Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 2600 cluster # 2600       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2600#0 length = 407 sequences # 2  

consensusID : consensus_2600#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 407
fasta sequence
                              [AAGAATACAATGCTTAACGTAGACGCAACAGAAGCTCTGGATGAAGCAATGTATCAACTTGGTCTGGATATTGAAGAATTAGAAGAAATGGAATGCGATGCAGGACTTGGCAATGGTGGTTTGGGTCGACTGGCTGCATGTTTTCTTGACTCAATGGCTACAATCGGTTTACCAGCTTATGGATATGGTATACGTTATGAAAATGGCGCTTTTCATCAGATGATAAAGGATGGATGGCAGGTTGAAGAACCGGATGAATGGTTACTTTATGGTAATCCCTGGGAGAAAG-ACGCCCTGAATCCACTCGCATAGTTCAATTTTACGGTAGAGTTATACGTAATCATTTGGATCAATGTAAATGGATTGACACCGNNAAC-ATATGTGCCCTACCTTATGAAAGTCCTATA]

[+] EMBL CD090416             [AAGAATACAATGCTTAACGTAGACGCAACAGAAGCTCTGGATGAAGCAATGTATCAACTTGGTCTGGATATTGAAGAATTAGAAGAAATGGAATGCGATGCAGGACTTGGCAATGGTGGTTTGGGTCGACTGGCTGCATGTTTTCTTGACTCAATGGCTACAATCGGTTTACCAGCTTATGGATATGGTATACGTTATGAAAATGGCGCTTTTCATCAGATGATAAAGGATGGATGGCAGGTTGAAGAACCGGATGAATGGTTACTTTATGGTAATCCCTGGGAGAAAG ACGCCCTGAATCCACTCGCATAGTTCAATTTTACGGTAGAGTTATACGTAATCATTTGGATCAATGTAAATGGATTGACACCGNNAAC ATATGTGCCCTACCTTATGAAAGTCCTAT ]
[-] EMBL CD090383             [  aAATACAATGCTTAACGTAGACGCAACAGAAGCTCTGGATGAAGCAATGTATCAACTTCGTCTGGATATTGAAGAATTAGAAGAAATGGAATGCGATGCAGGACTTGGCAATGGTGGTTTGGGTCGACTGGCTGCATGTTTTCTTGACTCAATGGCTACAATCGGTTTACCAGCTTATGGATATGGTATACGTTATGAAAAAGGCGCTTTTCATCAGATGATAAAGGATGGATGGCAGGTTGAAGAACCGGATGAATGGTTACTTTATGGTAATCCCTGGGAGAAAGAACGCCCTGAATCCACTCGCATAGTTCAATTTTACGGTAGAGTTATACGTAATCATTTGGATCAATGTAAATGGATTGACACCG AAACAATATGTGCCCTACCTTATGAAGTTCCTATA]


>consensus_2600#0 AAGAATACAATGCTTAACGTAGACGCAACAGAAGCTCTGGATGAAGCAATGTATCAACTT GGTCTGGATATTGAAGAATTAGAAGAAATGGAATGCGATGCAGGACTTGGCAATGGTGGT TTGGGTCGACTGGCTGCATGTTTTCTTGACTCAATGGCTACAATCGGTTTACCAGCTTAT GGATATGGTATACGTTATGAAAATGGCGCTTTTCATCAGATGATAAAGGATGGATGGCAG GTTGAAGAACCGGATGAATGGTTACTTTATGGTAATCCCTGGGAGAAAGACGCCCTGAAT CCACTCGCATAGTTCAATTTTACGGTAGAGTTATACGTAATCATTTGGATCAATGTAAAT GGATTGACACCGNNAACATATGTGCCCTACCTTATGAAAGTCCTATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)