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Schistosoma mansoni
cluster # 2517 cluster # 2517       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2517#0 length = 763 sequences # 2  

consensusID : consensus_2517#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 763
fasta sequence
                              [AGAATGAAAACAGATATCTGGCGTGATTTTCAAGTGAAAACCGCATATACAGCTAAATGATGGGAAGCTATGTCCGAGGTTTTTGGGGTATACGTAAGGTGTTTTCGAGGTGCTTTTGGGATATGTATTCCCGCGATATAAAACGAATGCGATTCACTAATTCCATAACTATTGTTTGCACTTTATTATGGTTACTTCGGTAGTATGATTATTTGCTTGATTTTTGAGGTATTGAGATCTCCCTATTTCACTTTACTGGGTTAGCTAAACAATAAAGCTCTAAAAGGACACTTTAATTAACCCTTCTGTGGGTATTGTTACACCCTTAACTACATTATTACATCTGGGCTCTAAACAAATCCTGAGTGTGACTTATTACTATAATGGATCTTGATGATTACTATTTCATCATTCTATCCAAATTGATGCGGCTTTCAAGTAAATTATTGTCATACTATATATTATTCTCATAAAAATACCTTCCAGGTATTCTGGTCAACAACAGTAGTCCCATGCGTTATGAGGACTGACGCACGAGTGATGACGGTCATCAATATTCATTTGTGAAGCGTGGATCTAAGGGNCAT-AATATGAATTTCAGCAACTGCCATGTATGTATTTTTTGCTATACCACTTCTTTCAAGTAGCATTTGCATTCGTCTGAAGGTTTTCAGTTGTCGAAAATATTCAATCTACTGCGTGTTTTCCTCCCAAAGAAAGACAAAATCTTTGACGAACAATGTGTTCGTTCCCCATGTCTTAC]

[+] EMBL CD089052             [AGAATGAAAACAGATATCTGGCGTGATTTTCAAGTGAAAACCGCATATACAGCTAAATGATGGGAAGCTATGTCCGAGGTTTTTGGGGTATACGTAAGGTGTTTTCGAGGTGCTTTTGGGATATGTATTCCCGCGATATAAAACGAATGCGATTCACTAATTCCATAACTATTGTTTGCACTTTATTATGGTTACTTCGGTAGTATGATTATTTGCTTGATTTTTGAGGTATTGAGATCTCCCTATTTCACTTTACTGGGTTAGCTAAACAATAAAGCTCTAAAAGGACACTTTAATTAACCCTTCTGTGGGTATTGTTACACCCTTAACTACATTATTACATCTGGGCTCTAAACAAATCCTGAGTGTGACTTATTACTATAATGGATCTTGATGATTACTATTTCATCATTCTATCCAAATTGATGCGGCTTTCAAGTAAATTATTGTCATACTATATATTATTCTCATAAAAATACCTTCCAGGTATTCTGGTCAACAACAGTAGTCCCATGCGTTATGAGGACTGACGCACGAGTGATGACGGTCATCAATATTCATTTGTGAAGCGTGGATCTAAGGGNCAT AATATG                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD089193             [                                                                                                                                                                                        ATTATGGTTACTTCGGTAGTATGATTATTTGCTTGATTTNTGAGGTATTGAGATCTCCCTATTTCACTNTACTGGGTTAGCTAAACAATAAAGCTCTAAAAGGACACTTTAATTAACCCTTCTGTGGGTATTGTTACACCCTTAACTACATTATTACATCTGGGCTCTAAACAAATCCTGAGTGTGACTTATTACTATAATGGATCTTGATGATTACTATTTCATCATTCTATCCAAATTGATGCGGCTTTCAAGTAAATTATTGTCATACTATATATTATTCTCATAAAAATACCTTCCAGGTATTCTGGTCAACAACAGTAGTCCCATGCGTTATGAGGACTGACGCACGAGTGATGACGGTCATCAATATTCATTTGTGAAGCGTGGATCTAA GGCAATAAATATGAATTTCAGCAACTGCCATGTATGTATTTTTTGCTATACCACTTCTTTCAAGTAGCATTTGCATTCGTCTGAAGGTTTTCAGTTGTCGAAAATATTCAATCTACTGCGTGTTTTCCTCCCAAAGAAAGACAAAATCTTTGACGAACAATGTGTTCGTTCCCCATGTCTTAC]


>consensus_2517#0 AGAATGAAAACAGATATCTGGCGTGATTTTCAAGTGAAAACCGCATATACAGCTAAATGA TGGGAAGCTATGTCCGAGGTTTTTGGGGTATACGTAAGGTGTTTTCGAGGTGCTTTTGGG ATATGTATTCCCGCGATATAAAACGAATGCGATTCACTAATTCCATAACTATTGTTTGCA CTTTATTATGGTTACTTCGGTAGTATGATTATTTGCTTGATTTTTGAGGTATTGAGATCT CCCTATTTCACTTTACTGGGTTAGCTAAACAATAAAGCTCTAAAAGGACACTTTAATTAA CCCTTCTGTGGGTATTGTTACACCCTTAACTACATTATTACATCTGGGCTCTAAACAAAT CCTGAGTGTGACTTATTACTATAATGGATCTTGATGATTACTATTTCATCATTCTATCCA AATTGATGCGGCTTTCAAGTAAATTATTGTCATACTATATATTATTCTCATAAAAATACC TTCCAGGTATTCTGGTCAACAACAGTAGTCCCATGCGTTATGAGGACTGACGCACGAGTG ATGACGGTCATCAATATTCATTTGTGAAGCGTGGATCTAAGGGNCATAATATGAATTTCA GCAACTGCCATGTATGTATTTTTTGCTATACCACTTCTTTCAAGTAGCATTTGCATTCGT CTGAAGGTTTTCAGTTGTCGAAAATATTCAATCTACTGCGTGTTTTCCTCCCAAAGAAAG ACAAAATCTTTGACGAACAATGTGTTCGTTCCCCATGTCTTAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)