cluster # 3190

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Schistosoma mansoni
cluster # 3190 cluster # 3190 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3190#0 length = 594 sequences # 2

consensusID : consensus_3190#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 594
fasta sequence

                              [TGACCTTGAACGTTGATTATTATTGAAT-CAATATGTATTGATCCAGATCTCACAAACGCACACACACAATTCGTTATTTCAATGGAATCTGATTTGATAACTGACATTCTAATGACATTGTAATGTGTGCTACTGATATCGACAGATATAAGTAGTATGTATGATGATTAGAAAGTAAAATGCTTGGCCAAAGAAGGTTAAAAAGATCACAAAAAAGAACAACGAGAACAGAGAATGGTTGCTGTGGCAACGAAGAAACAATAACATCTGAGATGATTGATTGATATTTTTCAAATAAAGTATTTAATATATGGATTTCAGATTTCACTAAGGTATGTAGTGGCGGATGTTATATCAAGCCCGTATAACATATTCAAGCTTCTGGACAGGCCAATTTATCCATTCCTCTTAAGTCACGTTTTGACCTTGTTTAATTATTCACTTACCGACCTTGGCTGTTGTGTATATGAGCGTATATGTATATACACTTCTTATCTTCATTCATCACATGTCTGTTGCTTATTTTTATGTGACTATAAATGTCGATTAACGCTTGGTTAAATCGAGTTGTCACACACATCTTCTCCACTATAT]

[+] EMBL CD116161             [TGACCTTGAACGTTGATTATTATTGAAT CAATATGTATTGATCCAGATCTCACAAACGCACACACACAATTCGTTATTTCAATGGAATCTGATTTGATAACTGACATTCTAATGACATTGTAATGTGTGCTACTGATATCGACAGATATAAGTAGTATGTATGATGATTAGAAAGTAAAATGCTTGGCCAAAGAAGGTTAAAAAGATCACAAAAAAGAACAACGAGAACAGAGAATGGTTGCTGTGGCAACGAAGAAACAATAACATCTGAGATGATTGATTGATATTTTTCAAATAAAGTATTTAATATATGGATTTCAGATTTCACTAAGGTATGTAGTGGCGGATGTTATATCAAGCCCGTATAACATATTCAAGCTTCTGGACAGGCCAATTTATCCATTCCTCTTAAGTCACGTTTTGACCTTGTTTAATTATTCACTTACCGACCTTGGCTGTT                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD115981             [               ATTATTATTGAATACAATATGTATTGATCCAGATCTCACAAACGCACACACACAATTCGTTATTTCAATGGAATCTGATTTGATAACTGACATTCTAATGACATTGTAATGTGTGCTACTGATATCGACAGATATAAGTAGTATGTATCATGATTAGAAAGTAAAATGCTTGGCCAAAGAAGGTTAAAAAGATCAGAAAAAAGAACAACGAGAACAGAGAATGGTTGCTGTGGCAACGAAGAAACAATAACATCTGAGATGATTGATTGATATTTTTCAAATAAAGTATTTAATATATGGATTTCAGATTTCACTAAGGTATGTAGTGGCGGATGTTATATCAAGCCCGTATAACATATTCAAGCTTCTGGACAGGCCAATTTATCCATTCCTCTTAAGTCACGTTTTGACCTTGTTTAATTATTCACTTACCGACCTTGGCTGTTGTGTATATGAGCGTATATGTATATACACTTCTTATCTTCATTCATCACATGTCTGTTGCTTATTTTTATGTGACTATAAATGTCGATTAACGCTTGGTTAAATCGAGTTGTCACACACATCTTCTCCACTATAT]




>consensus_3190#0
TGACCTTGAACGTTGATTATTATTGAATCAATATGTATTGATCCAGATCTCACAAACGCA
CACACACAATTCGTTATTTCAATGGAATCTGATTTGATAACTGACATTCTAATGACATTG
TAATGTGTGCTACTGATATCGACAGATATAAGTAGTATGTATGATGATTAGAAAGTAAAA
TGCTTGGCCAAAGAAGGTTAAAAAGATCACAAAAAAGAACAACGAGAACAGAGAATGGTT
GCTGTGGCAACGAAGAAACAATAACATCTGAGATGATTGATTGATATTTTTCAAATAAAG
TATTTAATATATGGATTTCAGATTTCACTAAGGTATGTAGTGGCGGATGTTATATCAAGC
CCGTATAACATATTCAAGCTTCTGGACAGGCCAATTTATCCATTCCTCTTAAGTCACGTT
TTGACCTTGTTTAATTATTCACTTACCGACCTTGGCTGTTGTGTATATGAGCGTATATGT
ATATACACTTCTTATCTTCATTCATCACATGTCTGTTGCTTATTTTTATGTGACTATAAA
TGTCGATTAACGCTTGGTTAAATCGAGTTGTCACACACATCTTCTCCACTATAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case