Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3205 cluster # 3205       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3205#0 length = 558 sequences # 2  

consensusID : consensus_3205#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 558
fasta sequence
                              [GATTGTTTCATATTGATTTTGGGCACATCTTAGATAATCGTAAGAAGAAGTTTGGTTTTACGCGTGAACGTGTACCATTTGTTTTGACAAAAGATTTTATTACGGTAATTGCACGTGGTAATCCTGATGCTGGGGCAATAACAACAACTAATACTCCATCATCAGTCACCCATAATACTATCGGAGGAATATACGGTAATATGTATTTCCAAGAATTCACTGATTTATGTGGTAAAGCTTACCTTCTTTTACGTAAACATTCAAATCTCATATTAACATTATTAGCTATGATGTTACCTTCTGGATTACCTGAGCTAACTTCAGTGTGTGATTTGGAACATGTAAGAAAGACTTTAGCTGTCGAAATTGATAATGAACATGAAGCACTTGCTTATTTTCATCATAAATTTAATGAAGCCTATTCTGGTGCATGGACAACAAAAATTGATTGGTTTTCACATTGGATGAATACATGAGTGACTGCACAAAATATTAGTGATACTGTTACATGAATTCATTTAACTTATTTTCTATCAGCAATATGATTTGATATACTCA]

[+] EMBL CD116317             [GATTGTTTCATATTGATTTTGGGCACATCTTAGATAATCGTAAGAAGAAGTTTGGTTTTACGCGTGAACGTGTACCATTTGTTTTGACAAAAGATTTTATTACGGTAATTGCACGTGGTAATCCTGATGCTGGGGCAATAACAACAACTAATACTCCATCATCAGTCACCCATAATACTATCGGAGGAATATACGGTAATATGTATTTCCAAGAATTCACTGATTTATGTGGTAAAGCTTACCTTCTTTTACGTAAACATTCAAATCTCATATTAACATTATTAGCTATGATGTTACCTTCTGGATTACCTGAGCTAACTTCAGTGTGTGATTTGGAACATGTAAGAAAGACTTTAGCTGTCGAAATTGATAATGAACATGAAGCACTTGCTTATTTTCATCATAAATTTAATGAAGCCTATTCTGGTGCATGGACAACAAAAATTGATTGGTTTTCACATTGGATGAATACATGAGTGACTGCACAAAATATTAGTGATACTGTTACATGAATTCATTTAACTTATTTTCTATCAGCAATATGATTTGATATACTCA]
[-] EMBL CD142938             [                                                               GTGAACGTGTACCATTTG TTTGACAAAAGATTTTATTACGGTAATTGCACGTGGTAATCCTGATGCTGGGGCAATAACAACAACTAATACTCCATCATCAGTCACCCATAATACTATCGGAGGAATATACGGTAATATGTATTTCCAAGAATTCACTGATTTATGTGGTAAAGCTTACCTTCTTTTACGTAAACATTCAAATCTCATATTAACATTATTAGCTATGATGTTACCTTCTGGATTACCTGAGCTAACTTCAGTGTGTGATTTGGAACATGTAAGAAAGACTTTAGCTGTCGAAATTGATAATGAACATGAAGCACTTGCTTATTTTCATCATAAATTTAATGAAGCC                                                                                                                                           ]


>consensus_3205#0 GATTGTTTCATATTGATTTTGGGCACATCTTAGATAATCGTAAGAAGAAGTTTGGTTTTA CGCGTGAACGTGTACCATTTGTTTTGACAAAAGATTTTATTACGGTAATTGCACGTGGTA ATCCTGATGCTGGGGCAATAACAACAACTAATACTCCATCATCAGTCACCCATAATACTA TCGGAGGAATATACGGTAATATGTATTTCCAAGAATTCACTGATTTATGTGGTAAAGCTT ACCTTCTTTTACGTAAACATTCAAATCTCATATTAACATTATTAGCTATGATGTTACCTT CTGGATTACCTGAGCTAACTTCAGTGTGTGATTTGGAACATGTAAGAAAGACTTTAGCTG TCGAAATTGATAATGAACATGAAGCACTTGCTTATTTTCATCATAAATTTAATGAAGCCT ATTCTGGTGCATGGACAACAAAAATTGATTGGTTTTCACATTGGATGAATACATGAGTGA CTGCACAAAATATTAGTGATACTGTTACATGAATTCATTTAACTTATTTTCTATCAGCAA TATGATTTGATATACTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)