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Schistosoma mansoni
cluster # 3867 cluster # 3867       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3867#0 length = 847 sequences # 2  

consensusID : consensus_3867#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 847
fasta sequence
                              [CTTGTTGAAATATTCAGATGGCATAAACACGTAGTCCTGATATTTAAGCAGGCCGCCTGTATGAATAATACCTAGTTAATTTCATCAACTCCTTGCCGTTCGCTACAGGGAATTTCTAATAACTCATAGATTTTCTTCATTGAAAACGACCCCAGGGAGTTAGAACATTGAGATGCTATCAGCAATACTTACCTTCTTTTATATTTCACAGGCAATGAATACATTTATGCTGAATGTGAAACAAGATAATGTACAAAAATTCATCATCATAAGGAAAACAGACTCTATGTAAACGTCAATAAGTCAACAAGTTTATACAAGGGTACTGTTTAAATACATGCTAAAAATCCTGTTATGCCATTATAGTTGGGAAGGCATCTTGAAGACATTCTGATGAAAGACTAGTGCAATCCAATTTTGGATGAAGCAATGCTACGCTTAACCTCTAGACTACTGAGTCATTATTCAACGGTATGAATGTCTGATTTAAATAATTTCACAGCATTGNGTAATATGCATTTATTTTTTAATGTAAATAAATACCTTACTTTGTCCTTGGTGGAATTCCATTTATCACAAAAATAATTTGAGTAATCCATTTTTTCCCTTCAGGATAATGGAGCCCATGTGCATGGTACTTTAATACGTTGAACATGATAATCCACGTTAGATGCTGATTGTGAGGTGTGATTTTGAAGCATCCAATCATTTGACATAGGTTATCAACGTCGATGGTTTACAATGTATTATCATGAAATTTAGGTTTTTTTCATTTGGTTATCACTAATACATTAAATGTTGAATTGTTTTTGACTTATTATGAAAACATTGAAATTGTGATAATCCT]

[+] EMBL CD079060             [CTTGTTGAAATATTCAGATGGCATAAACACGTAGTCCTGATATTTAAGCAGGCCGCCTGTATGAATAATACCTAGTTAATTTCATCAACTCCTTGCCGTTCGCTACAGGGAATTTCTAATAACTCATAGATTTTCTTCATTGAAAACGACCCCAGGGAGTTAGAACATTGAGATGCTATCAGCAATACTTACCTTCTTTTATATTTCACAGGCAATGAATACATTTATGCTGAATGTGAAACAAGATAATGTACAAAAATTCATCATCATAAGGAAAACAGACTCTATGTAAACGTCAATAAGTCAACAAGTTTATACAAGGGTACTGTTTAAATACATGCTAAAAATCCTGTTATGCCATTATAGTTGGGAAGGCATCTTGAAGACATTCTGATGAAAGACTAGTGCAATCCAATTTTGGATGAAGCAATGCTACGCTTAACCTCTAGACTACTGAGTCATTATTCAACGGTATGAATGTCTGATTTAAATAATTTCACAGCATTGNGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD073514             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTGGATGAAGCAATGGTACGGTTAACCTTTAGACTACTGAGTCATTATTCAACGGTATGAATGTTTGATTTAAATAATTTCACAGCATTGTGTAATATGCATTTATTTTTTAATGTAAATAAATACCTTACTTTGTCCTTGGTGGAATTCCATTTATCACAAAAATAATTTGAGTAATCCATTTTTTCCCTTCAGGATAATGGAGCCCATGTGCATGGTACTTTAATACGTTGAACATGATAATCCACGTTAGATGCTGATTGTGAGGTGTGATTTTGAAGCATCCAATCATTTGACATAGGTTATCAACGTCGATGGTTTACAATGTATTATCATGAAATTTAGGTTTTTTTCATTTGGTTATCACTAATACATTAAATGTTGAATTGTTTTTGACTTATTATGAAAACATTGAAATTGTGATAATCCT]


>consensus_3867#0 CTTGTTGAAATATTCAGATGGCATAAACACGTAGTCCTGATATTTAAGCAGGCCGCCTGT ATGAATAATACCTAGTTAATTTCATCAACTCCTTGCCGTTCGCTACAGGGAATTTCTAAT AACTCATAGATTTTCTTCATTGAAAACGACCCCAGGGAGTTAGAACATTGAGATGCTATC AGCAATACTTACCTTCTTTTATATTTCACAGGCAATGAATACATTTATGCTGAATGTGAA ACAAGATAATGTACAAAAATTCATCATCATAAGGAAAACAGACTCTATGTAAACGTCAAT AAGTCAACAAGTTTATACAAGGGTACTGTTTAAATACATGCTAAAAATCCTGTTATGCCA TTATAGTTGGGAAGGCATCTTGAAGACATTCTGATGAAAGACTAGTGCAATCCAATTTTG GATGAAGCAATGCTACGCTTAACCTCTAGACTACTGAGTCATTATTCAACGGTATGAATG TCTGATTTAAATAATTTCACAGCATTGNGTAATATGCATTTATTTTTTAATGTAAATAAA TACCTTACTTTGTCCTTGGTGGAATTCCATTTATCACAAAAATAATTTGAGTAATCCATT TTTTCCCTTCAGGATAATGGAGCCCATGTGCATGGTACTTTAATACGTTGAACATGATAA TCCACGTTAGATGCTGATTGTGAGGTGTGATTTTGAAGCATCCAATCATTTGACATAGGT TATCAACGTCGATGGTTTACAATGTATTATCATGAAATTTAGGTTTTTTTCATTTGGTTA TCACTAATACATTAAATGTTGAATTGTTTTTGACTTATTATGAAAACATTGAAATTGTGA TAATCCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)