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Schistosoma mansoni
cluster # 4170 cluster # 4170       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4170#0 length = 853 sequences # 3  

consensusID : consensus_4170#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 853
fasta sequence
                              [TGATGAGAATAAAATTGTAATTATTTGTACGGATTCGTATATACCACCGAACACATCCACTGCCACAGTTGTGGTAAAAATTGATGATCAAAATGATCGCATTCCAGAAATTCATGTTTCTACATTAAGTTTGACAGCGGCCAACATTTACAATACAGATAATTTTCAGCAACGACAACCGAAAGATTATATACCAGTACAACCATGGTCAATGAAAAAGTTAACTTATTTATTAAAAACTGAACAAGACAAGCACAAAGTATATAATTCACCTATATTTTTAGCATTCTTAGCTAATATTTCTGTATATACTGTATATATACCTGAAAATAGACCATCATCTACTTTAATTGCTCATTTAAATGCTACTGATAATGATTCCGGTGAAAATGGTCGTGTTACATTTGAAATGATTGAGTCATATTCATTTAATAATTTATTTTCAAAACTAAGCTACTCACCACAATTTCAACATATTCTACTAAATCAACAAACTTATAATAATAATAATAATAATCATATGAATGATGATGTAATTGAAATACATAGTAAACAAGAAGCATTTGATTTATTTCAAATAAATGCAACTCATGGTGATTTAACAACTCGTCAATTAATTGATCGTGAAGAAAATGGAATAATAACAAATGAAGTATTCATTTTGATTAAAGCTACAGATCATGGCATTTCACATCAATTACATTCATTCGCTTTAATTCAAGTAATTATCCTAGATGAAAATGATAATCCTCCAAGAATTATCAGCACAGGACCTACATTTAACATTGAAGAAAATCAACCAACTGGTACTAAAATAGGTGAAATCGCAGTGATTGATCCTGATATATTTTCA]

[+] EMBL CD202446             [TGATGAGAATAAAATTGTAATTATTTGTACGGATTCGTATATACCACCGAACACATCCACTGCCACAGTTGTGGTAAAAATTGATGATCAAAATGATCGCATTCCAGAAATTCATGTTTCTACATTAAGTTTGACAGCGGCCAACATTTACAATACAGATAATTTTCAGCAACGACAACCGAAAGATTATATACCAGTACAACCATGGTCAATGAAAAAGTTAACTTATTTATTAAAAACTGAACAAGACAAGCACAAAGTATATAATTCACCTATATTTTTAGCATTCTTAGCTAATATTTCTGTATATACTGTATATATACCTGAAAATAGACCATCATCTACTTTAATTGCTCATTTAAATGCTACTGATAATGATTCCGGTGAAAATGGTCGTGTTACATTTGAAATGATTGAGTCATATTCATTTAATAATTTATTTTCAAAACTAAGCTACTCACCACAATTTCAACATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD197190             [                                                                                                                                                                      CAGCAACGACAACCGAAAGATTATATACCAGTACAACCATGGTCAATGAAAAAGTTAACTTATTTATTAGAAACTGAACAAGACAAGCACAAAGTATATAATTCACCTATATTTTTAGCATTCTTAGCTAATATTTCTGTATATACTGTATATATACCTGAAAATAGACCATCATCTACTTTAATTGCTCATTTAAATGCTACTGATAATGATTCCGGTGAAAATGGTCGTGTTACATTTGAAATGATTGAGTCATATTCATTTAATAATTTATTTTCAAAACTAAGCTACTCACCACAATTTCAACATATTCTACTAAATCAACAAACTTATAATAATAATAATAATAATCATATGAATGATGATGTAATTGAAATACATAGTAAACAAGAAGCATTTGATTTATTTCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD132850             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATATTCTACTAAATCAACAAACTTATAATAATAATAATAATAATCATATGAATGATGATGTAATTGAAATACATAGTAAACAAGAAGCATTTGATTTATTTCAAATAAATGCAACTCATGGTGATTTAACAACTCGTCAATTAATTGATCGTGAAGAAAATGGAATAATAACAAATGAAGTATTCATTTTGATTAAAGCTACAGATCATGGCATTTCACATCAATTACATTCATTCGCTTTAATTCAAGTAATTATCCTAGATGAAAATGATAATCCTCCAAGAATTATCAGCACAGGACCTACATTTAACATTGAAGAAAATCAACCAACTGGTACTAAAATAGGTGAAATCGCAGTGATTGATCCTGATATATTTTCA]


>consensus_4170#0 TGATGAGAATAAAATTGTAATTATTTGTACGGATTCGTATATACCACCGAACACATCCAC TGCCACAGTTGTGGTAAAAATTGATGATCAAAATGATCGCATTCCAGAAATTCATGTTTC TACATTAAGTTTGACAGCGGCCAACATTTACAATACAGATAATTTTCAGCAACGACAACC GAAAGATTATATACCAGTACAACCATGGTCAATGAAAAAGTTAACTTATTTATTAAAAAC TGAACAAGACAAGCACAAAGTATATAATTCACCTATATTTTTAGCATTCTTAGCTAATAT TTCTGTATATACTGTATATATACCTGAAAATAGACCATCATCTACTTTAATTGCTCATTT AAATGCTACTGATAATGATTCCGGTGAAAATGGTCGTGTTACATTTGAAATGATTGAGTC ATATTCATTTAATAATTTATTTTCAAAACTAAGCTACTCACCACAATTTCAACATATTCT ACTAAATCAACAAACTTATAATAATAATAATAATAATCATATGAATGATGATGTAATTGA AATACATAGTAAACAAGAAGCATTTGATTTATTTCAAATAAATGCAACTCATGGTGATTT AACAACTCGTCAATTAATTGATCGTGAAGAAAATGGAATAATAACAAATGAAGTATTCAT TTTGATTAAAGCTACAGATCATGGCATTTCACATCAATTACATTCATTCGCTTTAATTCA AGTAATTATCCTAGATGAAAATGATAATCCTCCAAGAATTATCAGCACAGGACCTACATT TAACATTGAAGAAAATCAACCAACTGGTACTAAAATAGGTGAAATCGCAGTGATTGATCC TGATATATTTTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)