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Schistosoma mansoni
cluster # 3883 cluster # 3883       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3883#0 length = 969 sequences # 2  

consensusID : consensus_3883#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 969
fasta sequence
                              [CGTTGATCCAGACAGATGATCAGAGAAACGAAGCGAAGACAGCGAAGACAAATGGATCGGAAAGGCGTGTGAGCCAATTCATTTTTATCAAGCATGATTCAATACTTATAGCCAGACAAAAGCAAGTTACAGACAAATGATGAATAGGGTAAGTAAGTAATTAACATATATTCGATCATATAAAAGCGGTCAGGGTTAATGAGCGAATAAGTGACAGGGTAACAATATGGCTTGCAAAGAATGAATAGATCGGTCTGTCCAGAGGCTAGAATAACCTGTGGGCTTGACATGGTATCAGCCCCAACAACATATTTAACAATCATATTTGCTATTAATAGAAGTGCTAGTAATGGTAGTTTATTAAATTATCCTTTAGTTTAATGAATAAATCTGTGTTAAACCAAGGCATCCAACCACTTAATTAATGCTTTTAAACAAATATTGACCTTGAAGGTTAGACTAACTTATTGACTAGTTATTCTTTATACAAGCAATTGTATATATTATTCATTCAGTCTTCTTATAATCCGATGGAATGACACGAAATCTACGTGATTCAATANACCAACTTAAGTTCTTGGAGTTCATTATGGTTTTCAATGTTTTAAAGATTTTACTAGGTAGTTATACATTGTATATTGATATCCTACCCTATCTACAGACAACTATTTTTAATAACTTCGTTTAAAGACCACTAAAGCAAAAATGAAGTATTTTTAGTGCTTATTAAAAGAATTTACGGTTAGATGAAAACTAAGTGGGATTATCGTACAAGGCTTTTTACCAATAACTTTCAACTATCTAACGTCCCAACCAATACGTATGATGTTTATTCACTTACCCAAATGGCTACATTCCAACTTAATCGAGATCTAGGTTCAATTTTTCTAATTGATCGATATAAAATTTTTATAATAATAGTTAATACATAAATTAAATCTTTGATATGGTATTTTCTGAATTTATCTA]

[+] EMBL CD079099             [CGTTGATCCAGACAGATGATCAGAGAAACGAAGCGAAGACAGCGAAGACAAATGGATCGGAAAGGCGTGTGAGCCAATTCATTTTTATCAAGCATGATTCAATACTTATAGCCAGACAAAAGCAAGTTACAGACAAATGATGAATAGGGTAAGTAAGTAATTAACATATATTCGATCATATAAAAGCGGTCAGGGTTAATGAGCGAATAAGTGACAGGGTAACAATATGGCTTGCAAAGAATGAATAGATCGGTCTGTCCAGAGGCTAGAATAACCTGTGGGCTTGACATGGTATCAGCCCCAACAACATATTTAACAATCATATTTGCTATTAATAGAAGTGCTAGTAATGGTAGTTTATTAAATTATCCTTTAGTTTAATGAATAAATCTGTGTTAAACCAAGGCATCCAACCACTTAATTAATGCTTTTAAACAAATATTGACCTTGAAGGTTAGACTAACTTATTGACTAGTTATTCTTTATACAAGCAATTGTATATATTATTCATTCAGTCTTCTTATAATCCGATGGAATGACACGAAATCTACGTGATTCAATANACCAACTTAAGTTCTTGGAGTTCATTATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD073553             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAATTGTATATATTATTCATTCAGTCTTCTTATAATCCGATGGAATGACACGAAATCTACGTGATTCAATAAACCAACTTAAGTTCTTGGAGTTCATTATGGTTTTCAATGTTTTAAAGATTTTACTAGGTAGTTATACATTGTATATTGATATCCTACCCTATCTACAGACAACTATTTTTAATAACTTCGTTTAAAGACCACTAAAGCAAAAATGAAGTATTTTTAGTGCTTATTAAAAGAATTTACGGTTAGATGAAAACTAAGTGGGATTATCGTACAAGGCTTTTTACCAATAACTTTCAACTATCTAACGTCCCAACCAATACGTATGATGTTTATTCACTTACCCAAATGGCTACATTCCAACTTAATCGAGATCTAGGTTCAATTTTTCTAATTGATCGATATAAAATTTTTATAATAATAGTTAATACATAAATTAAATCTTTGATATGGTATTTTCTGAATTTATCTA]


>consensus_3883#0 CGTTGATCCAGACAGATGATCAGAGAAACGAAGCGAAGACAGCGAAGACAAATGGATCGG AAAGGCGTGTGAGCCAATTCATTTTTATCAAGCATGATTCAATACTTATAGCCAGACAAA AGCAAGTTACAGACAAATGATGAATAGGGTAAGTAAGTAATTAACATATATTCGATCATA TAAAAGCGGTCAGGGTTAATGAGCGAATAAGTGACAGGGTAACAATATGGCTTGCAAAGA ATGAATAGATCGGTCTGTCCAGAGGCTAGAATAACCTGTGGGCTTGACATGGTATCAGCC CCAACAACATATTTAACAATCATATTTGCTATTAATAGAAGTGCTAGTAATGGTAGTTTA TTAAATTATCCTTTAGTTTAATGAATAAATCTGTGTTAAACCAAGGCATCCAACCACTTA ATTAATGCTTTTAAACAAATATTGACCTTGAAGGTTAGACTAACTTATTGACTAGTTATT CTTTATACAAGCAATTGTATATATTATTCATTCAGTCTTCTTATAATCCGATGGAATGAC ACGAAATCTACGTGATTCAATANACCAACTTAAGTTCTTGGAGTTCATTATGGTTTTCAA TGTTTTAAAGATTTTACTAGGTAGTTATACATTGTATATTGATATCCTACCCTATCTACA GACAACTATTTTTAATAACTTCGTTTAAAGACCACTAAAGCAAAAATGAAGTATTTTTAG TGCTTATTAAAAGAATTTACGGTTAGATGAAAACTAAGTGGGATTATCGTACAAGGCTTT TTACCAATAACTTTCAACTATCTAACGTCCCAACCAATACGTATGATGTTTATTCACTTA CCCAAATGGCTACATTCCAACTTAATCGAGATCTAGGTTCAATTTTTCTAATTGATCGAT ATAAAATTTTTATAATAATAGTTAATACATAAATTAAATCTTTGATATGGTATTTTCTGA ATTTATCTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)