cluster # 3936

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Schistosoma mansoni
cluster # 3936 cluster # 3936 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3936#0 length = 1170 sequences # 2

consensusID : consensus_3936#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1170
fasta sequence

                              [GGGCCAAAATTCGGCACGAGGGTTGCATGGGGATCTATGTAGCTGAAATGTACAGCAACTTTCCTACTTTGAAAAATGACAACATTATAAGAGCTGCAAAAGGTGAGGCCGTTTCTCGCCTACCTGTATGGATAATGCGTCAAGCTGGTCGTTATTTACCTGAGTTCCGTGAGCTACGTGAAAAACACGATTTCTTTGAGATTTGTCGTACTCCAGAACTTGCCTGTGCCGTAACTCTCCAACCCATAAATCGTTTCGATCTTGATGCTGCGATTATATTTTCGGATATATTGGTTATACCTCAGGCTCTTGGTATGGAAGTCAAGATGCAACCTGGTGTCGGACCTAAATTTACTGAACCTTTAAATTCAGTAAACGACTTAGATCGGCTAAATGCTCAAGTTGATGTACGAAAAGAATTAAACTATGTTTATGAATCAATAACTCTAACACGTTATCGACTAAATGGAAGGGTCCCATTGATCGGTTTTGCTGGTGCTCCTTGGACTCTAATGTCTTATATGANTTGAAGGTGGAAGTTCCAATACTTATTCCAAAGCGAAAAAATGGTTATACACCGAACCTCAATCAAGTCAAAGATTGCTTAGTCTACTTACTCAGANAGTTGTAGAGCATTTAATTCAACAGGTTCTTTCCGGTGCACAGTTACTTCAAGTTTTCGAATCTCATGCTGGCTTTCTTAGCCCATACTTTGGTCAATACATTTTGTTTACCATATTTGAAACAAATTTCGAATGAAGTACGAAGCCGTTTGTTGAATGAATACAGAATTCCTAGAGATTCTATTCCACCGCTCATCGTATTTGCTAAAGATGGCCATTATGCTCTTACTGAATTATCTAAAGCTGATTATGATGTTATTAGTCTAGATTGGACCATATCTCCTAGATTAGCTCGAAATACTGTTGGTTCTCATATCACATTACAAGGTAATTTAGATCCTTGCGCATTATATTTTAATGAGAATCAAATTTCAAGTTTAGTAAAAGAAATGATTAATGATTTCGGTATACATCGTTATATTGTCAATTTGGGTCATGGTATTTATCCCGATGTTGATCCGGATAAAGTAAACAAATTTGTTGATTTAGTACATCACTTAGCAAGTACAATGTTAANCAAATAAATATCTTTTGGTATTTTTTTAAA]

[+] EMBL CD079406             [GGGCCAAAATTCGGCACGAGGGTTGCATGGGGATCTATGTAGCTGAAATGTACAGCAACTTTCCTACTTTGAAAAATGACAACATTATAAGAGCTGCAAAAGGTGAGGCCGTTTCTCGCCTACCTGTATGGATAATGCGTCAAGCTGGTCGTTATTTACCTGAGTTCCGTGAGCTACGTGAAAAACACGATTTCTTTGAGATTTGTCGTACTCCAGAACTTGCCTGTGCCGTAACTCTCCAACCCATAAATCGTTTCGATCTTGATGCTGCGATTATATTTTCGGATATATTGGTTATACCTCAGGCTCTTGGTATGGAAGTCAAGATGCAACCTGGTGTCGGACCTAAATTTACTGAACCTTTAAATTCAGTAAACGACTTAGATCGGCTAAATGCTCAAGTTGATGTACGAAAAGAATTAAACTATGTTTATGAATCAATAACTCTAACACGTTATCGACTAAATGGAAGGGTCCCATTGATCGGTTTTGCTGGTGCTCCTTGGACTCTAATGTCTTATATGANTTGAAGGTGGAAGTTCCAATACTTATTCCAAAGCGAAAAAATGGTTATACACCGAACCTCAATCAAGTCAAAGATTGCTTAGTCTACTTACTCAGANAGTTGTAGAGCATTTAATTCAACAGGTTCTTTCCGGTGCACAGTTACTTCAAGTTTTCGAATCTCATGCTGGCTTTCTTAGCCCATACTTTGGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD073679             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTCTAATGTCTTATATGA TTGAAGGTGGAAGTTCCAATACTTATTCCAAAGCGAAAAAATGGTTATACACCGAACCTCAATCAAGTCAAAGATTGCTTAGTCTACTTACTCAGAAAGTTGTAGAGCATTTAATTCAACAGGTTCTTTCCGGTGCACAGTTACTTCAAGTTTTCGAATCTCATGCTGGCTTTCTTAGCCCATAC TTGTTCAATACATTTTGTTTACCATATTTGAAACAAATTTCGAATGAAGTACGAAGCCGTTTGTTGAATGAATACAGAATTCCTAGAGATTCTATTCCACCGCTCATCGTATTTGCTAAAGATGGCCATTATGCTCTTACTGAATTATCTAAAGCTGATTATGATGTTATTAGTCTAGATTGGACCATATCTCCTAGATTAGCTCGAAATACTGTTGGTTCTCATATCACATTACAAGGTAATTTAGATCCTTGCGCATTATATTTTAATGAGAATCAAATTTCAAGTTTAGTAAAAGAAATGATTAATGATTTCGGTATACATCGTTATATTGTCAATTTGGGTCATGGTATTTATCCCGATGTTGATCCGGATAAAGTAAACAAATTTGTTGATTTAGTACATCACTTAGCAAGTACAATGTTAANCAAATAAATATCTTTTGGTATTTTTTTAAA]




>consensus_3936#0
GGGCCAAAATTCGGCACGAGGGTTGCATGGGGATCTATGTAGCTGAAATGTACAGCAACT
TTCCTACTTTGAAAAATGACAACATTATAAGAGCTGCAAAAGGTGAGGCCGTTTCTCGCC
TACCTGTATGGATAATGCGTCAAGCTGGTCGTTATTTACCTGAGTTCCGTGAGCTACGTG
AAAAACACGATTTCTTTGAGATTTGTCGTACTCCAGAACTTGCCTGTGCCGTAACTCTCC
AACCCATAAATCGTTTCGATCTTGATGCTGCGATTATATTTTCGGATATATTGGTTATAC
CTCAGGCTCTTGGTATGGAAGTCAAGATGCAACCTGGTGTCGGACCTAAATTTACTGAAC
CTTTAAATTCAGTAAACGACTTAGATCGGCTAAATGCTCAAGTTGATGTACGAAAAGAAT
TAAACTATGTTTATGAATCAATAACTCTAACACGTTATCGACTAAATGGAAGGGTCCCAT
TGATCGGTTTTGCTGGTGCTCCTTGGACTCTAATGTCTTATATGANTTGAAGGTGGAAGT
TCCAATACTTATTCCAAAGCGAAAAAATGGTTATACACCGAACCTCAATCAAGTCAAAGA
TTGCTTAGTCTACTTACTCAGANAGTTGTAGAGCATTTAATTCAACAGGTTCTTTCCGGT
GCACAGTTACTTCAAGTTTTCGAATCTCATGCTGGCTTTCTTAGCCCATACTTTGGTCAA
TACATTTTGTTTACCATATTTGAAACAAATTTCGAATGAAGTACGAAGCCGTTTGTTGAA
TGAATACAGAATTCCTAGAGATTCTATTCCACCGCTCATCGTATTTGCTAAAGATGGCCA
TTATGCTCTTACTGAATTATCTAAAGCTGATTATGATGTTATTAGTCTAGATTGGACCAT
ATCTCCTAGATTAGCTCGAAATACTGTTGGTTCTCATATCACATTACAAGGTAATTTAGA
TCCTTGCGCATTATATTTTAATGAGAATCAAATTTCAAGTTTAGTAAAAGAAATGATTAA
TGATTTCGGTATACATCGTTATATTGTCAATTTGGGTCATGGTATTTATCCCGATGTTGA
TCCGGATAAAGTAAACAAATTTGTTGATTTAGTACATCACTTAGCAAGTACAATGTTAAN
CAAATAAATATCTTTTGGTATTTTTTTAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case