cluster # 366

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Schistosoma mansoni
cluster # 366 cluster # 366 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_366#0 length = 621 sequences # 2

consensusID : consensus_366#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 621
fasta sequence

                              [CACGAATACTGACGTCTACTTCTCCAGTTGGTATGGCAGTTTTTATACTAGGTGCTGTTTGTACAGGTATCTCGTTGTTTGGTTATTGTGGAGCCTGTTGTAATATGAAGATATTACTTTATATATACGCAATTTTAGTAGGAGCATTGGCACTTGCTTTCCTGATCACATTCAGTGTGTACTTCTCTCGTAAAGATGAGATTGGAAACAGAGCAATTGACCTATTCGAGACAAGTGTCAAGAATTATCAATCAATGGCAGCAAATACAATTGACAGCTTAGTGGTTGGCTTAATCTCACCTCCACTTCAATGTTGTGGTGTGAATAATGGAGATGACTTTACAACTTCACCTAATTTCTGGAGAAATGACACTTACGGTGGTAAAACATATAATAATATTGCATATCCTGTAGTATGTTGCAAATTGAATCAAAATTATGCAATTATTGATTCTACATGTCCAGATCAATTTAATGAAAATAACAGTAATTATAAAACTGGTTGTAGAGGTCCATTAAAAGAACTTTTCCTTAAATATATGGACTTTGTAGCTTATGGATTAATTGCAGCATTTGTTATATTGTTGCTCGTTGTTATATTCACACTTTTAACCATCTATA]

[+] EMBL AW017458             [CACGAATACTGACGTCTACTTCTCCAGTTGGTATGGCAGTTTTTATACTAGGTGCTGTTTGTACAGGTATCTCGTTGTTTGGTTATTGTGGAGCCTGTTGTAATATGAAGATATTACTTTATATATACGCAATTTTAGTAGGAGCATTGGCACTTGCTTTCCTGATCACATTCAGTGTGTACTTCTCTCGTAAAGATGAGATTGGAAACAGAGCAATTGACCTATTCGAGACAAGTGTCAAGAATTATCAATCAATGGCAGCAAATACAATTGACAGCTTAGTGGTTGGCTTAATCTCACCTCCACTTCAATGTTGTGGTGTGAATAATGGAGATGACTTTACAACTTCACCTAATTTCTGGAGAAATGACACTTACGGTGGTAAAACATATAATAATATTGCATATCCTGTAGTATGTTGCAAATTGAATCAAAATTATGCAATTATTGATTCTACATGTCCAGATCAATTTAATGAAAATAACAGTAATTATAAAACTGGTTGTAGAGGTCCATTAAAAGAACTTTTCCTTAAATATATGGACTTTGTAGCTTATGGATTAATTGCAGCATTTGTTATATTGTTGCTCGTTGTTATATTCACACTTTTAACCATCTATA]
[-] EMBL CD123961             [                TACTTGTGCAGGTGGTATGGCAGTTTTTATACTAGGTGCTGTTTGTACAGGTATCTCGTTGTTTGGTTATTGTGGAGCCTGTTGTAATATGAAGATATTACTTTATTTATACGCAATTTTAGTAGGAGCATTGGCACTTGCTTTCCTGATCGCATTCAGTGTGTACTTCTCTCGTAAAGATGAGATTGGAAACAGAGCAATTGACCTATTCGAGACAAGTGTCAAGAATTATCAATCAATGGCAGCAAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]




>consensus_366#0
CACGAATACTGACGTCTACTTCTCCAGTTGGTATGGCAGTTTTTATACTAGGTGCTGTTT
GTACAGGTATCTCGTTGTTTGGTTATTGTGGAGCCTGTTGTAATATGAAGATATTACTTT
ATATATACGCAATTTTAGTAGGAGCATTGGCACTTGCTTTCCTGATCACATTCAGTGTGT
ACTTCTCTCGTAAAGATGAGATTGGAAACAGAGCAATTGACCTATTCGAGACAAGTGTCA
AGAATTATCAATCAATGGCAGCAAATACAATTGACAGCTTAGTGGTTGGCTTAATCTCAC
CTCCACTTCAATGTTGTGGTGTGAATAATGGAGATGACTTTACAACTTCACCTAATTTCT
GGAGAAATGACACTTACGGTGGTAAAACATATAATAATATTGCATATCCTGTAGTATGTT
GCAAATTGAATCAAAATTATGCAATTATTGATTCTACATGTCCAGATCAATTTAATGAAA
ATAACAGTAATTATAAAACTGGTTGTAGAGGTCCATTAAAAGAACTTTTCCTTAAATATA
TGGACTTTGTAGCTTATGGATTAATTGCAGCATTTGTTATATTGTTGCTCGTTGTTATAT
TCACACTTTTAACCATCTATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case