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Schistosoma mansoni
cluster # 2736 cluster # 2736       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2736#0 length = 645 sequences # 2  

consensusID : consensus_2736#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 645
fasta sequence
                              [ATCTTCTGACCTAGACAATTTTATGGGCTAATAAGATGATTGTATTATGAAAAATTTCTTAATATCATAGTTGCATACCATCGTTTTTCAGATTATGTATACATAAGTAGCGCTTTGATGTTCTAGCTAATTTTTATTCTGATTTTAGGAATTTCCTGTTGCTATCATTGTTAAACCATGAAAACATCTTATAATTATCAGTATGATTGTCATTGTTATCTATTTGTTGATTATTCCTCTTTAGATGTTTTCATATACTACAAATACCTTTGAAGTTAAAACAATCACTATCCTGCAGTGATCTGAATTAGGTTACTATAAAAGGAAAGTAAAACGTCAAACTAGTAAAAAAAATGAATTATAAGTAGTAGATGCATTTTGCACCCCCAGAATAATTTTGTGATTATTCATAATATGAATGTAGTTTTAGTCAGGAATAGACATCATTTTATCAGTTTTAATTACAAAAAGGTGTCAGACATACGTTTTGTTTCAATTTGATATCCCATAACAGTAGGGAATCAGAAGCAACTTGATTTCATTACAAATAAGAAATAACCTATCTAATTATCTAATTTCTTAAAGTTAGTCAATTCATAAAATAACTCTTACTNTATCCCACATCCTTGGTGAGCTATTGGTGAA]

[+] EMBL CD093123             [ATCTTCTGACCTAGACAATTTTATGGGCTAATAAGATGATTGTATTATGAAAAATTTCTTAATATCATAGTTGCATACCATCGTTTTTCAGATTATGTATACATAAGTAGCGCTTTGATGTTCTAGCTAATTTTTATTCTGATTTTAGGAATTTCCTGTTGCTATCATTGTTAAACCATGAAAACATCTTATAATTATCAGTATGATTGTCATTGTTATCTATTTGTTGATTATTCCTCTTTAGATGTTTTCATATACTACAAATACCTTTGAAGTTAAAACAATCACTATCCTGCAGTGATCTGAATTAGGTTACTATAAAAGGAAAGTAAAACGTCAAACTAGTAAAAAAAATGAATTATAAGTAGTAGATGCATTTTGCACCCCCAGAATAATTTTGTGATTATTCATAATATGAATGTAGTTTTAGTCAGGAATAGACATCATTTTATCAGTTTTAATTACAAAAAGGTGTCAGACATACGTTTTGTTTCAATTTGATATCCCATAACAGTAGGGAATCAGAAGCAACTTGATTTCATTACAAATAAGAAATAACCTATCTAATTATCTAATTTCTTAAAGTTAGTCAATTCATAAAATAACTCTTACTNTATCCCACATCCTTGGTGAGCTATTGGTGAA]
[+] EMBL CD093355             [ATCTTCTGACCTAGACAATTTTATGGGCTAATAAGATGATTGTATTATGAAAAATTTCTTAATATCATAGTTGCATACCATCGTTTTTCAGATTATGTATACATAAGTAGCGCTTTGATGTTCTAGCTAATTTTTATTCTGATTTTAGGAATTTCCTGTTGCTATCATTGTTAAACCATGAAAACATCTTATAATTATCAGTATGATTGTCATTGTTATCTATTTGTTGATTATTCCTCTTTAGATGTTTTCATATACTACAAATACCTTTGAAGTTAAAACAATCACTATCCTGCAGTGATCTGAATTAGGTTACTATAAAAGGAAAGTAAAACGTCAAACTAGTAAAAAAAATGAATTATAAGTAGTAGATGCATTTTGCACCCCCAGAATAATTTTGTGATTATTCATAATATGAATGTAGTTTTAGTCAGGAATAGACATCATTTTATCAGTTTTAATTACAAAAAGGTGTCAGACATACGTTTTGTTTCAATTTGATATCCCATAACAGTAGGGAATCAGAAGCAACTTGATTTCATTACAAATAAGAAATAACCTATCTAATTATCTAATTTCTTAAAGTTAGTCAATTCATAAAATAACTCTTACTTTATCC                          ]


>consensus_2736#0 ATCTTCTGACCTAGACAATTTTATGGGCTAATAAGATGATTGTATTATGAAAAATTTCTT AATATCATAGTTGCATACCATCGTTTTTCAGATTATGTATACATAAGTAGCGCTTTGATG TTCTAGCTAATTTTTATTCTGATTTTAGGAATTTCCTGTTGCTATCATTGTTAAACCATG AAAACATCTTATAATTATCAGTATGATTGTCATTGTTATCTATTTGTTGATTATTCCTCT TTAGATGTTTTCATATACTACAAATACCTTTGAAGTTAAAACAATCACTATCCTGCAGTG ATCTGAATTAGGTTACTATAAAAGGAAAGTAAAACGTCAAACTAGTAAAAAAAATGAATT ATAAGTAGTAGATGCATTTTGCACCCCCAGAATAATTTTGTGATTATTCATAATATGAAT GTAGTTTTAGTCAGGAATAGACATCATTTTATCAGTTTTAATTACAAAAAGGTGTCAGAC ATACGTTTTGTTTCAATTTGATATCCCATAACAGTAGGGAATCAGAAGCAACTTGATTTC ATTACAAATAAGAAATAACCTATCTAATTATCTAATTTCTTAAAGTTAGTCAATTCATAA AATAACTCTTACTNTATCCCACATCCTTGGTGAGCTATTGGTGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)