Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 3905 cluster # 3905       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3905#0 length = 761 sequences # 2  

consensusID : consensus_3905#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 761
fasta sequence
                              [AAGATTTAGCCAAGTTAATTTGACGATTATGAGATTGCTGAATATCTGCATCGGATGGAGTTAAATGTCCGTATAATACATCCAGGTCAATTAGCTTTTTCCAAATTAAAAATGCTGAAACTTTGTACAATGACTTTGGCGTATTGACACCGGGTTCTTGTGTAAAATGATATTTGTGTCCCAATATATTAGTCATATCTATTCTATCAGGATTGTAAAGTCTTATCAACTGAACGAATTCCTCGTACATATCACCACGG-AATTCACAAACATCCAATATTAAGTCCAGGACACGATTTGGATCCAAATCAAAATAACCAATTAATGACCGAATCTGAATCATGACGGCTTCCATCGACGCAGTTGACGTTATTTGACACAATTCTGTGATCAGTTTGGCGTAGCCT-CATTTTCTTCAGGTAACAAATTAAATTTTTGTTGTTTGAAAAATAAACGCGTTTTAGTACGAACATAACGCGTTTGGAACTGTTGTTTCGACTGAATGAATGACAGGTTTTCCAAGGTGTCTTCACAAAACCTCTCCATTATCAAAGCAGGATTCACATGATTCCTAAGAATTTCTATTAACCGATAGAAACGATCTCGAACTAATTCTGAATTAATATCAGCAATTGACGAGTCAATTAACCAGAGTGAGTCTAACAGGTCGGATTCAAAGGATTCATTACCACCAAATATTTTAAATAGCTCAGGAACTAATTTGACAAGTATATCAATTTTCCCTTCTCCATTTATCAACT]

[-] EMBL CD127847             [AAGATTTAGCCAAGTTAATTTGACGATTATGAGATTGCTGAATATCTGCATCGGATGGAGTTAAATGTCCGTATAATACATCCAGGTCAATTAGCTTTTTCCAAATTAAAAATGCTGAAACTTTGTACAATGACTTTGGCGTATTGACACCGGGTTCTTGTGTAAAATGATATTTGTGTCCCAATATATTAGTCATATCTATTCTATCAGGATTGTAAAGTCTTATCAACTGAACGAATTCCTCGTACATATCACCACGG AATTCACAAACATCCAATATTAAGTCCAGGACACGATTTGGATCCAAATCAAAATAACCAATTAATGACCGAATCTGAATCATGACGGCTTCCATCGACGCAGTTGACGTTATTTGACACAATTCTGTGATCAGTTTGGCGTAGCCT CATTTTCTTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD167830             [                                                                                                                                                                                                                             CTTATCAACTGAACGAATTCCTCGTACATATCACCACGGNAATTCACAAACATCCAATATTAAGTCCAGGACACGATTTGGATCCAAATCAAAATAACCAATTAATGACCGAATCTGAATCATGACGGCTTCCATCGACGCAGTTGACGTTATTTGACACAATTCTGTGATCAGTTTGGCGTAGCCTACATTTTCTTCACGTAACAAATTAAATTTTTGTTGTTTGAAAAATAAACGCGTTTTAGTACGAACATAACGCGTTTGGAACTGTTGTTTCGACTGAATGAATGACAGGTTTTCCAAGGTGTCTTCACAAAACCTCTCCATTATCAAAGCAGGATTCACATGATTCCTAAGAATTTCTATTAACCGATAGAAACGATCTCGAACTAATTCTGAATTAATATCAGCAATTGACGAGTCAATTAACCAGAGTGAGTCTAACAGGTCGGATTCAAAGGATTCATTACCACCAAATATTTTAAATAGCTCAGGAACTAATTTGACAAGTATATCAATTTTCCCTTCTCCATTTATCAACT]


>consensus_3905#0 AAGATTTAGCCAAGTTAATTTGACGATTATGAGATTGCTGAATATCTGCATCGGATGGAG TTAAATGTCCGTATAATACATCCAGGTCAATTAGCTTTTTCCAAATTAAAAATGCTGAAA CTTTGTACAATGACTTTGGCGTATTGACACCGGGTTCTTGTGTAAAATGATATTTGTGTC CCAATATATTAGTCATATCTATTCTATCAGGATTGTAAAGTCTTATCAACTGAACGAATT CCTCGTACATATCACCACGGAATTCACAAACATCCAATATTAAGTCCAGGACACGATTTG GATCCAAATCAAAATAACCAATTAATGACCGAATCTGAATCATGACGGCTTCCATCGACG CAGTTGACGTTATTTGACACAATTCTGTGATCAGTTTGGCGTAGCCTCATTTTCTTCAGG TAACAAATTAAATTTTTGTTGTTTGAAAAATAAACGCGTTTTAGTACGAACATAACGCGT TTGGAACTGTTGTTTCGACTGAATGAATGACAGGTTTTCCAAGGTGTCTTCACAAAACCT CTCCATTATCAAAGCAGGATTCACATGATTCCTAAGAATTTCTATTAACCGATAGAAACG ATCTCGAACTAATTCTGAATTAATATCAGCAATTGACGAGTCAATTAACCAGAGTGAGTC TAACAGGTCGGATTCAAAGGATTCATTACCACCAAATATTTTAAATAGCTCAGGAACTAA TTTGACAAGTATATCAATTTTCCCTTCTCCATTTATCAACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)