cluster # 4135

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Schistosoma mansoni
cluster # 4135 cluster # 4135 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4135#0 length = 756 sequences # 3

consensusID : consensus_4135#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 756
fasta sequence

                              [AAAATANAACTATTTCTTATAAAGATTAAGCTAGTTTCAGTTATTCTTACTTCAAAACAAAACAAGACAACAAGATGTATTCTTCTTTCTCCCTCCCTTTTTTATATGTGCAAATGTATGCACATTATGTAATGTGTTCCCAGTCAACCCCTATCTTCTCCTCTTATATCTTTTCGACTTGAATAACTATGAGATTACAAGGGGAAAGATGCATTTTTAAGTTTCTCATTATTTATTCCTCCGTTGTGTTTTAATTTATCAGTGAAGTTTAAATGTGATTTCTTTTAATGATCATTTCCTAATGTTCAAAATTTTTTTCAAAAAAATAAGGCATTCACTTTCTATATTTTTTAATTTACTGCTATCCTTAGTCTGCCAAGTTTCCAAGACAAATCGAAATGTATAAACTTTTCTTTATAATATTTATATATCGATCCCCCAGACAATTTATTGCCAATCGAAAATTCAAACTAATTCAGATGGATAAGTAAAGAGAATGTGTTAATCTGTATTAGCTTAATTGGATTATATTGTTTTCGAATATTTGATATTTCTGCTCATCCTTACCTGTATTTCATGTTTTTATGTACTACTACTGCTGAGATTTTATTTTTTAGACAAATATATACATATACTTATCCATGTGTGTACATCAGATTGTTTTTTTTAAAATTTGGTCAATATTACCAGTTTTCCATTTATTAATTGCCCTTCCAAACTTTCCTAACCAAACCCCTCAACATATAATGATACAAA]

[-] EMBL CD132946             [AAAATANAACTATTTCTTATAAAGATTAAGCTAGTTTCAGTTATTCTTACTTCAAAACAAAACAAGACAACAAGATGTATTCTTCTTTCTCCCTCCCTTTTTTATATGTGCAAATGTATGCACATTATGTAATGTGTTCCCAGTCAACCCCTATCTTCTCCTCTTATATCTTTTCGACTTGAATAACTATGAGATTACAAGGGGAAAGATGCATTTTTAAGTTTCTCATTATTTATTCCTCCGTTGTGTTTTAATTTATCAGTGAAGTTTAAATGTGATTTCTTTTAATGATCATTTCCTAATGTTCAAAATTTTTTTCAAAAAAATAAGGCATTCACTTTCTATATTTTTTAATTTACTGCTATCCTTAGTCTGCCAAGTTTCCAAGACAAATCGAAATGTATAAACTTTTCTTTATAATATTTATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD133261             [                                                                                                                            TTATGTAATGTGTTCCCAGTCAACCCCTATCTTCTCCTCTTATATCTTTTCGACTGGAATAACTATGAGATTACAAGGGGAAAGATGCATTTTTAAGTTTCTCATTATTTATTCCTCCGTGGTGTTTTAATTTATCAGGGAAGTTTAAATGTGATTCCTTTTAATGATCATTTCCTAATGTTCAAAATTTTTTTCAAAAAAATAAGGCATTCACTTTCTATATTTTTTAATTTACTGCTATCCTTAGTCTGCCAAGTTTCCAAGACAAATCGAAATGTATAAACTTTTCTTTATAATATTTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI977291             [                                                                                                                                                                               GACTTGAATAACTATGAGATTACAAGGGGAAAGATGCATTTTTAAGTTTCTCATTATTTATTCCTCCGTTGTGTTTTAATTTATCAGTGAAGTTTAAATGTGATTTCTTTTAATGATCATTTCCTAATGTTCAAAATTTTTTTCAAAAAAATAAGGCATTCACTTTCTATATTTTTTAATTTACTGCTATCCTTAGTCTGCCAAGTTTCCAAGACAAATCGAAATGTATAAACTTTTCTTTATAATATTTATATATCGATCCCCCAGACAATTTATTGCCAATCGAAAATTCAAACTAATTCAGATGGATAAGTAAAGAGAATGTGTTAATCTGTATTAGCTTAATTGGATTATATTGTTTTCGAATATTTGATATTTCTGCTCATCCTTACCTGTATTTCATGTTTTTATGTACTACTACTGCTGAGATTTTATTTTTTAGACAAATATATACATATACTTATCCATGTGTGTACATCAGATTGTTTTTTTTAAAATTTGGTCAATATTACCAGTTTTCCATTTATTAATTGCCCTTCCAAACTTTCCTAACCAAACCCCTCAACATATAATGATACAAA]




>consensus_4135#0
AAAATANAACTATTTCTTATAAAGATTAAGCTAGTTTCAGTTATTCTTACTTCAAAACAA
AACAAGACAACAAGATGTATTCTTCTTTCTCCCTCCCTTTTTTATATGTGCAAATGTATG
CACATTATGTAATGTGTTCCCAGTCAACCCCTATCTTCTCCTCTTATATCTTTTCGACTT
GAATAACTATGAGATTACAAGGGGAAAGATGCATTTTTAAGTTTCTCATTATTTATTCCT
CCGTTGTGTTTTAATTTATCAGTGAAGTTTAAATGTGATTTCTTTTAATGATCATTTCCT
AATGTTCAAAATTTTTTTCAAAAAAATAAGGCATTCACTTTCTATATTTTTTAATTTACT
GCTATCCTTAGTCTGCCAAGTTTCCAAGACAAATCGAAATGTATAAACTTTTCTTTATAA
TATTTATATATCGATCCCCCAGACAATTTATTGCCAATCGAAAATTCAAACTAATTCAGA
TGGATAAGTAAAGAGAATGTGTTAATCTGTATTAGCTTAATTGGATTATATTGTTTTCGA
ATATTTGATATTTCTGCTCATCCTTACCTGTATTTCATGTTTTTATGTACTACTACTGCT
GAGATTTTATTTTTTAGACAAATATATACATATACTTATCCATGTGTGTACATCAGATTG
TTTTTTTTAAAATTTGGTCAATATTACCAGTTTTCCATTTATTAATTGCCCTTCCAAACT
TTCCTAACCAAACCCCTCAACATATAATGATACAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case