Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3739 cluster # 3739       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3739#0 length = 739 sequences # 2  

consensusID : consensus_3739#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 739
fasta sequence
                              [GATGAAATATTTGAAACAGTAGAAGAAATTAATGATTTTGAATATTGTAATACTGGAAGATTATCATCAGAAAGGTTAGTTGTAGTTGTTATGATGGAATTTTCATTTGACTGAATATTATTAACTGATTTAGATATAGACAATGAAGTATTGTTAAGATCTAATGATGAACTTAATTCGTTGACATTTACTTTAGGTGATTCTGTGGAAGTTTTTTGCATGAATGTTAGTTTCACTAAAGTGTTTATCATGTTCATTCATGCCAACAGTTGAATTAAGATTTACTAACTCATTTTTAATATTGACTGGTACTACTTGACCAATTGTACCAGTTAAACGTGCTTCTAAAATATTCTCTTGTAATTGTTCTGCTTCAAATTCAGGTTTAATTAGGCGACGATTTGATCTTAAAAGATGTCCTTCTAATCTTGATGAATGATTATGACTTTTGGAATTATTTATTTCATTTTTATCATGTGAAATACCATTCATCGATTGTTTAACATTAGAAGATTTTAATCGTGAACGTGAATTTTTTTGGATTTCATCTAAATCCATTTTACCAATAACATGTGTAGTTATATCAACTAATGATGTTGTTTCAACTATTTCATTTAAACTATATTTAATAGAGATCATAATTGATTGTTTTAAATTTGAATGTTGTGAAGTTGCTTCTTTCATTTCAGGTGGAATCCAAAAATCTTTAATTGCTTTTTCCAACAACATCATTCCCATA]

[-] EMBL CD186106             [GATGAAATATTTGAAACAGTAGAAGAAATTAATGATTTTGAATATTGTAATACTGGAAGATTATCATCAGAAAGGTTAGTTGTAGTTGTTATGATGGAATTTTCATTTGACTGAATATTATTAACTGATTTAGATATAGACAATGAAGTATTGTTAAGATCTAATGATGAACTTAATTCGTTGACATTTACTTTAGGTGATTCTGTGGAAGTTTTTTGCATGAATGTTAGTTTCACTAAAGTGTTTATCATGTTCATTCATGCCAACAGTTGAATTAAGATTTACTAACTCATTTTTAATATTGACTGGTACTACTTGACCAATTGTACCAGTTAAACGTGCTTCTAAAATATTCTCTTGTAATTGTTCTGCTTCAAATTCAGGTTTAATTAGGCGACGATTTGATCTTAAAAGATGTCCTTCTAATCTTGATGAATGATTATGACTTTTGGAATTATTTATTTCATT                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD127381             [                                                                                                                 gATATTATTAACTGATTTAGATATAGACAATGAAGTATTGTTACGATCTAATGATGAACTTAATTCGTTGACATTTACTTTAGGTGATTCTGTGGAAG TTTTTGCATGAATGTTAGTTTCACTAAAGTGTTTATCATGTTCATTCATGCCAACAGTTGAATTAAGATTTACTAACTCATTTTTAATATTGACTGGTACTACTTGACCAATTGTACCAGTTAAACGTGCTTCTAAAATATTCTCTTGTAATTGTTCTGCTTCAAATTCAGGTTTAATTAGGCGACGATTTGATCTTAAAAGATGTCCTTCTAATCTTGATGAATGATTATGACTTTTGGAATTATTTATTTCATTTTTATCATGTGAAATACCATTCATCGATTGTTTAACATTAGAAGATTTTAATCGTGAACGTGAATTTTTTTGGATTTCATCTAAATCCATTTTACCAATAACATGTGTAGTTATATCAACTAATGATGTTGTTTCAACTATTTCATTTAAACTATATTTAATAGAGATCATAATTGATTGTTTTAAATTTGAATGTTGTGAAGTTGCTTCTTTCATTTCAGGTGGAATCCAAAAATCTTTAATTGCTTTTTCCAACAACATCATTCCCATA]


>consensus_3739#0 GATGAAATATTTGAAACAGTAGAAGAAATTAATGATTTTGAATATTGTAATACTGGAAGA TTATCATCAGAAAGGTTAGTTGTAGTTGTTATGATGGAATTTTCATTTGACTGAATATTA TTAACTGATTTAGATATAGACAATGAAGTATTGTTAAGATCTAATGATGAACTTAATTCG TTGACATTTACTTTAGGTGATTCTGTGGAAGTTTTTTGCATGAATGTTAGTTTCACTAAA GTGTTTATCATGTTCATTCATGCCAACAGTTGAATTAAGATTTACTAACTCATTTTTAAT ATTGACTGGTACTACTTGACCAATTGTACCAGTTAAACGTGCTTCTAAAATATTCTCTTG TAATTGTTCTGCTTCAAATTCAGGTTTAATTAGGCGACGATTTGATCTTAAAAGATGTCC TTCTAATCTTGATGAATGATTATGACTTTTGGAATTATTTATTTCATTTTTATCATGTGA AATACCATTCATCGATTGTTTAACATTAGAAGATTTTAATCGTGAACGTGAATTTTTTTG GATTTCATCTAAATCCATTTTACCAATAACATGTGTAGTTATATCAACTAATGATGTTGT TTCAACTATTTCATTTAAACTATATTTAATAGAGATCATAATTGATTGTTTTAAATTTGA ATGTTGTGAAGTTGCTTCTTTCATTTCAGGTGGAATCCAAAAATCTTTAATTGCTTTTTC CAACAACATCATTCCCATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)