cluster # 3952

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Schistosoma mansoni
cluster # 3952 cluster # 3952 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3952#0 length = 607 sequences # 2

consensusID : consensus_3952#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 607
fasta sequence

                              [TGGTATTCGTTGTAATATGAGTTGGGCTATGTTGACTATGCAAGCTAGACACATAGCAGCAAATCTGTCTCATTTACCACATTCTAAACATTATGAGCATACACATCATGAATCTGGTGATCATGTGGTTGGATTCGGTGGACTGATGAATGTAACGGCGAAACCAGACTTCTATTGGACAGCTGGTCAAAGAGGATTTGTGGATAGTTCATTCTTTTATGGTTATTTAATAACTCAAATACCTGGTGGAGTAATAGCAGCTAAATTTCCAGCTAATAGATTATTTGGTATAGCTGTTGGTGGAAGTGCTTTTTTAAATTTATTATTACCAGCTGCTTGTAAAATTCATTTTGGATTAGTTATGATAATAAGAATGTTACAAGGTTTAGTTGAGGGTACATCTTATCCAGCATGTCATGGTATATGGAGATATTGGGCTCCACCACTTGAACGTTCTCGACTAGCAACAATTGCATTTTGTGGTTCGTATGCAGGTGCAGTACTTGGATTATCACTTTCCGGTCTACTAGCTCAACAAATGGGATGGCAGTCACCTTTNTACTTCTATGGTGTTGTCGGTCTTATGTGGTTCTTTTGGTGGTGAATG]

[+] EMBL CD153905             [TGGTATTCGTTGTAATATGAGTTGGGCTATGTTGACTATGCAAGCTAGACACATAGCAGCAAATCTGTCTCATTTACCACATTCTAAACATTATGAGCATACACATCATGAATCTGGTGATCATGTGGTTGGATTCGGTGGACTGATGAATGTAACGGCGAAACCAGACTTCTATTGGACAGCTGGTCAAAGAGGATTTGTGGATAGTTCATTCTTTTATGGTTATTTAATAACTCAAATACCTGGTGGAGTAATAGCAGCTAAATTTCCAGCTAATAGATTATTTGGTATAGCTGTTGGTGGAAGTGCTTTTTTAAATTTATTATTACCAGCTGCTTGTAAAATTCATTTTGGATTAGTTATGATAATAAGAATGTTACAAGGTTTAGTTGAGGGTACATCTTATCCAGCATGTCATGGTATATGGAGATATTGGGCTCCACCACTTGAACGTTCTCGACTAGCAACAATT                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD179966             [                                                                                                                                                                                                                                 TTTAATAACTCAAATACCTGGTGGAGTAATAGCAGCTAAATTTCCAGCTAATAGATTATTTGGTATAGCTGTTGGTGGAAGTGCTTTTTTAAATTTATTATTACCAGCTGCTTGTAAAATTCATTTTGGATTAGTTATGATAATAAGAATGTTACAAGG TTAGTTGAGGGTACATCTTATCCAGCATGTCATGGTATATGGAGATATTGGGCTCCACCACTTGAACGTTCTCGACTAGCAACAATTGCATTTTGTGGTTCGTATGCAGGTGCAGTACTTGGATTATCACTTTCCGGTCTACTAGCTCAACAAATGGGATGGCAGTCACCTTTNTACTTCTATGGTGTTGTCGGTCTTATGTGGTTCTTTTGGTGGTGAATG]




>consensus_3952#0
TGGTATTCGTTGTAATATGAGTTGGGCTATGTTGACTATGCAAGCTAGACACATAGCAGC
AAATCTGTCTCATTTACCACATTCTAAACATTATGAGCATACACATCATGAATCTGGTGA
TCATGTGGTTGGATTCGGTGGACTGATGAATGTAACGGCGAAACCAGACTTCTATTGGAC
AGCTGGTCAAAGAGGATTTGTGGATAGTTCATTCTTTTATGGTTATTTAATAACTCAAAT
ACCTGGTGGAGTAATAGCAGCTAAATTTCCAGCTAATAGATTATTTGGTATAGCTGTTGG
TGGAAGTGCTTTTTTAAATTTATTATTACCAGCTGCTTGTAAAATTCATTTTGGATTAGT
TATGATAATAAGAATGTTACAAGGTTTAGTTGAGGGTACATCTTATCCAGCATGTCATGG
TATATGGAGATATTGGGCTCCACCACTTGAACGTTCTCGACTAGCAACAATTGCATTTTG
TGGTTCGTATGCAGGTGCAGTACTTGGATTATCACTTTCCGGTCTACTAGCTCAACAAAT
GGGATGGCAGTCACCTTTNTACTTCTATGGTGTTGTCGGTCTTATGTGGTTCTTTTGGTG
GTGAATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case