Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3043 cluster # 3043       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3043#0 length = 476 sequences # 2  

consensusID : consensus_3043#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 476
fasta sequence
                              [TTCTTCGTTAATTATCATAAAATTACTTGTAATTTTGAACAAATACTGTATTAAACAGTAAATTCAGAAAGTATTTATTCACATGTATCAGATCTAGACTCAACACTTA-TTTTATCAGTTTCATCAATAAGCTTCAGCTTTCCTTCAAAACGAACTTACTTCAGTTAGTATTACTATAAGACCATAAATTCAGAGAGTTTGCTTCTCAAACTTAGTTTTGACTATCGTTCGAATAACATGCTCTTCATTTGCTTTTTACTGAATTTGTTATCCTCTAACTTTGATATGGATAGCTGAAGGCAATAAATAAAAAGTCCTTGCACGACCTTATAATTAGCAAATTAGTTGGTAGTTTGATATTTCTATTTAAAAGTGATTTGCTTGATCCCTGTACTTTATGTAATAAACGAAATTATCCCACAAAGAAATGCACAGTTACAAGTTTTCAGTAGATGTNTGGATTTCAGTGAGTGAAT]

[+] EMBL CD112361             [TTCTTCGTTAATTATCATAAAATTACTTGTAATTTTGAACAAATACTGTATTAAACAGTAAATTCAGAAAGTATTTATTCACATGTATCAGATCTAGACTCAACACTTA TTTTATCAGTTTCATCAATAAGCTTCAGCTTTCCTTCAAAACGAACTTACTTCAGTTAGTATTACTATAAGACCATAAATTCAGAGAGTTTGCTTCTCAAACTTAGTTTTGACTATCGTTCGAATAACATGCTCTTCATTTGCTTTTTACTGAATTTGTTATCCTCTAACTTTGATATGGATAGCTGAAGGCAATAAATAAAAAGTCCTTGCACGACCTTATAATTAGCAAATTAGTTGGTAGTTTGATATTTCTATTTAAAAGTGATTTGCTTGATCCCTGTACTTTATGTAATAAACGAAATTATCCCACAAAGAAATGCACAGTTACAAGTTTTCAGTAGATGTNTGGATTTCAGTGAGTGAAT]
[+] EMBL CD112449             [TTCTTCGTTAATTATCATAAAATTACTTGTAATTTTGAACAAATACTGTATTAAACAGTAAATTCAGAAAGTATTTATTCACTGGTATCAGATCTAGACTCAACACTTATTTTTATCAGTTTCATCAATAAGCTTCAGCTTTCCTTCAAAACGAACTTACTTCAGTTAGTATTACTATAAGACCATAAATTCAGAGAGTTTGCTTCTCAAACTTAGTTTTGACTATCGTTCGAATAACATGCTCTTCATTTGCTTTTTACTGAATTTGTTATCCTCTAACTTTGATATGGATAGCTGAAGGCAATAAATAAAAAGTCCTTGCACGACCTTATAATTAGCAAATTAGTTGGTAGTTTGATATTTCTATTTAAAAGTGATTTGCTTGATCCCTGTACTTTATGTAATAAACGACATTATCCCACAAAGAAATGCACAGTTACAAGTTTTC                             ]


>consensus_3043#0 TTCTTCGTTAATTATCATAAAATTACTTGTAATTTTGAACAAATACTGTATTAAACAGTA AATTCAGAAAGTATTTATTCACATGTATCAGATCTAGACTCAACACTTATTTTATCAGTT TCATCAATAAGCTTCAGCTTTCCTTCAAAACGAACTTACTTCAGTTAGTATTACTATAAG ACCATAAATTCAGAGAGTTTGCTTCTCAAACTTAGTTTTGACTATCGTTCGAATAACATG CTCTTCATTTGCTTTTTACTGAATTTGTTATCCTCTAACTTTGATATGGATAGCTGAAGG CAATAAATAAAAAGTCCTTGCACGACCTTATAATTAGCAAATTAGTTGGTAGTTTGATAT TTCTATTTAAAAGTGATTTGCTTGATCCCTGTACTTTATGTAATAAACGAAATTATCCCA CAAAGAAATGCACAGTTACAAGTTTTCAGTAGATGTNTGGATTTCAGTGAGTGAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)