cluster # 3638

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Schistosoma mansoni
cluster # 3638 cluster # 3638 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3638#0 length = 517 sequences # 2

consensusID : consensus_3638#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 517
fasta sequence

                              [GTAATTAAAGTTGTTTCAAATAATATACTGGCAGAGGTTAGAGGTCATAATGTCGGTAAACGATTTCTGTAATTTCAGGAAAAGGCACTTTGGTAAACAAAAAAAACTATTAGGCTACCAAGGTTGTTTACATCATTCAGTTTGACAATAAAGTCAAACAGATCTATCAAGATATATGTAGCTGATTGCTAGCACCGTGGCTCCAACTTTTGTGCTATTCAGAGTACAAACTTGTTATAAGGTGACGTAATCACTGATAATATAAGTCTAATTAAGACATTATGTTTATGTACCTTTGGTAGATCGTATATGTAATAAAAATGAAACCACTGGGGCCGTTGAATATTGTGCGTTACGTTATCAGTGAGCTTCTTCCTTAAAAGTCTTTTGAGTGTATTAGTGATTTGCTTTTCCCGAGAATCAATGAAATCTTCATTTCATTTATCTAAAATCTTGATCATTTCGAATTAGTTTCACCTTAGTAATACAANTCGACTGTTTTCATTAGCACAACATG]

[+] EMBL CD202034             [GTAATTAAAGTTGTTTCAAATAATATACTGGCAGAGGTTAGAGGTCATAATGTCGGTAAACGATTTCTGTAATTTCAGGAAAAGGCACTTTGGTAAACAAAAAAAACTATTAGGCTACCAAGGTTGTTTACATCATTCAGTTTGACAATAAAGTCAAACAGATCTATCAAGATATATGTAGCTGATTGCTAGCACCGTGGCTCCAACTTTTGTGCTATTCAGAGTACAAACTTGTTATAAGGTGACGTAATCACTGATAATATAAGTCTAATTAAGACATTATGTTTATGTACCTTTGGTAGATCGTATATGTAATAAAAATGAAACCACTGGGGCCGTTGAATATTGTGCGTTACGTTATCAGTGAGCTTCTTCCTTAAAAGTCTTTTGAGTGTATTAGTGATTTGCTTTTCCCGAGAATCAATGAAATCTTCATTTCATTTATCTAAAATCTTGATCATTTCGAATTAGTTTCACCTTAGTAATACAANTCGACTGTTTTCATTAGCACAACATG]
[-] EMBL CD202018             [ TAATTAAAGTTGTTTCAAATAATATACTGGCAGAGGTTAGAGGTCAGAATGTCGGTAAACGATTTCTGTAATTTCAGGAAAAGGCACTTTGGTAAACAAAAAAAACTATTAGGCTACCAAGGTTGTTTACATCATTCAGTTTGACAATAAAGTCAAACAGATCTATCAAGATATATGTAGCTGATTGCTAGCACCGTGGCTCCAACTTTTGTGCTATTCAGAGTACAAACTTGTTATAAGGTGACGTAATCACTGATAATATAAGTCTAATTAAGACATTATGTTTATGTACCTTTGGTAGATCGTATATGTAACAAAAATGAAACCACTGGGGCCGTTGCATATTGTGCGTTACGTTATCAGTGAGCTTCTTCCTTAAAAGTCTTTTGAGTGTATTAGTGATTTGCTTTTCCCGAGAATCAATGAAATCTTCATTTCATTTATCTAAAATCTTGATCATTTCGAATTAGTTTCATCTTAGTAATACAA TCAACTGTTTTCATTAGCACAACATG]




>consensus_3638#0
GTAATTAAAGTTGTTTCAAATAATATACTGGCAGAGGTTAGAGGTCATAATGTCGGTAAA
CGATTTCTGTAATTTCAGGAAAAGGCACTTTGGTAAACAAAAAAAACTATTAGGCTACCA
AGGTTGTTTACATCATTCAGTTTGACAATAAAGTCAAACAGATCTATCAAGATATATGTA
GCTGATTGCTAGCACCGTGGCTCCAACTTTTGTGCTATTCAGAGTACAAACTTGTTATAA
GGTGACGTAATCACTGATAATATAAGTCTAATTAAGACATTATGTTTATGTACCTTTGGT
AGATCGTATATGTAATAAAAATGAAACCACTGGGGCCGTTGAATATTGTGCGTTACGTTA
TCAGTGAGCTTCTTCCTTAAAAGTCTTTTGAGTGTATTAGTGATTTGCTTTTCCCGAGAA
TCAATGAAATCTTCATTTCATTTATCTAAAATCTTGATCATTTCGAATTAGTTTCACCTT
AGTAATACAANTCGACTGTTTTCATTAGCACAACATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case