cluster # 3108

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Schistosoma mansoni
cluster # 3108 cluster # 3108 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3108#0 length = 615 sequences # 2

consensusID : consensus_3108#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 615
fasta sequence

                              [AATAGGGATTCCTTCTTGTTAAAATAATCAGTTGAATTAGGTCTTGTAGAATCATCAATAAGTGTACTATCCATTTGGAGCGAATCGTCACAATTAGAATGACCTCTAATAATATCCTCATCATTAGTAGTAATGGCAGTAGTAGTAATAATAACACCATTTGACTTTTTATCACCATCAGTATTATGATTCATATTGTCATTAGTAGTAGATTTTTCGATTGGGAAACATTTGAATACTTCATCTAGTAATGATGAGCCTAAATCTAACTCATTTGATTCAGATATCACATTAAATTTGATATCGTCAAATAATAAATCTGTATCATCTTTATTTACAATTTGATTGTAATTCGTCAAGAGACTATTTGATATTTGAGTGTTTTTCTTTGATGTACTCTTTTTTGTCATAGACGAATCACCAATTCCTAATGTGCTAGTTTTAATTGGTAATGAAATATGTTTTATTGTTGCTTCTTGATAAGTCTTAATATTTGAAGGATTAATTTGTAAAGTATTCGATTTATTGGATTTGTATTTCTCTTCAGATACAGTGAAATCGTGAAATGATTGAGAATCAGAGAGATTATCTTTCAAATCGATAATTTTGCTAACT]

[+] EMBL CD114232             [AATAGGGATTCCTTCTTGTTAAAATAATCAGTTGAATTAGGTCTTGTAGAATCATCAATAAGTGTACTATCCATTTGGAGCGAATCGTCACAATTAGAATGACCTCTAATAATATCCTCATCATTAGTAGTAATGGCAGTAGTAGTAATAATAACACCATTTGACTTTTTATCACCATCAGTATTATGATTCATATTGTCATTAGTAGTAGATTTTTCGATTGGGAAACATTTGAATACTTCATCTAGTAATGATGAGCCTAAATCTAACTCATTTGATTCAGATATCACATTAAATTTGATATCGTCAAATAATAAATCTGTATCATCTTTATTTACAATTTGATTGTAATTCGTCAAGAGACTATTTGATATTTGAGTGTTTTTCTTTGATGTACTCTTTTTTGTCATAGACGAATCACCAATTCCTAATGTGCTAGTTTTAATTGGTAATGAAATATGTTTTATTGTTGCTTCTTGATAAGTCTTAATATTTGAAGGA                                                                                                                  ]
[-] EMBL AI067424             [                                                                                                                        TCATTAGTAGTAATGCCAGTAGTAGTAATAATAACACCATTTGACTTTTTATCACCATCAGTATTATGATTCATATTGTCATTAGTAGTAGATTTTTCGATTGNGAAACATNTGAATACTTCATCTAGTAATGATGAGCCTAAATCTAACTCATTTGATTCAGACATCACATTAAATTTGATATCGTCAAATAATAAATCTGTATCATCTTTATTTACAATTTGATTGTAATTCGTCAAGAGACTATTTGATATTTGAGTGTTTTTCTTTGATGTACTCTTTTTTGTCATAGACGAATCACCAATTCCTAATGTGCTAGTTTTAATTGGTAATGAAATATGTTTCATTGTTGTTTCTTGATAAGTTTTAATATTTGAAGGATTAATTTGTAAAGTATTCGATTTATTGGATTTGTATTTCTCTTCAGATACAGTGAAATCGTGAAATGATTGAGAATCAGAGAGATTATCTTTCAAATCGATAATTTTGCTAACT]




>consensus_3108#0
AATAGGGATTCCTTCTTGTTAAAATAATCAGTTGAATTAGGTCTTGTAGAATCATCAATA
AGTGTACTATCCATTTGGAGCGAATCGTCACAATTAGAATGACCTCTAATAATATCCTCA
TCATTAGTAGTAATGGCAGTAGTAGTAATAATAACACCATTTGACTTTTTATCACCATCA
GTATTATGATTCATATTGTCATTAGTAGTAGATTTTTCGATTGGGAAACATTTGAATACT
TCATCTAGTAATGATGAGCCTAAATCTAACTCATTTGATTCAGATATCACATTAAATTTG
ATATCGTCAAATAATAAATCTGTATCATCTTTATTTACAATTTGATTGTAATTCGTCAAG
AGACTATTTGATATTTGAGTGTTTTTCTTTGATGTACTCTTTTTTGTCATAGACGAATCA
CCAATTCCTAATGTGCTAGTTTTAATTGGTAATGAAATATGTTTTATTGTTGCTTCTTGA
TAAGTCTTAATATTTGAAGGATTAATTTGTAAAGTATTCGATTTATTGGATTTGTATTTC
TCTTCAGATACAGTGAAATCGTGAAATGATTGAGAATCAGAGAGATTATCTTTCAAATCG
ATAATTTTGCTAACT

clustalw multiple alignements is not computed in this case