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Schistosoma mansoni
cluster # 2796 cluster # 2796       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2796#0 length = 543 sequences # 2  

consensusID : consensus_2796#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 543
fasta sequence
                              [GTAATTAGGTGAAAGAATTGAAAACTATCCTTAGTGGCCTAGATATATTCCATATTTTGTTTGTTTTTAAATTCGGAAAATTTACGATGCGTAGTCTACCCGGATTTTTGGGATTATGGGTTTAAAAGATACCATAAAACTAGCTGTTAGCGAGTCCTACCAATAGGCAATCCAAAGAAAAGGCGAACGACTATAACGCTGGGTGAAAAACCGTATGTACATCCGACCGTTAAAATACCCATCGAAGAGTTTGAGTTAAATATTAGTAAGAATAAAAATAAGTGAGACCAAGCAGACTTTTGTAAACATCAAATGTGTTAACAAAAAGGTTTTCACGGGCTATTCAGTGTATCACTAAACAACAAATTTAACTGGTTTCTCATTTTAAATCATAACGAATGGTATTCGACAGGAATATGATTTGGACGTCTTTCTGG-AACAAATGTTGCCAACATCAATCCTTTGGATCATTTCTGATAAAGATCCTTTGATTAATATGACTTTANAAAAACAATGAAAACAGGATGCCTGAATTACACTTGG]

[+] EMBL CD093912             [GTAATTAGGTGAAAGAATTGAAAACTATCCTTAGTGGCCTAGATATATTCCATATTTTGTTTGTTTTTAAATTCGGAAAATTTACGATGCGTAGTCTACCCGGATTTTTGGGATTATGGGTTTAAAAGATACCATAAAACTAGCTGTTAGCGAGTCCTACCAATAGGCAATCCAAAGAAAAGGCGAACGACTATAACGCTGGGTGAAAAACCGTATGTACATCCGACCGTTAAAATACCCATCGAAGAGTTTGAGTTAAATATTAGTAAGAATAAAAATAAGTGAGACCAAGCAGACTTTTGTAAACATCAAATGTGTTAACAAAAAGGTTTTCACGGGCTATTCAGTGTATCACTAAACAACAAATTTAACTGGTTTCTCATTTTAAATCATAACGAATGGTATTCGACAGGAATATGATTTGGACGTCTTTCTGG AACAAATGTTGCCAACATCAATCCTTTGGATCATTTCTGATAAAGATCCTTTGATTAATATGACTTTANAAAAACAATGAAAACAGGATGCCTGAATTACACTTGG]
[+] EMBL CD093943             [GTAATTAGGTGAAAGAATTGAAAACTATCCTTAGTGGCCTAGATATATTCCATATTTTGTTTGTTTTTAAATTCGGAAAATTTACGATGCGTAGTCTACCCGGATTTTTGGGATTATGGGTTTAAAAGATACCATAAAACTAGCTGTTAGCGAGTCCTACCAATAGGCAATCCAAAGAAAAGGCGAACGACTATAACGCTGGGTGAAAAACCGTATGTACATCCGACCGTTAAAATACCCATCGAAGAGTTTGAGTTAAATATTAGTAAGAATAAAAATAAGTGAGACCAAGCAGACTTTTGTAAACATCAAATGTGTTAACAAAAAGGTTTTCACGGGCTATTCAGTGTATCACTAAACAACAAATTTAACTGGTTTCTCATTTTAAATCATAACGAATGGTATTCGACAGGAATATGATTTGGACGTCTTTCTGGNAAC AATGTTGCCAACATCAATCCTTTGGATC                                                                          ]


>consensus_2796#0 GTAATTAGGTGAAAGAATTGAAAACTATCCTTAGTGGCCTAGATATATTCCATATTTTGT TTGTTTTTAAATTCGGAAAATTTACGATGCGTAGTCTACCCGGATTTTTGGGATTATGGG TTTAAAAGATACCATAAAACTAGCTGTTAGCGAGTCCTACCAATAGGCAATCCAAAGAAA AGGCGAACGACTATAACGCTGGGTGAAAAACCGTATGTACATCCGACCGTTAAAATACCC ATCGAAGAGTTTGAGTTAAATATTAGTAAGAATAAAAATAAGTGAGACCAAGCAGACTTT TGTAAACATCAAATGTGTTAACAAAAAGGTTTTCACGGGCTATTCAGTGTATCACTAAAC AACAAATTTAACTGGTTTCTCATTTTAAATCATAACGAATGGTATTCGACAGGAATATGA TTTGGACGTCTTTCTGGAACAAATGTTGCCAACATCAATCCTTTGGATCATTTCTGATAA AGATCCTTTGATTAATATGACTTTANAAAAACAATGAAAACAGGATGCCTGAATTACACT TGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)