cluster # 4050

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Schistosoma mansoni
cluster # 4050 cluster # 4050 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4050#0 length = 890 sequences # 2

consensusID : consensus_4050#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 890
fasta sequence

                              [CCACGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGATTTTCAAAATAATAATAACAGTAATGGTAGTGGTAATGATGATTATCATAAATTTTTACCAAGTGATGTTAATTATCTGAATGGTCATTTGAATTCATTAGGTAACCAAGAGATAGCTCCACTCATTGATGTAACACATAAACAATAGTAAGCAATTATGATGGTCTATGAGATAGGAAGTGCTCTTGACAATATATCTATGGTTCATTTGATTTTA-TAGATTATTTTATAAATTATTAATTCACTGTTAGCTGCATTGTACTTTCTTTAACGTTGTCTACACTTTGCATCTATTATCTGTGCTTGGTACATTTTGTGTTTTGAGATTGTGCGTATATTTTTTTTTTAACGATACAAAATGTCTTAATACCCGGTAGGTTCGGAGAAATAAAATCTTTTTCGTAGCATATTGTGCTTTAGTGCTCGACCAAAATTTATATTTATTCATCCGAGTTGATTATCTTTCTGGTATCCATATTGATTTTCATCATTTTTTCATCCAGACTGGTGATTATCCTTTCATCGTTTATATATTGTAAAATTTCCCTAAATTACCATTCATTCAGTTATTTGGTTCCAGAAAGAAGATCATTTAAAAAGCACTCTAACTGTCTGTTGTGATTAGAGTTATTTATGACATTTAAATGTATTGCTAGAATCACATTACATCTGTTCTCATTTATCCANTTTGTTATACTCACTATGGCGTACCAGTTACCAACGTATATGTAACGTCATTATTTTGCATTTTTATACATTTTCTGATTATTAATAATAAGACAATATTTTTGTCATAATCCATGTATAAGACAATTCTTTCATTCCACATAAATTTTATTGTCCCAAAAAAAAAGTTAAAC]

[+] EMBL CD079668             [CCACGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGATTTTCAAAATAATAATAACAGTAATGGTAGTGGTAATGATGATTATCATAAATTTTTACCAAGTGATGTTAATTATCTGAATGGTCATTTGAATTCATTAGGTAACCAAGAGATAGCTCCACTCATTGATGTAACACATAAACAATAGTAAGCAATTATGATGGTCTATGAGATAGGAAGTGCTCTTGACAATATATCTATGGTTCATTTGATTTTA TAGATTATTTTATAAATTATTAATTCACTGTTAGCTGCATTGTACTTTCTTTAACGTTGTCTACACTTTGCATCTATTATCTGTGCTTGGTACATTTTGTGTTTTGAGATTGTGCGTATATTTTTTTTTTAACGATACAAAATGTCTTAATACCCGGTAGGTTCGGAGAAATAAAATCTTTTTCGTAGCATATTGTGCTTTAGTGCTCGACCAAAATTTATATTTATTCATCCGAGTTGATTATCTTTCTGGTATCCATATTGATTTTCATCATTTTTTCATCCAGACTGGTGATTATCCTTTCATCGTTTATATATTGTAAAATTTCCCTAAATTACCATTCATTCAGTTATTTGGTTCCAGAAAGAAGATCATTTAAAAAGCACTCTAACTGTCTGTTGTGATTAGAGTTATTTATGACATTTAAATGTATTGCTAGAATCACATTACATCTGTTCTCATTTATCCANTTTGTT                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD073928             [                                                                                                                                                                                                                                                   TTTANTAGATTATTTTATAAATTATTAATTCACTGTTAGCTGCATTGTACTTTCTTTAACGTTGTCTACACTTTGCATCTATTATCTGTGCTTGGTACATTTTGTGTTTTGAGATTGTGCGTATATTTTTTTTTTAACGATACAAAATGTCTTAATACCCGGTAGGTTCGGAGAAATAAAATCTTTTTCGTAGCATATTGTGCTTTAGTGCTCGACCAAAATTTATATTTATTCATCCGAGTTGATTATCTTTCTGGTATCCATATTGATTTTCATCATTTTTTCATCCAGACTGGTGATTATCCTTTCATCGTTTATATATTGTAAAATTTCCCTAAATTACCATTCATTCAGTTATTTGGTTCCAGAAAGAAGATCATTTAAAAAGCACTCTAACTGTCTGTTGTGATTAGAGTTATTTATGACATTTAAATGTATTGCTAGAATCACATTACATCTGTTCTCATTTATCCATTTTGTTATACTCACTATGGCGTACCAGTTACCAACGTATATGTAACGTCATTATTTTGCATTTTTATACATTTTCTGATTATTAATAATAAGACAATATTTTTGTCATAATCCATGTATAAGACAATTCTTTCATTCCACATAAATTTTATTGTCCCAAAAAAAAAGTTAAAC]




>consensus_4050#0
CCACGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGTGATTTTCAAAATAATAATAACAGTAATGGTAG
TGGTAATGATGATTATCATAAATTTTTACCAAGTGATGTTAATTATCTGAATGGTCATTT
GAATTCATTAGGTAACCAAGAGATAGCTCCACTCATTGATGTAACACATAAACAATAGTA
AGCAATTATGATGGTCTATGAGATAGGAAGTGCTCTTGACAATATATCTATGGTTCATTT
GATTTTATAGATTATTTTATAAATTATTAATTCACTGTTAGCTGCATTGTACTTTCTTTA
ACGTTGTCTACACTTTGCATCTATTATCTGTGCTTGGTACATTTTGTGTTTTGAGATTGT
GCGTATATTTTTTTTTTAACGATACAAAATGTCTTAATACCCGGTAGGTTCGGAGAAATA
AAATCTTTTTCGTAGCATATTGTGCTTTAGTGCTCGACCAAAATTTATATTTATTCATCC
GAGTTGATTATCTTTCTGGTATCCATATTGATTTTCATCATTTTTTCATCCAGACTGGTG
ATTATCCTTTCATCGTTTATATATTGTAAAATTTCCCTAAATTACCATTCATTCAGTTAT
TTGGTTCCAGAAAGAAGATCATTTAAAAAGCACTCTAACTGTCTGTTGTGATTAGAGTTA
TTTATGACATTTAAATGTATTGCTAGAATCACATTACATCTGTTCTCATTTATCCANTTT
GTTATACTCACTATGGCGTACCAGTTACCAACGTATATGTAACGTCATTATTTTGCATTT
TTATACATTTTCTGATTATTAATAATAAGACAATATTTTTGTCATAATCCATGTATAAGA
CAATTCTTTCATTCCACATAAATTTTATTGTCCCAAAAAAAAAGTTAAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case