cluster # 2626

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Schistosoma mansoni
cluster # 2626 cluster # 2626 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_2626#0 length = 789 sequences # 2

consensusID : consensus_2626#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 789
fasta sequence

                              [TCATCCATTGATAAACTTAACTGTTTATTAAGATCTTCAATAAATTGATCAATTTCTTTATCAAGATCTTTCAATTGATTAATTAATGTATTATAGAAGTCAATGCCTTGTTTTGATTTCGATAGAATACCATCGAAAGCTTCACCAGCTAATAATATATTATCGATTTGTTCAGAACGTTTTGTTCGAATTTCTGATAATTCTGTCCATTTCGGTGCAAATTCAGCATTTAAATCAATTAAAGCTGATTGTATATTCTCTTGTGCTTTTAAATTTTGTTTAATAATATTGACAAGATGATCATGTTTTGATTTTAAACGATTTTCAAACCAACTATTTAAATCTTGTTTAACTTCATCTGGGATAATAAGTAGATCACTGTCTACATCATCTAGATGTAGATTAGTTCTTAGCTGATTGATTAATTCAACACGTTGTTGACGCATTTCATTAACTTTGTCAAATAATCGTTGTGATTCTTTAGCGATATTATTAAGTGTTGAATCAGTAATTAAATCATTCACAGATGGTAACTTCTTT-TAAATTCTTCTAATGATATTTTTAATATATCAAATGATTGTNATTGATTAGTAATTAATTCTTTTAATTGATTATTTGATTGTTTTGCTTGTTCATTGGCATCCGAAAGAGTTTTAAAACGTTCTTTAAAATTTTTAACAATGACATTGAAATTTTTTGTCTTTTCACTCCCTTTTGTTGTGACTAACATATCGAAAAATTCTTCCACATCTTTCATTTTAATAGATAGATTTTCAAATTCACTGTCGC]

[+] EMBL CD116756             [TCATCCATTGATAAACTTAACTGTTTATTAAGATCTTCAATAAATTGATCAATTTCTTTATCAAGATCTTTCAATTGATTAATTAATGTATTATAGAAGTCAATGCCTTGTTTTGATTTCGATAGAATACCATCGAAAGCTTCACCAGCTAATAATATATTATCGATTTGTTCAGAACGTTTTGTTCGAATTTCTGATAATTCTGTCCATTTCGGTGCAAATTCAGCATTTAAATCAATTAAAGCTGATTGTATATTCTCTTGTGCTTTTAAATTTTGTTTAATAATATTGACAAGATGATCATGTTTTGATTTTAAACGATTTTCAAACCAACTATTTAAATCTTGTTTAACTTCATCTGGGATAATAAGTAGATCACTGTCTACATCATCTAGATGTAGATTAGTTCTTAGCTGATTGATTAATTCAACACGTTGTTGACGCATTTCATTAACTTTGTCAAATAATCGTTGTGATTCTTTAGCGATATTATTAAGTGTTGAATCAGTAATTAAATCATTCACAGATGGTAACTTCTTT TAAATTCTTCTAATGATATTTTTAATATATCAAATGATTGTNATTGATTAGTAATTAATTCTTTTAATTGATTATTTGATTGTTTTGCTTGTTC                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD066486             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAATCTTGTTTAACTTCATCTGGGATAATAAGTAGATCACTGTCTACATCATCTAGATGTAGATTAGTTCTTAGCTGATTGATTAATTCAACACGTTGTTGACGCATTTCATTGACTTTGTCAAATAATCGTTGTGATTCTTTAGCGATATTATTAAGTGTTGAATCAGTAATTAAATTATTCACAGATGGTAACTTCTTTATAAATTCTTCTAATGATATTTTTAATATATCAAATGATCGTAATTGATTAGTAATTAATTCTTTTAATTGATTATTTGATTGTTTTGCTTGTTCATTGGCATCCGAAAGAGTTTTAAAACGTTCTTTAAAATTTTTAACAATGACATTGAAATTTTTTGTCTTTTCACTCCCTTTTGTTGTGACTAACATATCGAAAAATTCTTCCACATCTTTCATTTTAATAGATAGATTTTCAAATTCACTGTCGC]




>consensus_2626#0
TCATCCATTGATAAACTTAACTGTTTATTAAGATCTTCAATAAATTGATCAATTTCTTTA
TCAAGATCTTTCAATTGATTAATTAATGTATTATAGAAGTCAATGCCTTGTTTTGATTTC
GATAGAATACCATCGAAAGCTTCACCAGCTAATAATATATTATCGATTTGTTCAGAACGT
TTTGTTCGAATTTCTGATAATTCTGTCCATTTCGGTGCAAATTCAGCATTTAAATCAATT
AAAGCTGATTGTATATTCTCTTGTGCTTTTAAATTTTGTTTAATAATATTGACAAGATGA
TCATGTTTTGATTTTAAACGATTTTCAAACCAACTATTTAAATCTTGTTTAACTTCATCT
GGGATAATAAGTAGATCACTGTCTACATCATCTAGATGTAGATTAGTTCTTAGCTGATTG
ATTAATTCAACACGTTGTTGACGCATTTCATTAACTTTGTCAAATAATCGTTGTGATTCT
TTAGCGATATTATTAAGTGTTGAATCAGTAATTAAATCATTCACAGATGGTAACTTCTTT
TAAATTCTTCTAATGATATTTTTAATATATCAAATGATTGTNATTGATTAGTAATTAATT
CTTTTAATTGATTATTTGATTGTTTTGCTTGTTCATTGGCATCCGAAAGAGTTTTAAAAC
GTTCTTTAAAATTTTTAACAATGACATTGAAATTTTTTGTCTTTTCACTCCCTTTTGTTG
TGACTAACATATCGAAAAATTCTTCCACATCTTTCATTTTAATAGATAGATTTTCAAATT
CACTGTCGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case