cluster # 4002

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Schistosoma mansoni
cluster # 4002 cluster # 4002 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4002#0 length = 1045 sequences # 2

consensusID : consensus_4002#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1045
fasta sequence

                              [AGGAGACCATCAACTAAACGCGGTCCAATTGTTGTTGATGGAGTTGATTTATCACGAATTGGCCTTCATGAACTTCGATCTCGATTTAGTATTCTTCCACAGGAACCAATAATTTTTGCTGGTACACTTCGATTTAACTTAGATCCATTTGGTAAACTGCCTGATATCGATTTATGGCGTGCAATAGAATCTGCTCATTTAGCTGATTGGGTTCGGTCGACTAATGCCGGTTTGGATTATGAATGTGGTGAAGGTGGAGCAAATCTATCTGCTGGTCAGCGTCAACTCGTTTGTCTAGCTCGAGTATTCCTCTCTTCCGGTGGTCGTGTTCGTTTACTTATTCTTGACGAAGCCACAGCTGCAATGGATCCATCTACAGATAATTTAGTTATGAATACCGTAATAGGAGATATATTTAAAGATGCAACTGTAATTATTATTGCTCATCGTTTATCCACTGTAATGAATACAGATAGGATTGTTGTATTAGATCATGGACAAGTCATTGAAACTGGTCATCCACAAGATTTACTTAATAATCCAAATTCTCATTTTTCAATAATGAATAAAGTAAAACAATCTTGAATAAATTTCTGTTTACAATTTGTTTTCAATGTATTCAATTATTCATTATTCGTGTCATATGATTNTCCTTTNTATTACGTAATGAANAGGTAAATAAATTTAATATCATTGTTTGTATTTGTACAATGGTTATATTCATTGAATTAGTTTAATTACATTAGGAAGATAATTTATGATTTGTCGTTTATATGTTTAATTCTTATTTATTTTGTTCATAATTGTATACTATTTAATTATTATGTAATAATTTTAGGGATTTATTTCAACTAGTTCTTTTTCTTCTAGCTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTAGTACTACCTCCATCATCATCATCATCACCGTTGTATATGTTGTTGTTATTTGAAAACACGGTAAGGTCATATTCAACGATCAGTCATCTTGAAATATTACAAACATTCATTCTAGTTATACGAATTATACTAAAATTGTTTA]

[+] EMBL CD079558             [AGGAGACCATCAACTAAACGCGGTCCAATTGTTGTTGATGGAGTTGATTTATCACGAATTGGCCTTCATGAACTTCGATCTCGATTTAGTATTCTTCCACAGGAACCAATAATTTTTGCTGGTACACTTCGATTTAACTTAGATCCATTTGGTAAACTGCCTGATATCGATTTATGGCGTGCAATAGAATCTGCTCATTTAGCTGATTGGGTTCGGTCGACTAATGCCGGTTTGGATTATGAATGTGGTGAAGGTGGAGCAAATCTATCTGCTGGTCAGCGTCAACTCGTTTGTCTAGCTCGAGTATTCCTCTCTTCCGGTGGTCGTGTTCGTTTACTTATTCTTGACGAAGCCACAGCTGCAATGGATCCATCTACAGATAATTTAGTTATGAATACCGTAATAGGAGATATATTTAAAGATGCAACTGTAATTATTATTGCTCATCGTTTATCCACTGTAATGAATACAGATAGGATTGTTGTATTAGATCATGGACAAGTCATTGAAACTGGTCATCCACAAGATTTACTTAATAATCCAAATTCTCATTTTTCAATAATGAATAAAGTAAAACAATCTTGAATAAATTTCTGTTTACAATTTGTTTTCAATGTATTCAATTATTCATTATTCGTGTCATATGATTNTCCTTTNTATTACGTAATGAANAGGTAAATAAATTTAATATCATTGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD073825             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GAATACCGTAATAGGAGATATATTTAAAGATGCAACTGTAATTATTATTGCTCATCGTTTATCCACTGTAATGAATACAGATAGGATTGTTGTATTAGATCATGGACAAGTCATTGAAACTGGTCATCCACAAGATTTACTTAATAATCCAAATTCTCATTTTTCAATAATGAATAAAGTAAAACAATCTTGAATAAATTTCTGTTTACAATTTGTTTTCAATGTATTCAATTATTCATTATTCGTGTCATATGATTTTCCTTTTTATTACGTAATGAAAAGGTAAATAAATTTAATATCATTGTTTGTATTTGTACAATGGTTATATTCATTGAATTAGTTTAATTACATTAGGAAGATAATTTATGATTTGTCGTTTATATGTTTAATTCTTATTTATTTTGTTCATAATTGTATACTATTTAATTATTATGTAATAATTTTAGGGATTTATTTCAACTAGTTCTTTTTCTTCTAGCTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTAGTACTACCTCCATCATCATCATCATCACCGTTGTATATGTTGTTGTTATTTGAAAACACGGTAAGGTCATATTCAACGATCAGTCATCTTGAAATATTACAAACATTCATTCTAGTTATACGAATTATACTAAAATTGTTTA]




>consensus_4002#0
AGGAGACCATCAACTAAACGCGGTCCAATTGTTGTTGATGGAGTTGATTTATCACGAATT
GGCCTTCATGAACTTCGATCTCGATTTAGTATTCTTCCACAGGAACCAATAATTTTTGCT
GGTACACTTCGATTTAACTTAGATCCATTTGGTAAACTGCCTGATATCGATTTATGGCGT
GCAATAGAATCTGCTCATTTAGCTGATTGGGTTCGGTCGACTAATGCCGGTTTGGATTAT
GAATGTGGTGAAGGTGGAGCAAATCTATCTGCTGGTCAGCGTCAACTCGTTTGTCTAGCT
CGAGTATTCCTCTCTTCCGGTGGTCGTGTTCGTTTACTTATTCTTGACGAAGCCACAGCT
GCAATGGATCCATCTACAGATAATTTAGTTATGAATACCGTAATAGGAGATATATTTAAA
GATGCAACTGTAATTATTATTGCTCATCGTTTATCCACTGTAATGAATACAGATAGGATT
GTTGTATTAGATCATGGACAAGTCATTGAAACTGGTCATCCACAAGATTTACTTAATAAT
CCAAATTCTCATTTTTCAATAATGAATAAAGTAAAACAATCTTGAATAAATTTCTGTTTA
CAATTTGTTTTCAATGTATTCAATTATTCATTATTCGTGTCATATGATTNTCCTTTNTAT
TACGTAATGAANAGGTAAATAAATTTAATATCATTGTTTGTATTTGTACAATGGTTATAT
TCATTGAATTAGTTTAATTACATTAGGAAGATAATTTATGATTTGTCGTTTATATGTTTA
ATTCTTATTTATTTTGTTCATAATTGTATACTATTTAATTATTATGTAATAATTTTAGGG
ATTTATTTCAACTAGTTCTTTTTCTTCTAGCTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTA
TTAGTACTACCTCCATCATCATCATCATCACCGTTGTATATGTTGTTGTTATTTGAAAAC
ACGGTAAGGTCATATTCAACGATCAGTCATCTTGAAATATTACAAACATTCATTCTAGTT
ATACGAATTATACTAAAATTGTTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case