAATGGGTACGATAGGCTATCACATTACCAGGTGGTTTGGTTACAATGTGACAATGATGAGGTGATATGTCGAGAGCTAATAGAACACGAATGTTTCCAAAAGTATGTAAATTATCCAACTAA                                                                                                       ]


>consensus_2344#0 TTTCACTGCCCCTTCAGTCTTATCACTGGCTCCTTTCTTACAGCTACTCAGGATTCCGAT TTTACCACATTGACATCATAACTAATCGATCGACTATCTTATAAGATGGTAGCTTCCAGT TCCAGCAACCGCATACTTACTTATGCTTTGGACCTATTGGCAACCGAATAACGGTTAAAT TCACAAACATCCAATATTCATTATATTTGTGACCAGTTTATACTTGCCGAATGATTTATT TTCGCTCGTTTCTTGCTGTTTCAGAAGGGTTTCAGGTTTCCGATAATGTTCATGGGGTAA TAGTCACTAACTAACATCAGTTCCGTGGTTGTGTGAGGATTTGCGTATCATATTATCTGA GTGGACGCGTTTGTCTTCGGGCTAATGGGTACGATAGGCTATCACATTACCAGGTGGTTT GGTTACAATGTGAAAATGATGAGGTGATATGTCGAGAGCTAATAGAAGACGAATGTTTCC AAAAGTATGTAAATTATCCAACTAATTAATAATTTAGATAAAGTGTGAAACCAAAATGTA ATGTTAAAAGGGGAAAGAGATATGACGGTGAGAGAGAAAAGAAGTAGTTACTGATGTAGT GAACGAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)