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Schistosoma mansoni
cluster # 414 cluster # 414       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_414#0 length = 1025 sequences # 2  

consensusID : consensus_414#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1025
fasta sequence
                              [ATATAACTGTTGATGGTTTCATGTCATGGATGTTTCGTCGAATTACATTCATCCTACCTTTCCTATTTGTAGTATATGGTTTTGAACTATACATGGCTTATAATCTTTACGTGATATCCCAACAGAGCTATTGTCACGAATGGCAGGTACCTGCTGTATCGATCATTTATTTCATACTAGCAATGGGCAGTATTGTGACAGTGTTACAAGTGATACGTCAAAAGATTTGTACACCACCACCTATTGTACTTCATGATCATTTAACGAAAAAGTATAGTTTTGCTGTACCAAATGAAAAAATTAATGCTTGTGACGAATTCGATGATAATGATGATACAACAACAGAAAAAGTCATCACATAATTATCGTGTATACATACTTGCTGAATTGAATTCTTGTGTATCATTTATTATTAAAATATTTCCCTTCTGTTTTGTAAAGAAAATAAAATCAAATCATTTATAGATGATCTATTTTCCAATAAAAAAAGGTGTCTGTGTTGATTTCTATAATTCCTGTATGTGTTTTCAGTATATACTATTGAAAATATATGATATACACATTTCTGTCGACTCCTCGATTTCTTCTGTTTGCATACTTTGTATATAGTCTTGTGTATATGATGATCATCCCTTCTTTTGCTTCACAAGCTAATTTTGTAGTTGACTATCATTGAAAAAAAATTTCCTTATCTACTCATCAACCATCTTTATATTTGGTCTAGATAAATAAGTCATTGAACATTTTATTACCTTCACTACTTGTTTGTTCAGGTAGATTATAATATTTTATTCTCAAAGATATCATACTTCTATGAGTTTGGTGATCACCTTATTGTGCTAACGAAGTGAGGTAACTTGGACCGATGCATATATGTGCCCGTTCCTACGTTGTAGCTGACTGGCTGAAATATGCTTGGTTACTATGTGTTTTCCTCTTTCTCCTAATTGATTGTATAAATTATTATTGTACATGTTGTTTAGCTTGTATATTTCTAACAAAGTGTTGTTTTTTAAAGTCCATAT]

[-] EMBL CD077143             [ATATAACTGTTGATGGTTTCATGTCATGGATGTTTCGTCGAATTACATTCATCCTACCTTTCCTATTTGTAGTATATGGTTTTGAACTATACATGGCTTATAATCTTTACGTGATATCCCAACAGAGCTATTGTCACGAATGGCAGGTACCTGCTGTATCGATCATTTATTTCATACTAGCAATGGGCAGTATTGTGACAGTGTTACAAGTGATACGTCAAAAGATTTGTACACCACCACCTATTGTACTTCATGATCATTTAACGAAAAAGTATAGTTTTGCTGTACCAAATGAAAAAATTAATGCTTGTGACGAATTCGATGATAATGATGATACAACAACAGAAAAAGTCATCACATAATTATCGTGTATACATACTTGCTGAATTGAATTCTTGTGTATCATTTATTATTAAAATATTTCCCTTCTGTTTTGTAAAGAAAATAAAATCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD080578             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGTATACATACTTGCTGAATTGAATTCTTGTGTATCATTTATTATTAAAATATTTCCCTTCTGTTTTGTAAAGAAAATAAAATCAAATCATTTATAGATGATCTATTTTCCAATAAAAAAAGGTGTCTGTGTTGATTTCTATAATTCCTGTATGTGTTTTCAGTATATACTATTGAAAATATATGATATACACATTTCTGTCGACTCCTCGATTTCTTCTGTTTGCATACTTTGTATATAGTCTTGTGTATATGATGATCATCCCTTCTTTTGCTTCACAAGCTAATTTTGTAGTTGACTATCATTGAAAAAAAATTTCCTTATCTACTCATCAACCATCTTTATATTTGGTCTAGATAAATAAGTCATTGAACATTTTATTACCTTCACTACTTGTTTGTTCAGGTAGATTATAATATTTTATTCTCAAAGATATCATACTTCTATGAGTTTGGTGATCACCTTATTGTGCTAACGAAGTGAGGTAACTTGGACCGATGCATATATGTGCCCGTTCCTACGTTGTAGCTGACTGGCTGAAATATGCTTGGTTACTATGTGTTTTCCTCTTTCTCCTAATTGATTGTATAAATTATTATTGTACATGTTGTTTAGCTTGTATATTTCTAACAAAGTGTTGTTTTTTAAAGTCCATAT]


>consensus_414#0 ATATAACTGTTGATGGTTTCATGTCATGGATGTTTCGTCGAATTACATTCATCCTACCTT TCCTATTTGTAGTATATGGTTTTGAACTATACATGGCTTATAATCTTTACGTGATATCCC AACAGAGCTATTGTCACGAATGGCAGGTACCTGCTGTATCGATCATTTATTTCATACTAG CAATGGGCAGTATTGTGACAGTGTTACAAGTGATACGTCAAAAGATTTGTACACCACCAC CTATTGTACTTCATGATCATTTAACGAAAAAGTATAGTTTTGCTGTACCAAATGAAAAAA TTAATGCTTGTGACGAATTCGATGATAATGATGATACAACAACAGAAAAAGTCATCACAT AATTATCGTGTATACATACTTGCTGAATTGAATTCTTGTGTATCATTTATTATTAAAATA TTTCCCTTCTGTTTTGTAAAGAAAATAAAATCAAATCATTTATAGATGATCTATTTTCCA ATAAAAAAAGGTGTCTGTGTTGATTTCTATAATTCCTGTATGTGTTTTCAGTATATACTA TTGAAAATATATGATATACACATTTCTGTCGACTCCTCGATTTCTTCTGTTTGCATACTT TGTATATAGTCTTGTGTATATGATGATCATCCCTTCTTTTGCTTCACAAGCTAATTTTGT AGTTGACTATCATTGAAAAAAAATTTCCTTATCTACTCATCAACCATCTTTATATTTGGT CTAGATAAATAAGTCATTGAACATTTTATTACCTTCACTACTTGTTTGTTCAGGTAGATT ATAATATTTTATTCTCAAAGATATCATACTTCTATGAGTTTGGTGATCACCTTATTGTGC TAACGAAGTGAGGTAACTTGGACCGATGCATATATGTGCCCGTTCCTACGTTGTAGCTGA CTGGCTGAAATATGCTTGGTTACTATGTGTTTTCCTCTTTCTCCTAATTGATTGTATAAA TTATTATTGTACATGTTGTTTAGCTTGTATATTTCTAACAAAGTGTTGTTTTTTAAAGTC CATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)