Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 373 cluster # 373       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_373#0 length = 596 sequences # 2  

consensusID : consensus_373#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 596
fasta sequence
                              [TTAATTCAATTCTCTATTCCTCAATTGAAAGTTATTATGAATGATTTGCATTCTAGAATTGAAAGTTTGAACAATTCTCTAATGTTATCATTAGTTGAAAGAGATGAGTTACACTTAGAACAAGGCGGTAAATTAATTGCTTTAGAAGATATCAAGTCCTGGATTAAAGAACTCAATATTCGTTCATCAATCCCTCAAGTTAGGCGACAATTATTTCTTAATCTTTCAAGTAATTTATCAAATAACACATAAAGTAATGATGTTTTTCTTAAACCTCAAACCAAACATAACACTTTATCAAAAAAACCACAATGGATGACATCCTTATTTGGTCGAGCATCACAGCGACATACTCTTTCATTATAAGATTATATATTAATTTTTTTTCTTTTTGTATATCTCAGATTTCATATATTTCCCTATTTGAAGAATTATGATCTTCAAAAATATGTCTTGTTCATTCCCAAATCCTTCTTCTATTTGACTTGTCTAATTCCCATCCTAAATTGATCTATACTTGTGCAGCTAATCGTTTTTTCTTTAATATTTACAAAGTAATTGTTAATGACAGGATCTAAATGACCTATTAAAGAATA]

[+] EMBL CD201364             [TTAATTCAATTCTCTATTCCTCAATTGAAAGTTATTATGAATGATTTGCATTCTAGAATTGAAAGTTTGAACAATTCTCTAATGTTATCATTAGTTGAAAGAGATGAGTTACACTTAGAACAAGGCGGTAAATTAATTGCTTTAGAAGATATCAAGTCCTGGATTAAAGAACTCAATATTCGTTCATCAATCCCTCAAGTTAGGCGACAATTATTTCTTAATCTTTCAAGTAATTTATCAAATAACACATAAAGTAATGATGTTTTTCTTAAACCTCAAACCAAACATAACACTTTATCAAAAAAACCACAATGGATGACATCCTTATTTGGTCGAGCATCACAGCGACATACTCTTTCATTATAAGATTATATATTAATTTTTTTTCTTTTTGTATATCTCAGATTTCATATATTTCCCTATTTGAAGAATTATGATCTTCAAAAATATGTCTTGTTCATTCCCAAATCCTTCTTCTATTTGACTTGTCTAATTCCCATCCTAAATTGATCTATACTTGTGCAGCTAATCGTTTTTTCTTTAATATTTACAAAGTAATTGTTAATGACAGGATCTAAATGACCTATTAAAGAATA]
[-] EMBL CD183176             [                                                                                            gtTTGAAAGAGATGAGTTACACTTAGAACAAGGCGGTAAATTAATTGCTTTAGAAGATATCAAGTCCTGGATTAAAGAACTCAATATTCGTTCATCAATCCCTCAAGTTAGGCGACAATTATTTCTTAATCTTTCAAGTAATTTATCAAATAACACATACAGTAATGATGTTTTTCTTAAACCTCctccca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]


>consensus_373#0 TTAATTCAATTCTCTATTCCTCAATTGAAAGTTATTATGAATGATTTGCATTCTAGAATT GAAAGTTTGAACAATTCTCTAATGTTATCATTAGTTGAAAGAGATGAGTTACACTTAGAA CAAGGCGGTAAATTAATTGCTTTAGAAGATATCAAGTCCTGGATTAAAGAACTCAATATT CGTTCATCAATCCCTCAAGTTAGGCGACAATTATTTCTTAATCTTTCAAGTAATTTATCA AATAACACATAAAGTAATGATGTTTTTCTTAAACCTCAAACCAAACATAACACTTTATCA AAAAAACCACAATGGATGACATCCTTATTTGGTCGAGCATCACAGCGACATACTCTTTCA TTATAAGATTATATATTAATTTTTTTTCTTTTTGTATATCTCAGATTTCATATATTTCCC TATTTGAAGAATTATGATCTTCAAAAATATGTCTTGTTCATTCCCAAATCCTTCTTCTAT TTGACTTGTCTAATTCCCATCCTAAATTGATCTATACTTGTGCAGCTAATCGTTTTTTCT TTAATATTTACAAAGTAATTGTTAATGACAGGATCTAAATGACCTATTAAAGAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)