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Schistosoma mansoni
cluster # 3837 cluster # 3837       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3837#0 length = 898 sequences # 2  

consensusID : consensus_3837#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 898
fasta sequence
                              [ATATCCACTGCTAACCAACATTTGTGTATTTGTTAATCAAGAATGTGTCAACTTTGAACACTGTGATTCTTCATGAAATTTACATACTTTGTCTTATATGTATTCGCTGTTGAGTCTTTCAGTTTGCGAAAAGTGGTATCAGGTGATTATTTCGGCTTTTGAGCAATGGTACATTCAAAGTGTTATATAAATCGGATGTTGAATTTTGAAACCTAATGTATATGATGAAGAAAGTTCTGATTTCAGCCTGTTGATTTCATGACGGTTTACCTACTTTCTAAAGAACATTTTGATGAGTTTGTATCAGTCGACATTCTTACACAGAACGGATATGAGATAAGTGCATTTCACGCTTTGTTTGTTGAGAAAGCTTCAGCGACTTTTGGTTTACGTGTAACGCATATTCAAAAAACCTCATCTAATGAACCGTTTGATTTACTGTAGTCAGGATGTGAACAAAAACGGAAAAGTTATTCTACTTGTTCATCGAAACTGCGTTNTGATAATATTATCATATTGTCATTGTCACAGAACCTGACCTGACTGGTCATTCTGGAAAAGAATTTCAGCTGCAGCAAGATGGTCAAGTTCACTTTAATTCC-ATTACTCATCACTGTTTTAGTAATTTAATTCTGAGTTCAATGTTGATTGCGAATTGTACATGATGTTTTTCAGAATTAACTTTCATTGAAAAATTGCTACTCATTTCATATTTCACATTGATCGTTGTTCATATGAAGAACGGGTTTTTCTGCTAATGTTTCCGATTCCTTTCCATTTTAACAAAGTATCCACTGTAGTTTGGCTAATTTTTCCGTTACATTTTCAGATTGTCTTTCATCTGTTAATCAAATGCTTGATTCACCTTTGTAACTATTAGTGCTAATTTATACATACT]

[+] EMBL CD079011             [ATATCCACTGCTAACCAACATTTGTGTATTTGTTAATCAAGAATGTGTCAACTTTGAACACTGTGATTCTTCATGAAATTTACATACTTTGTCTTATATGTATTCGCTGTTGAGTCTTTCAGTTTGCGAAAAGTGGTATCAGGTGATTATTTCGGCTTTTGAGCAATGGTACATTCAAAGTGTTATATAAATCGGATGTTGAATTTTGAAACCTAATGTATATGATGAAGAAAGTTCTGATTTCAGCCTGTTGATTTCATGACGGTTTACCTACTTTCTAAAGAACATTTTGATGAGTTTGTATCAGTCGACATTCTTACACAGAACGGATATGAGATAAGTGCATTTCACGCTTTGTTTGTTGAGAAAGCTTCAGCGACTTTTGGTTTACGTGTAACGCATATTCAAAAAACCTCATCTAATGAACCGTTTGATTTACTGTAGTCAGGATGTGAACAAAAACGGAAAAGTTATTCTACTTGTTCATCGAAACTGCGTTNTGATAATATTATCATATTGTCATTGTCACAGAACCTGACCTGACTGGTCATTCTGGAAAAGAATTTCAGCTGCAGCAAGATGGTCAAGTTCACTTTAATTCC ATTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD073460             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCATTTCACGCTTTGTTTG TGAGAAAGCTTCAGCGACTTTTGGTTTACGTGTAACGCATATTCAAAAAACCTCATCTAATGAACCGTTTGATTTACTGTAGTCAGGATGTGAACAAAAACGGAAAAGTTATTCTACTTGTTCATCGAAACTGCGTTTTGATAATATTATCATATTGTCATTGTCACAGAACCTGACCTGACTGGTCATTCTGGAAAAGAATTTCAGCTGCAGCAAGATGGTCAAGTTCACTTTAATTCCAATTACTCATCACTGTTTTAGTAATTTAATTCTGAGTTCAATGTTGATTGCGAATTGTACATGATGTTTTTCAGAATTAACTTTCATTGAAAAATTGCTACTCATTTCATATTTCACATTGATCGTTGTTCATATGAAGAACGGGTTTTTCTGCTAATGTTTCCGATTCCTTTCCATTTTAACAAAGTATCCACTGTAGTTTGGCTAATTTTTCCGTTACATTTTCAGATTGTCTTTCATCTGTTAATCAAATGCTTGATTCACCTTTGTAACTATTAGTGCTAATTTATACATACT]


>consensus_3837#0 ATATCCACTGCTAACCAACATTTGTGTATTTGTTAATCAAGAATGTGTCAACTTTGAACA CTGTGATTCTTCATGAAATTTACATACTTTGTCTTATATGTATTCGCTGTTGAGTCTTTC AGTTTGCGAAAAGTGGTATCAGGTGATTATTTCGGCTTTTGAGCAATGGTACATTCAAAG TGTTATATAAATCGGATGTTGAATTTTGAAACCTAATGTATATGATGAAGAAAGTTCTGA TTTCAGCCTGTTGATTTCATGACGGTTTACCTACTTTCTAAAGAACATTTTGATGAGTTT GTATCAGTCGACATTCTTACACAGAACGGATATGAGATAAGTGCATTTCACGCTTTGTTT GTTGAGAAAGCTTCAGCGACTTTTGGTTTACGTGTAACGCATATTCAAAAAACCTCATCT AATGAACCGTTTGATTTACTGTAGTCAGGATGTGAACAAAAACGGAAAAGTTATTCTACT TGTTCATCGAAACTGCGTTNTGATAATATTATCATATTGTCATTGTCACAGAACCTGACC TGACTGGTCATTCTGGAAAAGAATTTCAGCTGCAGCAAGATGGTCAAGTTCACTTTAATT CCATTACTCATCACTGTTTTAGTAATTTAATTCTGAGTTCAATGTTGATTGCGAATTGTA CATGATGTTTTTCAGAATTAACTTTCATTGAAAAATTGCTACTCATTTCATATTTCACAT TGATCGTTGTTCATATGAAGAACGGGTTTTTCTGCTAATGTTTCCGATTCCTTTCCATTT TAACAAAGTATCCACTGTAGTTTGGCTAATTTTTCCGTTACATTTTCAGATTGTCTTTCA TCTGTTAATCAAATGCTTGATTCACCTTTGTAACTATTAGTGCTAATTTATACATACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)