Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 345 cluster # 345       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_345#0 length = 1180 sequences # 2  

consensusID : consensus_345#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1180
fasta sequence
                              [CCTCGAGGCCAAGATTCGGCACGAGGAAAATTATGGAAACCACGTCGTTTATATTTTGTATTAAATCTTCCAATTCATGGAACTGATCCACATATATTATTAATACAAATGATTGAGTTAATAAAACATTATCAATGTTCATATGAATTTCTTAGTTCATATCGTTTACGTTGTACAAAATTGATTCATTCTTCTACTACTTCTACTTCTTCTCCTCCTTGTTCTACTTCAAATGATACTGGTAATAATAACCCTATTCATGATACGGATGTTCATCAACGACAACAACAACAACTGGAACACTGTACATTAACATCTCACCAACAAGAACAACAGCAAGACCAGCAACAGCACTCCCAAGATGTACCTCAATTACCTTTACTATTATATTCAAAAGATAAAACACATTTATTAATATGGGATATGGAAATATTTCAATTAGCTAAACCAATTCATTATGGTGTACGTTTTAAACGTATTTCAGGCAATCAGAATGCATTCAAAATAATTATGAAATATTTTATTTATCATCATAAAGTATAATCTTATCATATACACTGAATGTATGTTGTTGTTCTTTTGTTCTTTACAAAAAACCCTTAAGTTTCCTACCTCTTTCAGTTTATATGATTGTTTTATTCAATGGATCCATGTCAACATTTATCATTTCGTCCTTATGATTGTTG-CATCATC-NNGTGTGTTGTTGTTCCTGCTGTTGATGCTGGTGCTGCTGGTACTACTGTTATTGTCAATGTTATCTTTGCTTTTAAACTTTTCTTTCCTTTTTTTGATCTCATGTTTACTACTGAAATCAAATAAATGACTACTTATTTAAGTTATATATCTCTTTTAAGAAAACAATTAACCATTATTGACCATTGAATAATAACTTATTCAAATAATAATTTTAAATTTCTAATGTTTTCTTTCTACTTTTACAAGAACAAACGAAAAAGAAGAAGAAACCATATTGAGTCAATATATGTAGGTACTAAAATTGTGTTCCCTGGTTGTTTGTTTCTCCTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTACCATGTTCTTTCTTTTAAAATAGATTTTATTTTAAACAACCAAGTAAACAAACAAACGATATATGACTTGTTTTTTTGTTTTCTCCTCCTTTGTTTGTATAATATCACCATGCTTATATAGATATATAGATAGA]

[+] EMBL CD080770             [CCTCGAGGCCAAGATTCGGCACGAGGAAAATTATGGAAACCACGTCGTTTATATTTTGTATTAAATCTTCCAATTCATGGAACTGATCCACATATATTATTAATACAAATGATTGAGTTAATAAAACATTATCAATGTTCATATGAATTTCTTAGTTCATATCGTTTACGTTGTACAAAATTGATTCATTCTTCTACTACTTCTACTTCTTCTCCTCCTTGTTCTACTTCAAATGATACTGGTAATAATAACCCTATTCATGATACGGATGTTCATCAACGACAACAACAACAACTGGAACACTGTACATTAACATCTCACCAACAAGAACAACAGCAAGACCAGCAACAGCACTCCCAAGATGTACCTCAATTACCTTTACTATTATATTCAAAAGATAAAACACATTTATTAATATGGGATATGGAAATATTTCAATTAGCTAAACCAATTCATTATGGTGTACGTTTTAAACGTATTTCAGGCAATCAGAATGCATTCAAAATAATTATGAAATATTTTATTTATCATCATAAAGTATAATCTTATCATATACACTGAATGTATGTTGTTGTTCTTTTGTTCTTTACAAAAAACCCTTAAGTTTCCTACCTCTTTCAGTTTATATGATTGTTTTATTCAATGGATCCATGTCAACATTTATCATTTCGTCCTTATGATTGTTG CATCATC NNGTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD074694             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgnnTGTTCTTTTGTTCTTTACAAAAAACCCTTAAGTTTCCTACCTCTTTCAGTTTATATGATTGTTTTATTCAATGGATCCATGTCAACATTTATCATTTCGTCCTTATGATTGTTGTCATCATCGTTGT TGTTGTTGTTCCTGCTGTTGATGCTGGTGCTGCTGGTACTACTGTTATTGTCAATGTTATCTTTGCTTTTAAACTTTTCTTTCCTTTTTTTGATCTCATGTTTACTACTGAAATCAAATAAATGACTACTTATTTAAGTTATATATCTCTTTTAAGAAAACAATTAACCATTATTGACCATTGAATAATAACTTATTCAAATAATAATTTTAAATTTCTAATGTTTTCTTTCTACTTTTACAAGAACAAACGAAAAAGAAGAAGAAACCATATTGAGTCAATATATGTAGGTACTAAAATTGTGTTCCCTGGTTGTTTGTTTCTCCTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTACCATGTTCTTTCTTTTAAAATAGATTTTATTTTAAACAACCAAGTAAACAAACAAACGATATATGACTTGTTTTTTTGTTTTCTCCTCCTTTGTTTGTATAATATCACCATGCTTATATAGATATATAGATAGA]


>consensus_345#0 CCTCGAGGCCAAGATTCGGCACGAGGAAAATTATGGAAACCACGTCGTTTATATTTTGTA TTAAATCTTCCAATTCATGGAACTGATCCACATATATTATTAATACAAATGATTGAGTTA ATAAAACATTATCAATGTTCATATGAATTTCTTAGTTCATATCGTTTACGTTGTACAAAA TTGATTCATTCTTCTACTACTTCTACTTCTTCTCCTCCTTGTTCTACTTCAAATGATACT GGTAATAATAACCCTATTCATGATACGGATGTTCATCAACGACAACAACAACAACTGGAA CACTGTACATTAACATCTCACCAACAAGAACAACAGCAAGACCAGCAACAGCACTCCCAA GATGTACCTCAATTACCTTTACTATTATATTCAAAAGATAAAACACATTTATTAATATGG GATATGGAAATATTTCAATTAGCTAAACCAATTCATTATGGTGTACGTTTTAAACGTATT TCAGGCAATCAGAATGCATTCAAAATAATTATGAAATATTTTATTTATCATCATAAAGTA TAATCTTATCATATACACTGAATGTATGTTGTTGTTCTTTTGTTCTTTACAAAAAACCCT TAAGTTTCCTACCTCTTTCAGTTTATATGATTGTTTTATTCAATGGATCCATGTCAACAT TTATCATTTCGTCCTTATGATTGTTGCATCATCNNGTGTGTTGTTGTTCCTGCTGTTGAT GCTGGTGCTGCTGGTACTACTGTTATTGTCAATGTTATCTTTGCTTTTAAACTTTTCTTT CCTTTTTTTGATCTCATGTTTACTACTGAAATCAAATAAATGACTACTTATTTAAGTTAT ATATCTCTTTTAAGAAAACAATTAACCATTATTGACCATTGAATAATAACTTATTCAAAT AATAATTTTAAATTTCTAATGTTTTCTTTCTACTTTTACAAGAACAAACGAAAAAGAAGA AGAAACCATATTGAGTCAATATATGTAGGTACTAAAATTGTGTTCCCTGGTTGTTTGTTT CTCCTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTTACCATGTTCTTTCTTTTAAAATAGATTTTATTTTA AACAACCAAGTAAACAAACAAACGATATATGACTTGTTTTTTTGTTTTCTCCTCCTTTGT TTGTATAATATCACCATGCTTATATAGATATATAGATAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)