cluster # 4083

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Schistosoma mansoni
cluster # 4083 cluster # 4083 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4083#0 length = 1124 sequences # 2

consensusID : consensus_4083#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1124
fasta sequence

                              [CTCCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGAATACTATATGAAGTACAATTGCATTACACCATAGTGATTGGCTAAAATCAGATTTTGGACACATATTTTTAATTTATTTTTAAATATCTTAACAACATATGATTAAACTATAAATCCGAAAAATGTGTATACGAAAACCAACTGGTTTAGGGTGCTTGTTGAGTGGTACTTATAGTCTATTTCAAATTTTTTCAAACGGTAGTTATTGGGATCAGACTTGAGATGATGTACTACGCTATTAATCCACGTTTGATTCCCGGATGACGCTGAAAGATTTGTGGCAATGTAAATAACCATGAATTTGGAATCTAATATCAATTGTGAAAATGTCATGTATATGGTTCTTAGTTGCTTAATAAATTTCTCAAAACTCGTAATTAGTTCCCTAATCTTAATATCAAATTGTATTTACTGAAAGAACTTTTTCATATTGCTTCCAGATTATCTATCCTGTTGATCTTTAGTATATGACCTTAAAAAGAAATTCTTCAAATCAATTATTATCTAAGAGAGAAAGAGAATTTCTTTAATGAAGGTCAGGTGAAAATTGGTAACTTTGGATGAATAGAAGAAAAATTCTTGTTTTTATCTGTAGTTTGGTCAACGAATAATATTGTAGTTTAAAGGCCTATCTCTATCACTCAGTTTGGCTTTGGTGTGATGTATCTTCATTTAATCGTCAATGTCAACTGTACTTTACTTATAAGTGTTACGTTCTCCATTCAATTACCGTAGAATATGATATACGACTAACAGCACTGGAATGTGTAGAACCCTAAAGTCCCAAACGAGAAGAGAGAAGAAACAGGGAAGGGGATTATTAGGTAAGAATCAGACATGTACAGAAAAATATGAGTATTTATAGTCATTAGCGTTAGCTATATCATCATTATAATTCAGCCAATCCTCAAGGGGGCAAATTATTCTACCGTCCAATCGTCGAATGCTATGTTGATATTCTAGAAAGCTCTATCTTGTTCTGATTGAGTGAAATCCCTTCCAACTTTTTAGAGCCTCTGGAGGCTTCGTTGTGTTTTTCGAAGCCATCCTAACAATTAGCAGTTTTTTTATTGTTCATAAATATATATTTAGATGCA]

[+] EMBL CD079729             [CTCCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGAATACTATATGAAGTACAATTGCATTACACCATAGTGATTGGCTAAAATCAGATTTTGGACACATATTTTTAATTTATTTTTAAATATCTTAACAACATATGATTAAACTATAAATCCGAAAAATGTGTATACGAAAACCAACTGGTTTAGGGTGCTTGTTGAGTGGTACTTATAGTCTATTTCAAATTTTTTCAAACGGTAGTTATTGGGATCAGACTTGAGATGATGTACTACGCTATTAATCCACGTTTGATTCCCGGATGACGCTGAAAGATTTGTGGCAATGTAAATAACCATGAATTTGGAATCTAATATCAATTGTGAAAATGTCATGTATATGGTTCTTAGTTGCTTAATAAATTTCTCAAAACTCGTAATTAGTTCCCTAATCTTAATATCAAATTGTATTTACTGAAAGAACTTTTTCATATTGCTTCCAGATTATCTATCCTGTTGATCTTTAGTATATGACCTTAAAAAGAAATTCTTCAAATCAATTATTATCTAAGAGAGAAAGAGAATTTCTTTAATGAAGGTCAGGTGAAAATTGGTAACTTTGGATGAATAGAAGAAAAATTCTTGTTTTTATCTGTAGTTTGGTCAACGAATAATATTGTAGTTTAAAGGCCTATCTCTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD073986             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTATTATCTAAGAGAGAAAGAGAATTTCTTTAATGAAGGTCAGGTGAAAATTGGTAACTTTGGATGAATAGAAGAAAAATTCTTGTTTTTATCTGTAGTTTGGTCAACGAATAATATTGTAGTTTAAAGGCCTATCTCTATCACTCAGTTTGGCTTTGGTGTGATGTATCTTCATTTAATCGTCAATGTCAACTGTACTTTACTTATAAGTGTTACGTTCTCCATTCAATTACCGTAGAATATGATATACGACTAACAGCACTGGAATGTGTAGAACCCTAAAGTCCCAAACGAGAAGAGAGAAGAAACAGGGAAGGGGATTATTAGGTAAGAATCAGACATGTACAGAAAAATATGAGTATTTATAGTCATTAGCGTTAGCTATATCATCATTATAATTCAGCCAATCCTCAAGGGGGCAAATTATTCTACCGTCCAATCGTCGAATGCTATGTTGATATTCTAGAAAGCTCTATCTTGTTCTGATTGAGTGAAATCCCTTCCAACTTTTTAGAGCCTCTGGAGGCTTCGTTGTGTTTTTCGAAGCCATCCTAACAATTAGCAGTTTTTTTATTGTTCATAAATATATATTTAGATGCA]




>consensus_4083#0
CTCCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGAATACTATATGAAGTACAATTGCATTACACCATA
GTGATTGGCTAAAATCAGATTTTGGACACATATTTTTAATTTATTTTTAAATATCTTAAC
AACATATGATTAAACTATAAATCCGAAAAATGTGTATACGAAAACCAACTGGTTTAGGGT
GCTTGTTGAGTGGTACTTATAGTCTATTTCAAATTTTTTCAAACGGTAGTTATTGGGATC
AGACTTGAGATGATGTACTACGCTATTAATCCACGTTTGATTCCCGGATGACGCTGAAAG
ATTTGTGGCAATGTAAATAACCATGAATTTGGAATCTAATATCAATTGTGAAAATGTCAT
GTATATGGTTCTTAGTTGCTTAATAAATTTCTCAAAACTCGTAATTAGTTCCCTAATCTT
AATATCAAATTGTATTTACTGAAAGAACTTTTTCATATTGCTTCCAGATTATCTATCCTG
TTGATCTTTAGTATATGACCTTAAAAAGAAATTCTTCAAATCAATTATTATCTAAGAGAG
AAAGAGAATTTCTTTAATGAAGGTCAGGTGAAAATTGGTAACTTTGGATGAATAGAAGAA
AAATTCTTGTTTTTATCTGTAGTTTGGTCAACGAATAATATTGTAGTTTAAAGGCCTATC
TCTATCACTCAGTTTGGCTTTGGTGTGATGTATCTTCATTTAATCGTCAATGTCAACTGT
ACTTTACTTATAAGTGTTACGTTCTCCATTCAATTACCGTAGAATATGATATACGACTAA
CAGCACTGGAATGTGTAGAACCCTAAAGTCCCAAACGAGAAGAGAGAAGAAACAGGGAAG
GGGATTATTAGGTAAGAATCAGACATGTACAGAAAAATATGAGTATTTATAGTCATTAGC
GTTAGCTATATCATCATTATAATTCAGCCAATCCTCAAGGGGGCAAATTATTCTACCGTC
CAATCGTCGAATGCTATGTTGATATTCTAGAAAGCTCTATCTTGTTCTGATTGAGTGAAA
TCCCTTCCAACTTTTTAGAGCCTCTGGAGGCTTCGTTGTGTTTTTCGAAGCCATCCTAAC
AATTAGCAGTTTTTTTATTGTTCATAAATATATATTTAGATGCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case