cluster # 4121

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 4121 cluster # 4121 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4121#0 length = 595 sequences # 3

consensusID : consensus_4121#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 595
fasta sequence

                              [AATTTTTTCGCACGCTTTCTGGAAGGTCGTTAAAATTTGCTTCTTAGACGGCTATTTACATATATCCTGGATGCTAAATGACTGAAAGATCATTTCAGTCACTGATTAGTGGTATTTCCCTGCACGACGAAGCTGCACTCAATAACATTTCTCTAAAAGCCGCTCTTGACAATCAAAATTTTGATCTAAATGGCCAGAGTCATGATGATGGATTATCTGTTCCTGGGAAAGGAGTTAATATTGTTTCTAAGCCCAGGATGCTTTCTTCTGGAATACCTGCTAGTTCCGGTTGTGGGACACTTAATATGGCTCCTGTTCCTATAGGTGCTCTTGCTCCGGGTAAAATTGGTCTCCCACTCAGTGATTTGGGGAATATTCCTATTTTTAACACTGGAGACTCCGGTCCTCTAGAACTACAAGCTTTGCAAGGTGGTGCACAAGCACTTCAAGGCGTTCAAACCGCTAAGCTGACGTTTATAAACTGTGGAGATCAGCANACTATTCTTCTCACTACTCCTTCTACGCATNTCACTATGCCTGATCAAAGCTNGGATGGCATGACTCTCACCCTGCCTGATAACTTATTAGCTACCGA]

[+] EMBL CD147609             [AATTTTTTCGCACGCTTTCTGGAAGGTCGTTAAAATTTGCTTCTTAGACGGCTATTTACATATATCCTGGATGCTAAATGACTGAAAGATCATTTCAGTCACTGATTAGTGGTATTTCCCTGCACGACGAAGCTGCACTCAATAACATTTCTCTAAAAGCCGCTCTTGACAATCAAAATTTTGATCTAAATGGCCAGAGTCATGATGATGGATTATCTGTTCCTGGGAAAGGAGTTAATATTGTTTCTAAGCCCAGGATGCTTTCTTCTGGAATACCTGCTAGTTCCGGTTGTGGGACACTTAATATGGCTCCTGTTCCTATAGGTGCTCTTGCTCCGGGTAAAATTGGTCTCCCACTCAGTGATTTGGGGAATATTCCTATTTTTAACACTGGAGACTCCGG                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD147538             [AATTTTTTCGCACGCTTTCTGGAAGGTCGTTAAAATTTGCTTCTTAGACGGCTATTTACATATATCCTGGATGCTAAATGACTGAAAGATCATTTCAGTCACTGATTAGTGGTATTTCCCTGCACGACGAAGCTGCGCTCAATAACATTTCTCTAAGAGCCGCTCTTGACAATCAAAATTTTGATCTAAATGGCCAGAGTCCTGATTATTGATTATCTGTTCCTGGGAAAGGAGTTAATATTGTTTCTAAGCCCAGGATGCTTTCTTCTGGAATACCTGCTAGTTCCGGTTGTGGGACACTTAATATGGCTCCTGTTCCTATAGGTGCTCTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI975665             [                                                                                                                   TTCCCTGCACGACGAAGCTGCACTCAATAACATTTCTCTAAAAGCCGCTCTTGACAATCAAAATTTTGATCTAAATGGCCAGAGTCATGATGATGGATTATCTGTTCCTGGGAAAGGAGTTAATATTGTTTCTAAGCCCAGGATGCTTTCTTCTGGAATACCTGCTAGTTCCGGTTGTGGGACACTTAATATGGCTCCTGTTCCTATAGGTGCTCTTGCTCCGGGTAAAATTGGTCTCCCACTCAGTGATTTGGAGAATATTCCTATTTTTAACACTGGAGACTGCGGTCCTCTAGAACTACAAGCTTTGCAAGGTGGTGCACAAGCACTTCAAGGCGTTCAAACCGCTAAGCTGACGTTTATAAACTGTGGAGATCAGCANACTATTCTTCTCACTACTCCTTCTACGCATNTCACTATGCCTGATCAAAGCTNGGATGGCATGACTCTCACCCTGCCTGATAACTTATTAGCTACCGA]




>consensus_4121#0
AATTTTTTCGCACGCTTTCTGGAAGGTCGTTAAAATTTGCTTCTTAGACGGCTATTTACA
TATATCCTGGATGCTAAATGACTGAAAGATCATTTCAGTCACTGATTAGTGGTATTTCCC
TGCACGACGAAGCTGCACTCAATAACATTTCTCTAAAAGCCGCTCTTGACAATCAAAATT
TTGATCTAAATGGCCAGAGTCATGATGATGGATTATCTGTTCCTGGGAAAGGAGTTAATA
TTGTTTCTAAGCCCAGGATGCTTTCTTCTGGAATACCTGCTAGTTCCGGTTGTGGGACAC
TTAATATGGCTCCTGTTCCTATAGGTGCTCTTGCTCCGGGTAAAATTGGTCTCCCACTCA
GTGATTTGGGGAATATTCCTATTTTTAACACTGGAGACTCCGGTCCTCTAGAACTACAAG
CTTTGCAAGGTGGTGCACAAGCACTTCAAGGCGTTCAAACCGCTAAGCTGACGTTTATAA
ACTGTGGAGATCAGCANACTATTCTTCTCACTACTCCTTCTACGCATNTCACTATGCCTG
ATCAAAGCTNGGATGGCATGACTCTCACCCTGCCTGATAACTTATTAGCTACCGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case