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Schistosoma mansoni
cluster # 3216 cluster # 3216       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3216#0 length = 492 sequences # 2  

consensusID : consensus_3216#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 492
fasta sequence
                              [GAATAAATATAAACCACAAATTACTAAAGAGGGTTGGTTGAAACGTGTAAGAAAAGGTCAGATTGCATGGTTTTGGTGTCGTCTAGCCGGTTTTTATTTGATTTATTCATTAAGTCCACAGAGTACAGTCCCGGTTGGTTGTAAAAATTTAAAAAATTCATATATACATGTAATTGGTAATCAAACATCTAGCCTAGAGCGCGAAGTAACACAAAGAACAAATAAACTATCCAGTATATCCACAGATTTTCATAATTCAGCCCAATTACTAACATCTAGTTCAGACTCAGATTCCCTTTTGATTAGTTTAAATTGTTCAAAATTAAATCAAGAAAGACAACAGACAATTAAAATATGGACACCGGAACATGAACCTATTTATTTATTATGTCCTACGGTTGAAGAATGTGAACAGTGGAGAGATAGTCTAATTCGAGCGACGTTACACTCTCCCAAAATTATTGATTCTAGTGACATACAAAAGTCACCATT]

[+] EMBL CD069673             [GAATAAATATAAACCACAAATTACTAAAGAGGGTTGGTTGAAACGTGTAAGAAAAGGTCAGATTGCATGGTTTTGGTGTCGTCTAGCCGGTTTTTATTTGATTTATTCATTAAGTCCACAGAGTACAGTCCCGGTTGGTTGTAAAAATTTAAAAAATTCATATATACATGTAATTGGTAATCAAACATCTAGCCTAGAGCGCGAAGTAACACAAAGAACAAATAAACTATCCAGTATATCCACAGATTTTCATAATTCAGCCCAATTACTAACATCTAGTTCAGACTCAGATTCCCTTTTGATTAGTTTAAATTGTTCAAAATTAAATCAAGAAAGACAACAGACAATTAAAATATGGACACCGGAACATGAACCTATTTATTTATTATGTCCTACGGTTGAAGAATGTGAACAGTGGAGAGATAGTCTAATTCGAGCGACGTTACACTCTCCCAAAATTATTGATTCTAGTGACATACAAAAGTCACCATT]
[+] EMBL CD069664             [GAATAAATATAAACCACAAATTACTAAAGAGGGTTGGTTGAAACGTGTAAGAAAAGGTCAGATTGCATGGTTTTGGTGTCGTCTAGCCGGTTTTTATTTGATTTATTCATTAAGTCCACAGAGTACAGTCCCGGTTGGTTGTAAAAATTTAAAAAATTCATATATACATGTAATTGGTAATCAAACATCTAGCCTAGAGCGCGAAGTAACACAAAGAACAAATAAACTATCCAGTATATCCACAGATTTTCATAATTCAGCCCAATTACTAACATCTAGTTCAGACTCAGATTCCCTTTTGATTAGTTTAAATTGTTCAAAATTAAATCAAGAAAGACAACAGACAATTAAAATATGGACACCGGAACATGAACCTATTTATTTATTATGTCCTACGGTTGAAGAATGTGAACAGTGGAGAGATAGTCTAATTCGAGCGACGTTACACTCTCCCACAATTATTGAT                          ]


>consensus_3216#0 GAATAAATATAAACCACAAATTACTAAAGAGGGTTGGTTGAAACGTGTAAGAAAAGGTCA GATTGCATGGTTTTGGTGTCGTCTAGCCGGTTTTTATTTGATTTATTCATTAAGTCCACA GAGTACAGTCCCGGTTGGTTGTAAAAATTTAAAAAATTCATATATACATGTAATTGGTAA TCAAACATCTAGCCTAGAGCGCGAAGTAACACAAAGAACAAATAAACTATCCAGTATATC CACAGATTTTCATAATTCAGCCCAATTACTAACATCTAGTTCAGACTCAGATTCCCTTTT GATTAGTTTAAATTGTTCAAAATTAAATCAAGAAAGACAACAGACAATTAAAATATGGAC ACCGGAACATGAACCTATTTATTTATTATGTCCTACGGTTGAAGAATGTGAACAGTGGAG AGATAGTCTAATTCGAGCGACGTTACACTCTCCCAAAATTATTGATTCTAGTGACATACA AAAGTCACCATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)