cluster # 2456

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Schistosoma mansoni
cluster # 2456 cluster # 2456 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2456#0 length = 603 sequences # 2

consensusID : consensus_2456#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 603
fasta sequence

                              [ACATATTCAGCAATATATGATGTGATTCAAATATAATCGGATGTGTTGTGATCTTAAAATTACCTATTTTCTTTTTTCAACGGATTTCAAACAATAATCTATTTAAGGTATTGACTTATATAAAATTGACGGAATCTTTTCTAATCCACAAACCCGCTAGTTGCTTCGTGGGGATGTTAAGAGTTTTTTGTATTTGTTATCTTTATCGATGACCGA-GGGCAAATGAA-TTAAGTAAGGACTAAAATCCAAATGTTATTGAATATATATTTCACTGAT-TGAATTCACTAGCATGTACAGTAGTAGTAAACAATAAAGTTATAGTTGGATTGAATAGGCACAACTGGACTGAAATAAAATCAGTATTGCACGAACACCAGGTAGAGGCCTCTTTGTAATTGTATTCCATTTATATTGACACTGACACTTAGGGTCACCGGTAATGGTATTAGAATATAAATAACAGTGGTAACGGAATAACCGGCAGTTACGTTGTTGTAAAGTAAATCCGTGACCAAACTAGACTGGTATAATTTGGACTATCATGATATGAATACAAGCTGTCCGGTGTCAATTAGCCAGCGTATCAGTCAATCAGTCAGCTAC]

[+] EMBL CD087652             [ACATATTCAGCAATATATGATGTGATTCAAATATAATCGGATGTGTTGTGATCTTAAAATTACCTATTTTCTTTTTTCAACGGATTTCAAACAATAATCTATTTAAGGTATTGACTTATATAAAATTGACGGAATCTTTTCTAATCCACAAACCCGCTAGTTGCTTCGTGGGGATGTTAAGAGTTTTTTGTATTTGTTATCTTTATCGATGACCGA GGGCAAATGAA TTAAGTAAGGACTAAAATCCAAATGTTATTGAATATATATTTCACTGAT TGAATTCACTAGCATGTACAGTAGTAGTAAACAATAAAGTTATAGTTGGATTGAATAGGCACAACTGGACTGAAATAAAATCAGTATTGCACGAACACCAGGTAGAGGCCTCTTTGTAATTGTATTCCATTTATATTGACACTGACACTTAGGGTCACCGGTAATGGTATTAGAATATAAATAACAGTGGTAACGGAATAACCGGCAGTTACGTTGTTGTAAAGTAAATCCGTGACCAAACTAGACTGGTATAATTTGGACTATCATGATATGAATACAAGCTGTCCGGTGTCAATTAGCCAGCGTATCAGTCAATCAGTCAGCTAC]
[-] EMBL CD181400             [                                                                                                                                                                                                                   gCCGANGGGC AATGAANTTAAGTAAGGNCTAAAATCCAAATGTTATGAAATATATA TTCACTGATGAAAATTCACTAGCATGTACAGTAGTAGTAANCAATAAAG TATAGTTTGATTGAATAGGCACAACTGGACTGAAATAAAATCAGTATTGCACGAACACCAGGTAGAGGCCTCTTTGTAATTGTATTCCATTTATATTGACACTGACACTTAGGGTCACCAGTAATGGTATTAGAATATAAATAACAGTGGTAACGGAATAACCGGCAGTTACGTTGTTGTAAAGTAAATCCGTGACCAAACTAGACTGGTATAATTTGGACTATCATGATATGAATACAAGCTGTCCGGTGTCCTTTAGCCAGCGTATCA                 ]




>consensus_2456#0
ACATATTCAGCAATATATGATGTGATTCAAATATAATCGGATGTGTTGTGATCTTAAAAT
TACCTATTTTCTTTTTTCAACGGATTTCAAACAATAATCTATTTAAGGTATTGACTTATA
TAAAATTGACGGAATCTTTTCTAATCCACAAACCCGCTAGTTGCTTCGTGGGGATGTTAA
GAGTTTTTTGTATTTGTTATCTTTATCGATGACCGAGGGCAAATGAATTAAGTAAGGACT
AAAATCCAAATGTTATTGAATATATATTTCACTGATTGAATTCACTAGCATGTACAGTAG
TAGTAAACAATAAAGTTATAGTTGGATTGAATAGGCACAACTGGACTGAAATAAAATCAG
TATTGCACGAACACCAGGTAGAGGCCTCTTTGTAATTGTATTCCATTTATATTGACACTG
ACACTTAGGGTCACCGGTAATGGTATTAGAATATAAATAACAGTGGTAACGGAATAACCG
GCAGTTACGTTGTTGTAAAGTAAATCCGTGACCAAACTAGACTGGTATAATTTGGACTAT
CATGATATGAATACAAGCTGTCCGGTGTCAATTAGCCAGCGTATCAGTCAATCAGTCAGC
TAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case